MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Geodermatophilus obscurus DSM 43160 chromosome

Total Repeats: 434

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013757	CGTCGC	2	12	5	16	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013757	CGGCAC	2	12	18985	18996	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013757	CGACGG	2	12	24426	24437	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013757	CCGGCC	2	12	34782	34793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_013757	CGGTCA	2	12	35010	35021	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013757	GCCGTC	2	12	37598	37609	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013757	CCGGGC	2	12	55000	55011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013757	TCGGCA	2	12	73589	73600	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013757	GCCCGA	2	12	93326	93337	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013757	CCCCGC	2	12	95422	95433	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
11	NC_013757	ACCGGG	2	12	106996	107007	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013757	GTCGGG	2	12	112108	112119	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013757	GGAGGG	2	12	143518	143529	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013757	GGGTGG	2	12	150545	150556	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013757	GTGGGG	2	12	150559	150570	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013757	GTGCCG	2	12	167472	167483	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013757	ACCGGA	2	12	189168	189179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013757	AGTGCA	2	12	200685	200696	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013757	CCGGCA	2	12	200757	200768	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013757	GTCGAC	2	12	218870	218881	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013757	CGGACG	2	12	226223	226234	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013757	ACGCCG	2	12	257752	257763	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013757	CGGGCA	2	12	297326	297337	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013757	CGTCCC	2	12	317983	317994	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_013757	CGAGCT	2	12	318202	318213	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013757	CGCGGC	2	12	318929	318940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013757	GAGCTG	2	12	319380	319391	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013757	GGGCTG	2	12	320019	320030	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013757	CCGCGA	2	12	320288	320299	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013757	ATCGGC	2	12	338001	338012	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013757	CGCGGG	2	12	339784	339795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013757	TCGACG	2	12	347068	347079	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013757	GACGGC	2	12	347377	347388	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013757	GCTGGT	2	12	348348	348359	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013757	ACCGCC	2	12	351991	352002	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_013757	GAGGGG	2	12	364408	364419	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013757	TCGCCC	2	12	387372	387383	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_013757	TCGCCA	2	12	388419	388430	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013757	TCCACC	2	12	392610	392621	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_013757	GGCCGT	2	12	407068	407079	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013757	GACGGC	2	12	411237	411248	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013757	CGAGCG	2	12	418265	418276	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013757	GTCACG	2	12	420306	420317	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013757	GGGCCT	2	12	462780	462791	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013757	GGTCGG	2	12	462828	462839	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013757	CGGCGT	2	12	463819	463830	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013757	GGGCGA	2	12	498151	498162	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013757	CACCGC	2	12	516220	516231	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_013757	CGGATC	2	12	519595	519606	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013757	GGCCGG	3	18	534662	534679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013757	GCCGAC	2	12	560100	560111	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013757	CGCCTG	2	12	561559	561570	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013757	CAGGCC	2	12	596454	596465	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013757	CGAGGT	4	24	621336	621359	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013757	CACCTC	2	12	668379	668390	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013757	GTCGGG	2	12	671174	671185	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013757	GTCCTC	2	12	702276	702287	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013757	GAGCCT	2	12	722601	722612	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013757	ACGTAG	2	12	737400	737411	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013757	TTATTC	2	12	738206	738217	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013757	CGACCG	2	12	762305	762316	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013757	CGATGC	2	12	765942	765953	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013757	CGGGAG	2	12	769328	769339	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013757	TGTAGC	2	12	773705	773716	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013757	CGGCGA	2	12	776513	776524	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013757	CTGGCG	2	12	776574	776585	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013757	GGTGAG	2	12	778202	778213	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013757	GGTCCG	6	36	811164	811199	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013757	GCGACC	2	12	811462	811473	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013757	CCGGCC	2	12	811630	811641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013757	CCGATC	2	12	811935	811946	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013757	TACTCC	2	12	813867	813878	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013757	CGCCCC	2	12	822216	822227	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
74	NC_013757	GCCGGT	2	12	823287	823298	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013757	TCCGCG	2	12	828538	828549	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013757	CCCGCC	2	12	843537	843548	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
77	NC_013757	GAAGCG	2	12	906450	906461	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013757	CCCCCA	2	12	963488	963499	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
79	NC_013757	CGAGTC	2	12	965542	965553	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013757	CCGAGG	2	12	965573	965584	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013757	CGAGCG	2	12	1006869	1006880	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013757	CGAGGA	2	12	1007298	1007309	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_013757	CGGGGG	2	12	1057193	1057204	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013757	CAGCCG	2	12	1060685	1060696	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013757	GGCGGG	2	12	1065462	1065473	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013757	CGGCCG	2	12	1072933	1072944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013757	ACCGGC	2	12	1101233	1101244	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013757	GGGACG	2	12	1101353	1101364	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013757	GCGGGC	2	12	1109589	1109600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013757	CCTGGA	2	12	1110477	1110488	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013757	GGTGGG	2	12	1117055	1117066	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013757	CGCCTC	2	12	1120722	1120733	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_013757	TCGCGG	2	12	1124383	1124394	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013757	CTGGCA	2	12	1124404	1124415	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013757	GTCGGT	2	12	1139175	1139186	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_013757	GGCCCG	2	12	1153088	1153099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013757	GACGGG	2	12	1169969	1169980	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013757	TCGGCT	2	12	1193316	1193327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013757	GGGGCC	2	12	1197580	1197591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013757	CCCGAT	2	12	1198526	1198537	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013757	GCGGCA	2	12	1254018	1254029	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013757	GGTCCA	2	12	1256222	1256233	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013757	ACGGGA	2	12	1288298	1288309	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013757	TCGGCG	2	12	1305073	1305084	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013757	GCTGCG	2	12	1305419	1305430	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013757	GCTGAT	2	12	1305443	1305454	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_013757	ACGGGG	2	12	1318266	1318277	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013757	GTCGAG	2	12	1319536	1319547	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_013757	GCCGTC	2	12	1353976	1353987	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013757	CTGCGG	2	12	1371210	1371221	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013757	TGGAAG	2	12	1373959	1373970	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013757	CAGCCG	2	12	1383075	1383086	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013757	GCGGGG	2	12	1393001	1393012	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_013757	GTCGAC	2	12	1405132	1405143	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013757	TCGGCC	2	12	1413311	1413322	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013757	CGCTCA	2	12	1425968	1425979	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013757	GCGCCC	2	12	1433573	1433584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_013757	CCGGCC	2	12	1444396	1444407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_013757	GTGCGG	2	12	1445648	1445659	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_013757	GGGCAG	2	12	1450139	1450150	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_013757	CGGCGT	2	12	1454967	1454978	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013757	CCCGGC	2	12	1488208	1488219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_013757	GCACCG	2	12	1488239	1488250	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013757	GCACCG	2	12	1488254	1488265	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013757	CGTTCT	2	12	1505657	1505668	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013757	GGCTCG	2	12	1515733	1515744	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013757	CAGTAG	2	12	1553239	1553250	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_013757	GAGCTG	2	12	1558761	1558772	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_013757	GCGCTC	2	12	1569356	1569367	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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249	NC_013757	AGGGCG	2	12	2736373	2736384	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
250	NC_013757	AAGCCG	2	12	2737207	2737218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_013757	AGGCGG	2	12	2739526	2739537	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_013757	ACCGCA	2	12	2742915	2742926	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
253	NC_013757	GACGTC	2	12	2757123	2757134	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_013757	CGAGAT	2	12	2773700	2773711	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
255	NC_013757	TCGGCG	2	12	2776253	2776264	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_013757	CGGCCG	2	12	2799340	2799351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
257	NC_013757	AGGCCG	2	12	2845420	2845431	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_013757	ACAGCC	2	12	2864600	2864611	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
259	NC_013757	TGACTG	2	12	2864909	2864920	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
260	NC_013757	ACCGCT	2	12	2869381	2869392	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
261	NC_013757	CCTGGC	2	12	2869530	2869541	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
262	NC_013757	CGGCGA	2	12	2952063	2952074	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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265	NC_013757	GCCGGC	2	12	2965031	2965042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
266	NC_013757	CCGGAC	2	12	2970661	2970672	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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269	NC_013757	GACGTC	2	12	3035489	3035500	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_013757	CAACAT	2	12	3036778	3036789	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_013757	AGCCGG	2	12	3041405	3041416	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_013757	CCGACC	2	12	3044856	3044867	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_013757	GACGTC	2	12	3051088	3051099	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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275	NC_013757	CCGGGC	2	12	3053830	3053841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
276	NC_013757	ACCGTG	2	12	3054117	3054128	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_013757	CGGCTC	2	12	3073869	3073880	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
279	NC_013757	GTCGGT	2	12	3076593	3076604	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
280	NC_013757	TGCCGG	2	12	3081273	3081284	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_013757	TGACGG	2	12	3088072	3088083	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
282	NC_013757	TCCCGA	2	12	3089337	3089348	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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354	NC_013757	GGCCCC	2	12	4034667	4034678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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357	NC_013757	ACCGAC	2	12	4083645	4083656	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
358	NC_013757	CCGCGG	2	12	4093875	4093886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
359	NC_013757	CGGGGG	2	12	4116184	4116195	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
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361	NC_013757	TGCCGG	2	12	4143138	4143149	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
362	NC_013757	TGCACT	2	12	4143210	4143221	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
363	NC_013757	CGGCCG	2	12	4161994	4162005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
364	NC_013757	GCCCGG	2	12	4172766	4172777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
365	NC_013757	CCGGAC	2	12	4172787	4172798	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
366	NC_013757	GCGGCC	2	12	4213319	4213330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
367	NC_013757	CGGGAA	2	12	4268621	4268632	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
368	NC_013757	GCGGGG	2	12	4269783	4269794	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
369	NC_013757	CGGCTG	2	12	4321416	4321427	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
370	NC_013757	TCACCG	2	12	4330582	4330593	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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372	NC_013757	CCCGGG	2	12	4419206	4419217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
373	NC_013757	GCAGCC	2	12	4463589	4463600	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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377	NC_013757	GCCCGG	2	12	4508164	4508175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.