MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 plasmid pLM5578

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013767	CA	3	6	364	369	50 %	0 %	0 %	50 %	284803267
2	NC_013767	TA	4	8	2618	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	284803268
3	NC_013767	AT	3	6	2889	2894	50 %	50 %	0 %	0 %	284803268
4	NC_013767	TC	3	6	3963	3968	0 %	50 %	0 %	50 %	284803269
5	NC_013767	CT	3	6	5448	5453	0 %	50 %	0 %	50 %	284803269
6	NC_013767	TA	3	6	5512	5517	50 %	50 %	0 %	0 %	284803269
7	NC_013767	GT	3	6	5752	5757	0 %	50 %	50 %	0 %	284803269
8	NC_013767	GT	3	6	5818	5823	0 %	50 %	50 %	0 %	284803269
9	NC_013767	TC	3	6	7696	7701	0 %	50 %	0 %	50 %	284803272
10	NC_013767	GT	3	6	8459	8464	0 %	50 %	50 %	0 %	284803272
11	NC_013767	GA	3	6	8667	8672	50 %	0 %	50 %	0 %	284803272
12	NC_013767	CA	3	6	9628	9633	50 %	0 %	0 %	50 %	284803273
13	NC_013767	AC	3	6	10219	10224	50 %	0 %	0 %	50 %	284803274
14	NC_013767	GC	3	6	12061	12066	0 %	0 %	50 %	50 %	284803277
15	NC_013767	AT	3	6	13609	13614	50 %	50 %	0 %	0 %	284803278
16	NC_013767	TA	3	6	14851	14856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013767	AG	3	6	15171	15176	50 %	0 %	50 %	0 %	284803279
18	NC_013767	TA	3	6	15329	15334	50 %	50 %	0 %	0 %	284803279
19	NC_013767	AT	3	6	15350	15355	50 %	50 %	0 %	0 %	284803279
20	NC_013767	TA	3	6	15716	15721	50 %	50 %	0 %	0 %	284803279
21	NC_013767	AT	3	6	16143	16148	50 %	50 %	0 %	0 %	284803280
22	NC_013767	TA	3	6	16561	16566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013767	TA	3	6	16688	16693	50 %	50 %	0 %	0 %	284803281
24	NC_013767	TA	3	6	16910	16915	50 %	50 %	0 %	0 %	284803281
25	NC_013767	AG	3	6	16974	16979	50 %	0 %	50 %	0 %	284803281
26	NC_013767	AT	3	6	17333	17338	50 %	50 %	0 %	0 %	284803281
27	NC_013767	TA	3	6	17466	17471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013767	GA	3	6	17825	17830	50 %	0 %	50 %	0 %	284803282
29	NC_013767	AG	3	6	19268	19273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013767	AT	4	8	19407	19414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013767	AT	3	6	19493	19498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013767	TC	3	6	20008	20013	0 %	50 %	0 %	50 %	284803285
33	NC_013767	TA	3	6	20379	20384	50 %	50 %	0 %	0 %	284803285
34	NC_013767	TA	4	8	20767	20774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013767	TA	3	6	20799	20804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013767	TA	3	6	20807	20812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013767	TA	3	6	20852	20857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013767	AT	3	6	20954	20959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013767	TA	3	6	20977	20982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013767	TA	3	6	20993	20998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013767	GC	3	6	22003	22008	0 %	0 %	50 %	50 %	284803286
42	NC_013767	AG	4	8	23348	23355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013767	AT	3	6	23608	23613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013767	AG	3	6	23792	23797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013767	AG	3	6	24812	24817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013767	AG	3	6	25704	25709	50 %	0 %	50 %	0 %	284803289
47	NC_013767	GA	3	6	26842	26847	50 %	0 %	50 %	0 %	284803290
48	NC_013767	CA	3	6	27032	27037	50 %	0 %	0 %	50 %	284803291
49	NC_013767	AT	3	6	27111	27116	50 %	50 %	0 %	0 %	284803291
50	NC_013767	AT	3	6	27315	27320	50 %	50 %	0 %	0 %	284803291
51	NC_013767	AT	3	6	27532	27537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013767	AT	3	6	27589	27594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013767	CA	3	6	27836	27841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013767	TA	3	6	27844	27849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013767	AT	3	6	28460	28465	50 %	50 %	0 %	0 %	284803294
56	NC_013767	AT	3	6	28644	28649	50 %	50 %	0 %	0 %	284803294
57	NC_013767	CT	3	6	29734	29739	0 %	50 %	0 %	50 %	284803296
58	NC_013767	CA	3	6	29876	29881	50 %	0 %	0 %	50 %	284803296
59	NC_013767	GA	3	6	33347	33352	50 %	0 %	50 %	0 %	284803298
60	NC_013767	TA	3	6	33559	33564	50 %	50 %	0 %	0 %	284803298
61	NC_013767	CT	3	6	35305	35310	0 %	50 %	0 %	50 %	284803301
62	NC_013767	GA	3	6	35526	35531	50 %	0 %	50 %	0 %	284803301
63	NC_013767	TA	3	6	37378	37383	50 %	50 %	0 %	0 %	284803303
64	NC_013767	AT	3	6	38003	38008	50 %	50 %	0 %	0 %	284803303
65	NC_013767	AG	3	6	38204	38209	50 %	0 %	50 %	0 %	284803304
66	NC_013767	TA	3	6	38732	38737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013767	AT	3	6	40374	40379	50 %	50 %	0 %	0 %	284803308
68	NC_013767	TG	3	6	40495	40500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013767	GA	3	6	41383	41388	50 %	0 %	50 %	0 %	284803311
70	NC_013767	TA	3	6	43401	43406	50 %	50 %	0 %	0 %	284803314
71	NC_013767	AT	3	6	43970	43975	50 %	50 %	0 %	0 %	284803314
72	NC_013767	AT	3	6	44566	44571	50 %	50 %	0 %	0 %	284803314
73	NC_013767	TA	3	6	44705	44710	50 %	50 %	0 %	0 %	284803314
74	NC_013767	TA	3	6	45764	45769	50 %	50 %	0 %	0 %	284803315
75	NC_013767	TC	3	6	46869	46874	0 %	50 %	0 %	50 %	284803316
76	NC_013767	GA	3	6	46969	46974	50 %	0 %	50 %	0 %	284803316
77	NC_013767	CA	3	6	47853	47858	50 %	0 %	0 %	50 %	284803316
78	NC_013767	GA	3	6	48229	48234	50 %	0 %	50 %	0 %	284803316
79	NC_013767	AT	3	6	48460	48465	50 %	50 %	0 %	0 %	284803316
80	NC_013767	GA	3	6	48510	48515	50 %	0 %	50 %	0 %	284803316
81	NC_013767	TA	3	6	51268	51273	50 %	50 %	0 %	0 %	284803318
82	NC_013767	AT	3	6	51670	51675	50 %	50 %	0 %	0 %	284803319
83	NC_013767	TC	3	6	52284	52289	0 %	50 %	0 %	50 %	284803320
84	NC_013767	AT	3	6	54330	54335	50 %	50 %	0 %	0 %	284803321
85	NC_013767	GT	3	6	54569	54574	0 %	50 %	50 %	0 %	284803321
86	NC_013767	AG	4	8	55220	55227	50 %	0 %	50 %	0 %	284803322
87	NC_013767	GA	3	6	55888	55893	50 %	0 %	50 %	0 %	284803323
88	NC_013767	CG	3	6	57098	57103	0 %	0 %	50 %	50 %	284803324
89	NC_013767	CA	3	6	57593	57598	50 %	0 %	0 %	50 %	284803325
90	NC_013767	AT	3	6	57801	57806	50 %	50 %	0 %	0 %	284803326
91	NC_013767	GA	3	6	58694	58699	50 %	0 %	50 %	0 %	284803326
92	NC_013767	AC	3	6	58716	58721	50 %	0 %	0 %	50 %	284803326
93	NC_013767	AG	3	6	58728	58733	50 %	0 %	50 %	0 %	284803326
94	NC_013767	TA	3	6	58748	58753	50 %	50 %	0 %	0 %	284803326
95	NC_013767	GA	3	6	58891	58896	50 %	0 %	50 %	0 %	284803326
96	NC_013767	TG	3	6	60664	60669	0 %	50 %	50 %	0 %	284803329
97	NC_013767	AT	3	6	61424	61429	50 %	50 %	0 %	0 %	284803331
98	NC_013767	AT	3	6	62093	62098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013767	AT	3	6	63137	63142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013767	AG	4	8	63538	63545	50 %	0 %	50 %	0 %	284803333
101	NC_013767	AG	3	6	63922	63927	50 %	0 %	50 %	0 %	284803334
102	NC_013767	TA	3	6	63949	63954	50 %	50 %	0 %	0 %	284803334
103	NC_013767	AT	3	6	64243	64248	50 %	50 %	0 %	0 %	284803334
104	NC_013767	AC	3	6	65909	65914	50 %	0 %	0 %	50 %	284803336
105	NC_013767	AT	3	6	66567	66572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013767	GC	3	6	66743	66748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013767	AT	3	6	67270	67275	50 %	50 %	0 %	0 %	284803337
108	NC_013767	CA	3	6	67910	67915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013767	AT	3	6	68034	68039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013767	AG	3	6	68153	68158	50 %	0 %	50 %	0 %	284803338
111	NC_013767	TA	3	6	68365	68370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013767	GA	3	6	69016	69021	50 %	0 %	50 %	0 %	284803339
113	NC_013767	AG	3	6	70448	70453	50 %	0 %	50 %	0 %	284803340
114	NC_013767	AG	4	8	71591	71598	50 %	0 %	50 %	0 %	284803340
115	NC_013767	CT	3	6	71733	71738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013767	TA	3	6	71833	71838	50 %	50 %	0 %	0 %	284803341
117	NC_013767	TA	3	6	71980	71985	50 %	50 %	0 %	0 %	284803341
118	NC_013767	CT	3	6	72439	72444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013767	AG	3	6	72617	72622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013767	TA	3	6	72894	72899	50 %	50 %	0 %	0 %	284803342
121	NC_013767	AT	3	6	73048	73053	50 %	50 %	0 %	0 %	284803342
122	NC_013767	AT	3	6	73067	73072	50 %	50 %	0 %	0 %	284803342
123	NC_013767	AC	3	6	73168	73173	50 %	0 %	0 %	50 %	284803342
124	NC_013767	AT	3	6	73217	73222	50 %	50 %	0 %	0 %	284803342
125	NC_013767	TA	3	6	73260	73265	50 %	50 %	0 %	0 %	284803342
126	NC_013767	AT	4	8	74175	74182	50 %	50 %	0 %	0 %	284803342
127	NC_013767	TC	3	6	74612	74617	0 %	50 %	0 %	50 %	284803342
128	NC_013767	TA	3	6	74646	74651	50 %	50 %	0 %	0 %	284803342
129	NC_013767	AT	3	6	75157	75162	50 %	50 %	0 %	0 %	284803343
130	NC_013767	AT	3	6	75211	75216	50 %	50 %	0 %	0 %	284803343
131	NC_013767	AT	3	6	75359	75364	50 %	50 %	0 %	0 %	284803343
132	NC_013767	AT	3	6	76880	76885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013767	TA	3	6	76946	76951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.