MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 43309

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013766	GAC	2	6	257	262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800256
2	NC_013766	TTA	2	6	275	280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800256
3	NC_013766	CAG	2	6	300	305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800256
4	NC_013766	GAA	2	6	419	424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800256
5	NC_013766	TAA	2	6	516	521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800256
6	NC_013766	CTG	2	6	546	551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800256
7	NC_013766	AAT	2	6	654	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800256
8	NC_013766	GTC	3	9	923	931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800257
9	NC_013766	GAA	2	6	938	943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800257
10	NC_013766	AAG	2	6	1033	1038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013766	TGT	2	6	1133	1138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800258
12	NC_013766	AAG	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800258
13	NC_013766	ATC	2	6	1296	1301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800258
14	NC_013766	CGG	2	6	1312	1317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284800258
15	NC_013766	GAA	3	9	1452	1460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800259
16	NC_013766	GTT	2	6	1660	1665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800259
17	NC_013766	ACA	2	6	1806	1811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800259
18	NC_013766	ATG	2	6	1852	1857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800259
19	NC_013766	GTT	2	6	1859	1864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800259
20	NC_013766	ATT	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800259
21	NC_013766	CTA	2	6	1891	1896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800259
22	NC_013766	TAG	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800259
23	NC_013766	CAG	2	6	1922	1927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800259
24	NC_013766	GTT	2	6	1993	1998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800259
25	NC_013766	AAC	2	6	2007	2012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800259
26	NC_013766	ATC	2	6	2019	2024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800259
27	NC_013766	ATG	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800259
28	NC_013766	CAT	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800259
29	NC_013766	AGG	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284800259
30	NC_013766	GAA	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800259
31	NC_013766	GAA	2	6	2343	2348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800260
32	NC_013766	ACA	2	6	2379	2384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800260
33	NC_013766	AGA	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800260
34	NC_013766	AGA	2	6	2555	2560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800260
35	NC_013766	TAA	2	6	2669	2674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800260
36	NC_013766	AAC	2	6	2675	2680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800260
37	NC_013766	ATT	2	6	2697	2702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800260
38	NC_013766	ATT	2	6	2832	2837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800260
39	NC_013766	AGG	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013766	GAT	2	6	3044	3049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800261
41	NC_013766	TGG	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800261
42	NC_013766	AGC	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800261
43	NC_013766	GAA	2	6	3225	3230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800261
44	NC_013766	TAT	2	6	3263	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800261
45	NC_013766	GAA	2	6	3396	3401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800261
46	NC_013766	GTT	2	6	3411	3416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800261
47	NC_013766	GTT	2	6	3432	3437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800261
48	NC_013766	AAT	2	6	3589	3594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800262
49	NC_013766	TGC	2	6	3634	3639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800262
50	NC_013766	TAA	2	6	3783	3788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800262
51	NC_013766	TGG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800262
52	NC_013766	GTG	2	6	3806	3811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800262
53	NC_013766	ATC	2	6	3832	3837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800262
54	NC_013766	TGA	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800262
55	NC_013766	TTC	3	9	3916	3924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800262
56	NC_013766	TTG	2	6	3958	3963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800262
57	NC_013766	ATA	2	6	3992	3997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800262
58	NC_013766	GAA	3	9	4032	4040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800262
59	NC_013766	TTG	2	6	4096	4101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800262
60	NC_013766	TGA	2	6	4119	4124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800262
61	NC_013766	ATG	2	6	4156	4161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800262
62	NC_013766	GAA	2	6	4333	4338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800262
63	NC_013766	TAA	2	6	4348	4353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800262
64	NC_013766	TGC	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800262
65	NC_013766	AGG	2	6	4584	4589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013766	TGG	2	6	4793	4798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800263
67	NC_013766	ATT	2	6	4872	4877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800263
68	NC_013766	TTA	2	6	4902	4907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800263
69	NC_013766	ATT	2	6	5064	5069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800263
70	NC_013766	TAG	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800263
71	NC_013766	TAT	2	6	5395	5400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800263
72	NC_013766	CAG	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800263
73	NC_013766	GTT	2	6	5468	5473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800263
74	NC_013766	CTT	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800263
75	NC_013766	TTG	2	6	5521	5526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800263
76	NC_013766	CAG	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800263
77	NC_013766	CAA	2	6	5629	5634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800263
78	NC_013766	GTG	2	6	5641	5646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800263
79	NC_013766	GTA	2	6	5680	5685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800263
80	NC_013766	TGA	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800263
81	NC_013766	AGA	2	6	5969	5974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800264
82	NC_013766	TTG	2	6	6336	6341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800264
83	NC_013766	AAC	2	6	6389	6394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800264
84	NC_013766	ATT	2	6	6434	6439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800264
85	NC_013766	GGT	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800264
86	NC_013766	CAG	2	6	6616	6621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800264
87	NC_013766	AGT	2	6	6645	6650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800264
88	NC_013766	AGC	2	6	6701	6706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800264
89	NC_013766	GAC	2	6	6807	6812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800264
90	NC_013766	ATT	2	6	6873	6878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800264
91	NC_013766	ATG	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800264
92	NC_013766	TAA	2	6	6899	6904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800264
93	NC_013766	TGG	2	6	6916	6921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800264
94	NC_013766	TAT	2	6	7014	7019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800264
95	NC_013766	GGT	2	6	7083	7088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800264
96	NC_013766	GAA	2	6	7231	7236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800264
97	NC_013766	ATT	2	6	7239	7244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800264
98	NC_013766	AGG	2	6	7336	7341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284800264
99	NC_013766	CTG	2	6	7469	7474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800265
100	NC_013766	GAT	2	6	7482	7487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800265
101	NC_013766	AAG	2	6	7810	7815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800265
102	NC_013766	TAA	2	6	7898	7903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800265
103	NC_013766	AAG	2	6	8020	8025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800265
104	NC_013766	TAA	2	6	8165	8170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800265
105	NC_013766	TCT	2	6	8175	8180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800265
106	NC_013766	GTC	2	6	8218	8223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800265
107	NC_013766	GAT	2	6	8259	8264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800265
108	NC_013766	TTC	2	6	8334	8339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800265
109	NC_013766	CAA	2	6	8344	8349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800265
110	NC_013766	TGC	2	6	8360	8365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800265
111	NC_013766	GTT	2	6	8370	8375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800265
112	NC_013766	AGA	2	6	8483	8488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800265
113	NC_013766	ACT	2	6	8521	8526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800265
114	NC_013766	AAG	2	6	8569	8574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800265
115	NC_013766	GAA	2	6	8586	8591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800265
116	NC_013766	TTA	2	6	8653	8658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800266
117	NC_013766	ACT	2	6	8673	8678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800266
118	NC_013766	TTG	2	6	8733	8738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800266
119	NC_013766	AAG	2	6	8746	8751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800266
120	NC_013766	ATC	2	6	8778	8783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800266
121	NC_013766	GAA	2	6	8871	8876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800266
122	NC_013766	TGT	2	6	8935	8940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800266
123	NC_013766	CGG	2	6	8954	8959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284800266
124	NC_013766	GTT	2	6	9033	9038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800266
125	NC_013766	ATT	2	6	9165	9170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800266
126	NC_013766	AGC	2	6	9320	9325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800266
127	NC_013766	AGG	2	6	9445	9450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284800266
128	NC_013766	AAT	2	6	9455	9460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800267
129	NC_013766	TAT	2	6	9476	9481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800267
130	NC_013766	TAA	2	6	9497	9502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800267
131	NC_013766	AGA	2	6	9503	9508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800267
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