MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 2280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013766	ATATG	2	10	690	699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013766	TGAAG	2	10	1334	1343	40 %	20 %	40 %	0 %	284800258
3	NC_013766	AAACA	2	10	1790	1799	80 %	0 %	0 %	20 %	284800259
4	NC_013766	ATTAC	2	10	2113	2122	40 %	40 %	0 %	20 %	284800259
5	NC_013766	AAGAA	2	10	2299	2308	80 %	0 %	20 %	0 %	284800259
6	NC_013766	GGTTC	2	10	3000	3009	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013766	GTATG	2	10	4274	4283	20 %	40 %	40 %	0 %	284800262
8	NC_013766	CTTTA	2	10	5051	5060	20 %	60 %	0 %	20 %	284800263
9	NC_013766	GTGAA	2	10	6517	6526	40 %	20 %	40 %	0 %	284800264
10	NC_013766	ACTTA	2	10	7628	7637	40 %	40 %	0 %	20 %	284800265
11	NC_013766	AAATC	2	10	9711	9720	60 %	20 %	0 %	20 %	284800267
12	NC_013766	CGCTG	2	10	9995	10004	0 %	20 %	40 %	40 %	284800268
13	NC_013766	AAACA	2	10	12102	12111	80 %	0 %	0 %	20 %	284800270
14	NC_013766	TTTTA	2	10	12301	12310	20 %	80 %	0 %	0 %	284800270
15	NC_013766	TTGAA	2	10	12606	12615	40 %	40 %	20 %	0 %	284800270
16	NC_013766	GTTTT	2	10	18564	18573	0 %	80 %	20 %	0 %	284800274
17	NC_013766	TCAAA	2	10	26175	26184	60 %	20 %	0 %	20 %	284800280
18	NC_013766	AAAGA	2	10	27942	27951	80 %	0 %	20 %	0 %	284800283
19	NC_013766	AAGAC	2	10	29333	29342	60 %	0 %	20 %	20 %	284800286
20	NC_013766	GGTTA	2	10	30219	30228	20 %	40 %	40 %	0 %	284800286
21	NC_013766	AGAAC	2	10	30720	30729	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013766	TTTCT	2	10	31679	31688	0 %	80 %	0 %	20 %	284800287
23	NC_013766	GAACT	2	10	32315	32324	40 %	20 %	20 %	20 %	284800288
24	NC_013766	AATTT	2	10	33912	33921	40 %	60 %	0 %	0 %	284800289
25	NC_013766	GAATG	2	10	34647	34656	40 %	20 %	40 %	0 %	284800290
26	NC_013766	TGTAG	2	10	36445	36454	20 %	40 %	40 %	0 %	284800291
27	NC_013766	TTATT	2	10	36677	36686	20 %	80 %	0 %	0 %	284800291
28	NC_013766	TGAAA	2	10	40501	40510	60 %	20 %	20 %	0 %	284800293
29	NC_013766	AAAGT	2	10	41888	41897	60 %	20 %	20 %	0 %	284800294
30	NC_013766	TAAAT	2	10	43920	43929	60 %	40 %	0 %	0 %	284800295
31	NC_013766	ATACA	2	10	47699	47708	60 %	20 %	0 %	20 %	284800300
32	NC_013766	AAAAT	2	10	47990	47999	80 %	20 %	0 %	0 %	284800300
33	NC_013766	GCTAT	2	10	51639	51648	20 %	40 %	20 %	20 %	284800303
34	NC_013766	TCCAA	2	10	53299	53308	40 %	20 %	0 %	40 %	284800305
35	NC_013766	CCATT	2	10	60529	60538	20 %	40 %	0 %	40 %	284800315
36	NC_013766	CAAGC	2	10	62100	62109	40 %	0 %	20 %	40 %	284800317
37	NC_013766	AATCA	2	10	62285	62294	60 %	20 %	0 %	20 %	284800318
38	NC_013766	AAAGT	2	10	63631	63640	60 %	20 %	20 %	0 %	284800319
39	NC_013766	AAGAT	2	10	64171	64180	60 %	20 %	20 %	0 %	284800320
40	NC_013766	GTGCT	2	10	64288	64297	0 %	40 %	40 %	20 %	284800320
41	NC_013766	CCAAA	2	10	64723	64732	60 %	0 %	0 %	40 %	284800320
42	NC_013766	GATTT	2	10	65264	65273	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013766	ACGAA	2	10	65383	65392	60 %	0 %	20 %	20 %	284800322
44	NC_013766	TAGAA	2	10	66279	66288	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013766	AATAA	2	10	68553	68562	80 %	20 %	0 %	0 %	284800326
46	NC_013766	TGCTT	2	10	68678	68687	0 %	60 %	20 %	20 %	284800326
47	NC_013766	GAATC	2	10	74168	74177	40 %	20 %	20 %	20 %	284800330
48	NC_013766	ATTAT	2	10	74303	74312	40 %	60 %	0 %	0 %	284800330
49	NC_013766	GCATT	2	10	74980	74989	20 %	40 %	20 %	20 %	284800330
50	NC_013766	GCACC	2	10	75658	75667	20 %	0 %	20 %	60 %	284800330
51	NC_013766	TAAAA	2	10	82411	82420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013766	AGTTA	2	10	83910	83919	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013766	TATTT	2	10	84483	84492	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013766	GGCTT	2	10	84796	84805	0 %	40 %	40 %	20 %	284800340
55	NC_013766	CAAAA	2	10	87200	87209	80 %	0 %	0 %	20 %	284800341
56	NC_013766	GGGGC	2	10	87530	87539	0 %	0 %	80 %	20 %	284800342
57	NC_013766	AGGAA	2	10	87789	87798	60 %	0 %	40 %	0 %	284800342
58	NC_013766	TTGAT	2	10	88745	88754	20 %	60 %	20 %	0 %	284800342
59	NC_013766	ATTGG	2	10	88927	88936	20 %	40 %	40 %	0 %	284800342
60	NC_013766	AACGA	2	10	91030	91039	60 %	0 %	20 %	20 %	284800343
61	NC_013766	GCTAA	2	10	91843	91852	40 %	20 %	20 %	20 %	284800344
62	NC_013766	TTTTA	2	10	92738	92747	20 %	80 %	0 %	0 %	284800345
63	NC_013766	TTATC	2	10	92873	92882	20 %	60 %	0 %	20 %	284800345
64	NC_013766	TTTTA	2	10	93461	93470	20 %	80 %	0 %	0 %	284800345
65	NC_013766	GTGAA	2	10	94574	94583	40 %	20 %	40 %	0 %	284800347
66	NC_013766	TAAAT	2	10	95628	95637	60 %	40 %	0 %	0 %	284800349
67	NC_013766	ATTTC	2	10	96184	96193	20 %	60 %	0 %	20 %	284800349
68	NC_013766	GGAAT	2	10	96486	96495	40 %	20 %	40 %	0 %	284800350
69	NC_013766	TAATA	2	10	100270	100279	60 %	40 %	0 %	0 %	284800353
70	NC_013766	AAATA	2	10	105914	105923	80 %	20 %	0 %	0 %	284800357
71	NC_013766	AAAAC	2	10	107317	107326	80 %	0 %	0 %	20 %	284800358
72	NC_013766	CAAGG	2	10	107503	107512	40 %	0 %	40 %	20 %	284800358
73	NC_013766	AAATG	2	10	108840	108849	60 %	20 %	20 %	0 %	284800359
74	NC_013766	GCATC	2	10	110238	110247	20 %	20 %	20 %	40 %	284800360
75	NC_013766	TTGTT	2	10	112979	112988	0 %	80 %	20 %	0 %	284800362
76	NC_013766	ATTAA	2	10	113522	113531	60 %	40 %	0 %	0 %	284800362
77	NC_013766	GTAAA	2	10	114962	114971	60 %	20 %	20 %	0 %	284800363
78	NC_013766	TTCGG	2	10	116125	116134	0 %	40 %	40 %	20 %	284800364
79	NC_013766	CCAAA	2	10	117050	117059	60 %	0 %	0 %	40 %	284800364
80	NC_013766	CTAAA	2	10	118913	118922	60 %	20 %	0 %	20 %	284800367
81	NC_013766	AATAT	2	10	122375	122384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013766	GCGAG	2	10	125691	125700	20 %	0 %	60 %	20 %	284800374
83	NC_013766	TGAAG	2	10	127702	127711	40 %	20 %	40 %	0 %	284800376
84	NC_013766	CGTCA	2	10	129558	129567	20 %	20 %	20 %	40 %	284800378
85	NC_013766	ATTTT	2	10	134455	134464	20 %	80 %	0 %	0 %	284800380
86	NC_013766	ATTTT	2	10	134539	134548	20 %	80 %	0 %	0 %	284800381
87	NC_013766	TAATT	2	10	135213	135222	40 %	60 %	0 %	0 %	284800381
88	NC_013766	TATGA	2	10	138348	138357	40 %	40 %	20 %	0 %	284800384
89	NC_013766	AACGT	2	10	138796	138805	40 %	20 %	20 %	20 %	284800385
90	NC_013766	AAGTC	2	10	139014	139023	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013766	CTATT	2	10	139418	139427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013766	CTATA	2	10	140459	140468	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013766	ATCCA	2	10	146647	146656	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_013766	TCTTA	2	10	148429	148438	20 %	60 %	0 %	20 %	284800396
95	NC_013766	ATTAC	2	10	149414	149423	40 %	40 %	0 %	20 %	284800397
96	NC_013766	TTTTG	2	10	152524	152533	0 %	80 %	20 %	0 %	284800399
97	NC_013766	CATTC	2	10	153618	153627	20 %	40 %	0 %	40 %	284800400
98	NC_013766	AAAAC	2	10	154096	154105	80 %	0 %	0 %	20 %	284800400
99	NC_013766	AGCCC	2	10	155545	155554	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_013766	AAAAG	2	10	157153	157162	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013766	TTTTC	2	10	159051	159060	0 %	80 %	0 %	20 %	284800405
102	NC_013766	CTTAT	2	10	159220	159229	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013766	GATGG	2	10	161433	161442	20 %	20 %	60 %	0 %	284800408
104	NC_013766	CATCA	2	10	163830	163839	40 %	20 %	0 %	40 %	284800410
105	NC_013766	TTTTA	2	10	165398	165407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013766	TCATT	2	10	166249	166258	20 %	60 %	0 %	20 %	284800414
107	NC_013766	TTTAA	2	10	173098	173107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013766	ATTTA	2	10	174089	174098	40 %	60 %	0 %	0 %	284800423
109	NC_013766	TATTT	2	10	177007	177016	20 %	80 %	0 %	0 %	284800425
110	NC_013766	ACGAA	2	10	177840	177849	60 %	0 %	20 %	20 %	284800425
111	NC_013766	GCACT	2	10	179284	179293	20 %	20 %	20 %	40 %	284800426
112	NC_013766	ATTTT	2	10	179716	179725	20 %	80 %	0 %	0 %	284800426
113	NC_013766	TCGCT	2	10	180238	180247	0 %	40 %	20 %	40 %	284800427
114	NC_013766	GTGCT	2	10	180969	180978	0 %	40 %	40 %	20 %	284800427
115	NC_013766	GAAAC	2	10	181185	181194	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013766	ATGAA	2	10	181211	181220	60 %	20 %	20 %	0 %	284800428
117	NC_013766	TATGA	2	10	185868	185877	40 %	40 %	20 %	0 %	284800432
118	NC_013766	TTGCT	2	10	187092	187101	0 %	60 %	20 %	20 %	284800433
119	NC_013766	TTAAT	2	10	188139	188148	40 %	60 %	0 %	0 %	284800433
120	NC_013766	TGCGA	2	10	189642	189651	20 %	20 %	40 %	20 %	284800435
121	NC_013766	CCGTT	2	10	190599	190608	0 %	40 %	20 %	40 %	284800435
122	NC_013766	AAAGA	2	10	190969	190978	80 %	0 %	20 %	0 %	284800435
123	NC_013766	GGCTT	2	10	191540	191549	0 %	40 %	40 %	20 %	284800435
124	NC_013766	CGTAG	2	10	192415	192424	20 %	20 %	40 %	20 %	284800437
125	NC_013766	TGAGC	2	10	192981	192990	20 %	20 %	40 %	20 %	284800437
126	NC_013766	AATTC	2	10	195425	195434	40 %	40 %	0 %	20 %	284800440
127	NC_013766	GAGCG	2	10	197402	197411	20 %	0 %	60 %	20 %	284800444
128	NC_013766	GAAAA	2	10	198559	198568	80 %	0 %	20 %	0 %	284800445
129	NC_013766	ACCTG	2	10	199137	199146	20 %	20 %	20 %	40 %	284800446
130	NC_013766	GAAAA	2	10	205074	205083	80 %	0 %	20 %	0 %	284800451
131	NC_013766	GAAAT	2	10	205270	205279	60 %	20 %	20 %	0 %	284800451
132	NC_013766	TGCCA	2	10	208098	208107	20 %	20 %	20 %	40 %	284800454
133	NC_013766	CCGCA	2	10	208939	208948	20 %	0 %	20 %	60 %	284800455
134	NC_013766	AAATG	2	10	209935	209944	60 %	20 %	20 %	0 %	284800457
135	NC_013766	ATTTT	2	10	211455	211464	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013766	ACGTG	2	10	211997	212006	20 %	20 %	40 %	20 %	284800459
137	NC_013766	TATTT	2	10	216335	216344	20 %	80 %	0 %	0 %	284800462
138	NC_013766	AATAA	2	10	218102	218111	80 %	20 %	0 %	0 %	284800462
139	NC_013766	ATCAT	2	10	218439	218448	40 %	40 %	0 %	20 %	284800463
140	NC_013766	TGGGA	2	10	220709	220718	20 %	20 %	60 %	0 %	284800466
141	NC_013766	CTGAA	2	10	220728	220737	40 %	20 %	20 %	20 %	284800466
142	NC_013766	GGCCT	2	10	221262	221271	0 %	20 %	40 %	40 %	284800466
143	NC_013766	ATTAT	2	10	223685	223694	40 %	60 %	0 %	0 %	284800470
144	NC_013766	CACAA	2	10	224250	224259	60 %	0 %	0 %	40 %	284800470
145	NC_013766	AAAAT	2	10	231064	231073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013766	TCTAA	2	10	231159	231168	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_013766	TTGTA	2	10	231380	231389	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013766	ACAAA	2	10	231589	231598	80 %	0 %	0 %	20 %	284800477
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151	NC_013766	GTTTT	2	10	235030	235039	0 %	80 %	20 %	0 %	284800480
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162	NC_013766	ACCTG	2	10	247286	247295	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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172	NC_013766	GTTTT	2	10	257825	257834	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_013766	CCTTG	2	10	259367	259376	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
176	NC_013766	AACGA	2	10	259413	259422	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_013766	TCGTG	2	10	264956	264965	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
180	NC_013766	AAGGT	2	10	266675	266684	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_013766	ATATG	2	10	297650	297659	40 %	40 %	20 %	0 %	284800554
198	NC_013766	ATTTG	2	10	298256	298265	20 %	60 %	20 %	0 %	284800554
199	NC_013766	ACAAA	2	10	298324	298333	80 %	0 %	0 %	20 %	284800554
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209	NC_013766	AAACA	2	10	314108	314117	80 %	0 %	0 %	20 %	284800562
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246	NC_013766	ATTGT	2	10	366717	366726	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_013766	AAACT	2	10	385851	385860	60 %	20 %	0 %	20 %	284800627
263	NC_013766	AAATT	2	10	386211	386220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_013766	CTTCA	2	10	388217	388226	20 %	40 %	0 %	40 %	284800630
265	NC_013766	GGTTG	2	10	389520	389529	0 %	40 %	60 %	0 %	284800631
266	NC_013766	CCATT	2	10	389887	389896	20 %	40 %	0 %	40 %	284800632
267	NC_013766	TTAAG	2	10	390060	390069	40 %	40 %	20 %	0 %	284800632
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