MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 3933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013766	AAG	2	6	1033	1038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013766	AGG	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013766	AGG	2	6	4584	4589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013766	TGA	2	6	11285	11290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013766	CCA	2	6	14125	14130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013766	ATC	2	6	15263	15268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013766	TTC	2	6	15401	15406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013766	AGG	2	6	15427	15432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013766	AGG	2	6	18493	18498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013766	ATA	2	6	21300	21305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013766	AGC	2	6	28787	28792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013766	GTT	2	6	28843	28848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013766	ATT	2	6	28855	28860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013766	AGA	2	6	30499	30504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013766	TAT	2	6	30783	30788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013766	TGA	2	6	30822	30827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013766	ATT	2	6	33116	33121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013766	AAT	2	6	33130	33135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013766	GTT	2	6	33155	33160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013766	AGG	2	6	33191	33196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013766	TAT	2	6	37412	37417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013766	TGA	2	6	37492	37497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013766	ATA	2	6	37544	37549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013766	AGA	2	6	40011	40016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013766	CTT	2	6	40050	40055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013766	ATA	2	6	40073	40078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013766	CAG	2	6	40110	40115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013766	AGA	2	6	44002	44007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013766	AGG	2	6	45223	45228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013766	TCC	2	6	45249	45254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013766	TAA	2	6	46116	46121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013766	CTC	2	6	48868	48873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013766	TTA	2	6	49031	49036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013766	TAA	2	6	49058	49063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013766	GTT	2	6	49124	49129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013766	TAA	2	6	52523	52528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013766	AAT	2	6	52588	52593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013766	AGA	3	9	52637	52645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013766	AAG	2	6	53905	53910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013766	ACA	2	6	53915	53920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013766	ACA	2	6	54420	54425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013766	AAT	2	6	56782	56787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013766	AGG	2	6	57793	57798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013766	CTT	2	6	60977	60982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013766	AGG	2	6	61013	61018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013766	GAA	2	6	62159	62164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013766	AGC	2	6	63887	63892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013766	ATA	2	6	63985	63990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013766	AAC	2	6	65246	65251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013766	AGG	2	6	65348	65353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013766	TAA	2	6	68212	68217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013766	AGG	2	6	69196	69201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013766	CTT	2	6	72239	72244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013766	TAA	2	6	72266	72271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013766	TTA	2	6	72272	72277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013766	CTA	2	6	73904	73909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013766	GAG	2	6	73981	73986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013766	AGG	2	6	76047	76052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013766	AGG	2	6	77690	77695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013766	AAT	2	6	81774	81779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013766	TAT	2	6	81801	81806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013766	AAT	2	6	83665	83670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013766	TGG	2	6	83708	83713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013766	GTA	2	6	83805	83810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013766	AGG	2	6	84239	84244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013766	GTG	2	6	84396	84401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013766	AAT	2	6	84532	84537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013766	TGG	2	6	84594	84599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013766	GAT	2	6	85585	85590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013766	TAT	2	6	85628	85633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013766	AGG	2	6	85638	85643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013766	CTA	2	6	88958	88963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013766	TAG	2	6	93544	93549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013766	TTA	2	6	99572	99577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013766	GAA	2	6	99689	99694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013766	TAT	2	6	99926	99931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013766	GGA	2	6	100024	100029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013766	GAA	2	6	101683	101688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013766	CTT	2	6	102337	102342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013766	CAT	2	6	102347	102352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013766	AGA	2	6	102397	102402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013766	ATG	2	6	102411	102416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013766	CCA	2	6	102427	102432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_013766	GAT	2	6	102459	102464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013766	TCT	2	6	104006	104011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013766	CTA	2	6	104037	104042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013766	AGG	2	6	104127	104132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013766	TTA	2	6	109994	109999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013766	TAA	2	6	110019	110024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013766	ATA	2	6	111687	111692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013766	TAG	2	6	111805	111810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013766	TCC	2	6	115421	115426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_013766	AAG	2	6	118467	118472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013766	TAA	2	6	118476	118481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013766	GAA	2	6	120023	120028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013766	CGA	2	6	120296	120301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013766	ATT	2	6	122162	122167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013766	ATT	2	6	123163	123168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013766	AGG	2	6	123218	123223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013766	AAT	2	6	124320	124325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013766	AGA	2	6	124339	124344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013766	TTA	2	6	136505	136510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013766	TCA	2	6	137446	137451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013766	AGG	2	6	137478	137483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013766	AGG	2	6	137861	137866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013766	TTC	2	6	138968	138973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013766	CTT	2	6	139033	139038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013766	TCT	2	6	139206	139211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013766	ATT	2	6	140412	140417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013766	CGC	2	6	140477	140482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_013766	GAG	2	6	140510	140515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013766	TAT	2	6	143333	143338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013766	ATT	2	6	146636	146641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013766	ATA	2	6	147257	147262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013766	ATT	2	6	147422	147427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013766	TTA	2	6	147428	147433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013766	AGG	2	6	147544	147549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013766	CAC	2	6	153516	153521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_013766	TCT	2	6	155562	155567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013766	TAA	2	6	155578	155583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013766	TGA	2	6	157163	157168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013766	ATT	2	6	157384	157389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013766	GCG	2	6	157423	157428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013766	GTG	2	6	157508	157513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013766	GCA	2	6	157571	157576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013766	GAT	2	6	157640	157645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013766	AGT	2	6	157712	157717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013766	AAT	2	6	157752	157757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013766	TAA	2	6	158598	158603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013766	ACA	2	6	158638	158643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013766	TAA	2	6	158657	158662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013766	TAG	3	9	158666	158674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013766	TGG	2	6	158689	158694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013766	GGT	2	6	158792	158797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013766	TCG	2	6	158809	158814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013766	TGA	2	6	158815	158820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013766	ATT	2	6	158895	158900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013766	GCC	2	6	158909	158914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_013766	GAG	2	6	159451	159456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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