MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 1097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013766	TGCTCT	2	12	2127	2138	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	284800259
2	NC_013766	GAAGGA	2	12	3306	3317	50 %	0 %	50 %	0 %	284800261
3	NC_013766	TAAAAG	2	12	4174	4185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284800262
4	NC_013766	CAGAAA	2	12	9661	9672	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284800267
5	NC_013766	GGTTGT	2	12	14990	15001	0 %	50 %	50 %	0 %	284800271
6	NC_013766	GCATTC	2	12	19268	19279	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284800274
7	NC_013766	GTTGGT	2	12	27045	27056	0 %	50 %	50 %	0 %	284800281
8	NC_013766	CTTGTT	2	12	27491	27502	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	284800282
9	NC_013766	ATTTTA	2	12	29573	29584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800286
10	NC_013766	AATGCC	2	12	32170	32181	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284800288
11	NC_013766	ATTGAT	2	12	33001	33012	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284800288
12	NC_013766	TGTGTT	2	12	35010	35021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800291
13	NC_013766	GAATAT	2	12	38581	38592	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284800292
14	NC_013766	GAAACG	2	12	38723	38734	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284800292
15	NC_013766	CAAGGT	2	12	40718	40729	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284800293
16	NC_013766	GAAACA	2	12	42841	42852	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284800295
17	NC_013766	TTTTGG	2	12	44301	44312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800296
18	NC_013766	AATTTT	2	12	47267	47278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800299
19	NC_013766	CTAAAA	2	12	48655	48666	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	284800301
20	NC_013766	TGCAGA	2	12	54595	54606	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284800308
21	NC_013766	GAAAGC	2	12	67794	67805	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284800324
22	NC_013766	ATTGAA	2	12	67866	67877	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284800324
23	NC_013766	TGCTTT	2	12	70513	70524	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	284800327
24	NC_013766	AAGTGG	2	12	70959	70970	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	284800327
25	NC_013766	GAATTA	2	12	74465	74476	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284800330
26	NC_013766	TGTTTA	2	12	77151	77162	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	284800331
27	NC_013766	AAAGAT	2	12	80900	80911	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284800335
28	NC_013766	TTTATT	2	12	82023	82034	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284800336
29	NC_013766	AAAAAT	2	12	83142	83153	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	284800337
30	NC_013766	GTGCAT	2	12	89049	89060	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284800343
31	NC_013766	TTTTCT	2	12	91216	91227	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	284800343
32	NC_013766	AGAAAC	2	12	93606	93617	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284800346
33	NC_013766	ACAGAG	2	12	94390	94401	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284800347
34	NC_013766	CAAGAA	2	12	95077	95088	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284800347
35	NC_013766	TGCTTC	2	12	95326	95337	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	284800348
36	NC_013766	TTCAAT	2	12	97914	97925	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	284800351
37	NC_013766	AAGATA	2	12	104787	104798	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284800357
38	NC_013766	GGTTAT	2	12	105245	105256	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	284800357
39	NC_013766	TTCTAC	2	12	115588	115599	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	284800364
40	NC_013766	CCTGGT	2	12	117691	117702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800365
41	NC_013766	TCGCCA	2	12	130965	130976	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284800379
42	NC_013766	TGGAAG	2	12	134670	134681	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	284800381
43	NC_013766	TAGTTG	2	12	140051	140062	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	284800387
44	NC_013766	TAAAAA	2	12	140589	140600	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	284800388
45	NC_013766	AATGGC	2	12	141161	141172	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284800389
46	NC_013766	AGTGAC	2	12	142709	142720	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284800390
47	NC_013766	ATTTTC	2	12	143443	143454	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	284800392
48	NC_013766	AATTGG	2	12	144538	144549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800393
49	NC_013766	GATATG	2	12	149386	149397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800397
50	NC_013766	CCATGA	2	12	150596	150607	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284800398
51	NC_013766	TCTAAT	2	12	155194	155205	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	284800401
52	NC_013766	ACTGTT	2	12	159998	160009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284800406
53	NC_013766	AATGGT	2	12	160765	160776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800406
54	NC_013766	AAGCAG	2	12	161981	161992	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284800409
55	NC_013766	TGATGC	2	12	163938	163949	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284800410
56	NC_013766	CGATTT	2	12	167975	167986	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284800416
57	NC_013766	TCAAGA	2	12	172646	172657	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284800422
58	NC_013766	GTGTTA	2	12	173535	173546	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	284800423
59	NC_013766	ATTTTT	2	12	179237	179248	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284800426
60	NC_013766	ATTTTT	2	12	181224	181235	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284800428
61	NC_013766	GGTAAA	2	12	181546	181557	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284800428
62	NC_013766	TACAAG	2	12	182786	182797	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284800430
63	NC_013766	TTTGTA	2	12	184857	184868	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	284800432
64	NC_013766	GATGTG	2	12	187223	187234	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	284800433
65	NC_013766	ACGAAA	2	12	191407	191418	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284800435
66	NC_013766	GAAGAT	2	12	191694	191705	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284800436
67	NC_013766	TTATTT	2	12	196406	196417	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284800442
68	NC_013766	CGATTT	2	12	198090	198101	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284800445
69	NC_013766	GGTATG	2	12	201796	201807	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	284800448
70	NC_013766	TTGATA	2	12	202269	202280	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284800449
71	NC_013766	GCGAAA	2	12	211219	211230	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284800457
72	NC_013766	GCAAGA	2	12	212668	212679	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284800460
73	NC_013766	AGTTGA	2	12	212773	212784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800460
74	NC_013766	AAACAG	2	12	212850	212861	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284800460
75	NC_013766	AACGTG	2	12	213543	213554	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284800460
76	NC_013766	ATTTGA	2	12	214063	214074	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284800460
77	NC_013766	ACGAAA	2	12	221459	221470	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284800467
78	NC_013766	TAACGC	2	12	228168	228179	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284800474
79	NC_013766	GTCTTT	2	12	230938	230949	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	284800476
80	NC_013766	GTATTT	2	12	235014	235025	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	284800480
81	NC_013766	CAGTAA	2	12	236258	236269	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284800482
82	NC_013766	GTGAAA	2	12	237315	237326	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284800483
83	NC_013766	TGTTAC	2	12	237702	237713	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284800484
84	NC_013766	GTGCAA	2	12	239300	239311	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284800487
85	NC_013766	GTAAAG	2	12	240280	240291	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284800489
86	NC_013766	CAACAG	2	12	243039	243050	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	284800497
87	NC_013766	TAAAGG	2	12	243445	243456	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284800497
88	NC_013766	AAACAA	2	12	247933	247944	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	284800505
89	NC_013766	TACTCG	2	12	248094	248105	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284800506
90	NC_013766	TCGTGG	2	12	249284	249295	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	284800508
91	NC_013766	GAATAT	2	12	252074	252085	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284800511
92	NC_013766	TTTTTA	2	12	252356	252367	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284800511
93	NC_013766	ATTTTT	2	12	255236	255247	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	284800515
94	NC_013766	TAAGTA	2	12	258451	258462	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284800519
95	NC_013766	AAGTAC	2	12	262657	262668	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284800523
96	NC_013766	AAATGG	2	12	263495	263506	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284800523
97	NC_013766	AGTAAA	2	12	276834	276845	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284800530
98	NC_013766	AAAGGA	2	12	280073	280084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800533
99	NC_013766	ACAGTA	2	12	284240	284251	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284800539
100	NC_013766	AAAACA	2	12	284615	284626	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	284800540
101	NC_013766	GCATGG	2	12	284796	284807	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284800540
102	NC_013766	CTGTAG	2	12	287740	287751	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284800545
103	NC_013766	GACAAT	2	12	289558	289569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284800548
104	NC_013766	AAAGCG	2	12	290378	290389	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284800548
105	NC_013766	TAAAAA	2	12	291277	291288	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	284800549
106	NC_013766	TGAATC	2	12	292062	292073	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284800550
107	NC_013766	GCTACT	2	12	293754	293765	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284800551
108	NC_013766	TTCTGA	2	12	296828	296839	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284800553
109	NC_013766	AAGAAA	2	12	300044	300055	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	284800555
110	NC_013766	TACACT	2	12	304288	304299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800556
111	NC_013766	TTCGTG	2	12	305800	305811	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	284800556
112	NC_013766	CCAAAT	2	12	311789	311800	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	284800560
113	NC_013766	GAATTA	2	12	314397	314408	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284800562
114	NC_013766	CGAAAT	2	12	318697	318708	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284800566
115	NC_013766	TCTTTT	2	12	321660	321671	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	284800568
116	NC_013766	AGTTCA	2	12	323925	323936	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284800570
117	NC_013766	ATCAAT	2	12	324068	324079	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	284800570
118	NC_013766	ATGAAA	2	12	324426	324437	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284800571
119	NC_013766	CTTTTA	2	12	326299	326310	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	284800573
120	NC_013766	TAGAAA	2	12	327245	327256	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284800574
121	NC_013766	ACGTTG	2	12	329176	329187	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284800576
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223	NC_013766	AGAATG	2	12	620507	620518	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284800860
224	NC_013766	ACTTTT	2	12	622362	622373	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	284800861
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226	NC_013766	ATTTGT	4	24	622949	622972	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	284800862
227	NC_013766	ATAAAG	2	12	625225	625236	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284800863
228	NC_013766	ACTTGA	2	12	626636	626647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284800863
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345	NC_013766	GATAAT	2	12	980391	980402	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284801239
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