MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013766	ATACTT	2	12	56767	56778	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013766	TTTTTA	2	12	57634	57645	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013766	ATTGAT	2	12	57717	57728	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013766	ATAAAA	2	12	127984	127995	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013766	GAAAGG	2	12	171867	171878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013766	GATTTA	2	12	198901	198912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013766	AAGAGG	2	12	220373	220384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013766	ATTTTT	2	12	258972	258983	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013766	ATTCAA	2	12	263859	263870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013766	AAGGAA	2	12	265430	265441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013766	TAGGCG	2	12	267334	267345	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013766	AGTCAA	2	12	269148	269159	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013766	TTTACC	2	12	269577	269588	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013766	TTATAT	2	12	283911	283922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013766	AACTTT	2	12	316878	316889	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013766	AATACA	2	12	325470	325481	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013766	CATAGA	2	12	367427	367438	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013766	ATGATA	2	12	405802	405813	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013766	AGTGCT	2	12	417444	417455	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013766	ACAAAA	2	12	481152	481163	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013766	TTAAAT	2	12	504671	504682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013766	CTATAA	2	12	506440	506451	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013766	TTAGGT	2	12	560635	560646	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013766	AGATTT	2	12	574408	574419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013766	ATCATT	2	12	643044	643055	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013766	TAAAAA	2	12	683021	683032	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013766	AAACAA	2	12	714299	714310	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013766	TATTTT	2	12	715508	715519	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013766	ATCATT	2	12	719038	719049	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013766	TATAGG	2	12	763528	763539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013766	TTACTT	2	12	888613	888624	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013766	TGAAAT	2	12	899748	899759	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013766	ATTTTA	2	12	904509	904520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013766	AAATAG	2	12	926392	926403	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013766	GTAATC	2	12	933195	933206	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013766	TTACAA	2	12	933213	933224	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013766	ATGAAA	2	12	941808	941819	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013766	TTGACT	2	12	1065069	1065080	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013766	AGGAAG	2	12	1075260	1075271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013766	CTTTTT	2	12	1134994	1135005	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013766	TTATGG	2	12	1184596	1184607	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013766	TTTAGT	2	12	1188592	1188603	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013766	TTTTAA	2	12	1222897	1222908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013766	CTTTTT	2	12	1260892	1260903	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013766	GAAAAA	2	12	1290869	1290880	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013766	TATTAA	2	12	1362093	1362104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013766	TATTAA	2	12	1512844	1512855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013766	TACCAA	2	12	1529258	1529269	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013766	ATAAAA	2	12	1547023	1547034	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013766	TTTCAT	2	12	1555417	1555428	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013766	CTCTTC	2	12	1659364	1659375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013766	GGTATA	2	12	1692618	1692629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013766	GGTTGT	2	12	1710014	1710025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013766	GGTTGT	2	12	1711475	1711486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013766	GAATAA	2	12	1713029	1713040	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013766	GTAAAC	2	12	1714180	1714191	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013766	ACAAAA	2	12	1722804	1722815	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013766	AAAATA	2	12	1727122	1727133	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013766	TAAAAA	2	12	1728032	1728043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013766	TAAAAA	2	12	1754777	1754788	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013766	ATGAAA	2	12	1774279	1774290	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013766	CGCCTA	2	12	1815067	1815078	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013766	TTTCCT	2	12	1816720	1816731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013766	TTGAAT	2	12	1818292	1818303	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013766	TGTAAT	2	12	1849230	1849241	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013766	TTTTGA	2	12	1865017	1865028	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013766	GTTCTT	2	12	1880158	1880169	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013766	TGTCAT	2	12	1884194	1884205	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013766	AAAAAC	2	12	1938546	1938557	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013766	CGCCTA	2	12	1968985	1968996	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013766	TTTCCT	2	12	1970638	1970649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013766	TTGAAT	2	12	1972208	1972219	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013766	GTTTTA	2	12	1980129	1980140	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013766	AAAAAG	2	12	2063313	2063324	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013766	CTCTAT	2	12	2081032	2081043	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013766	TCATTT	2	12	2082230	2082241	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013766	GTTTTC	2	12	2109399	2109410	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013766	CAAAAA	2	12	2127123	2127134	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_013766	GAAAAA	2	12	2130985	2130996	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013766	TCTTTT	2	12	2189127	2189138	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_013766	GAAGTT	2	12	2247515	2247526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013766	ATTCAA	2	12	2283080	2283091	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_013766	AAAAGA	2	12	2309540	2309551	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013766	TTATAT	2	12	2344545	2344556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013766	AATTTT	2	12	2397335	2397346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013766	AAATTG	2	12	2403510	2403521	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013766	CTCTGT	2	12	2410355	2410366	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013766	TAACGC	2	12	2508628	2508639	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013766	TAATAC	2	12	2533664	2533675	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013766	CGCCTA	2	12	2554462	2554473	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013766	TTTCCT	2	12	2556365	2556376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013766	TTGAAT	2	12	2557937	2557948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013766	TTCAAA	2	12	2639925	2639936	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013766	CTTTTT	2	12	2705151	2705162	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013766	ATCCCA	2	12	2725066	2725077	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013766	AAAAGA	2	12	2730897	2730908	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013766	TTTTTA	2	12	2736893	2736904	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013766	CGCCTA	2	12	2788424	2788435	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013766	TTTCCT	2	12	2790076	2790087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013766	TTGAAT	2	12	2791648	2791659	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013766	GTTTTC	2	12	2802331	2802342	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_013766	ACTCAA	2	12	2905062	2905073	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013766	ACAGCC	2	12	2943732	2943743	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013766	TTTTAT	2	12	2967911	2967922	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.