MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR06

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013749	TACA	2	8	1027	1034	50 %	25 %	0 %	25 %	284176394
2	NC_013749	ACAA	2	8	1057	1064	75 %	0 %	0 %	25 %	284176394
3	NC_013749	GCGA	2	8	1699	1706	25 %	0 %	50 %	25 %	284176396
4	NC_013749	GTGC	2	8	2434	2441	0 %	25 %	50 %	25 %	284176397
5	NC_013749	GGTC	2	8	2514	2521	0 %	25 %	50 %	25 %	284176398
6	NC_013749	CGCC	2	8	2571	2578	0 %	0 %	25 %	75 %	284176398
7	NC_013749	TGGT	2	8	2778	2785	0 %	50 %	50 %	0 %	284176398
8	NC_013749	GGAG	2	8	3310	3317	25 %	0 %	75 %	0 %	284176398
9	NC_013749	CCGT	2	8	3489	3496	0 %	25 %	25 %	50 %	284176398
10	NC_013749	CCGA	2	8	4129	4136	25 %	0 %	25 %	50 %	284176398
11	NC_013749	TCCC	2	8	4989	4996	0 %	25 %	0 %	75 %	284176398
12	NC_013749	GCGT	2	8	5737	5744	0 %	25 %	50 %	25 %	284176400
13	NC_013749	CGTT	2	8	6164	6171	0 %	50 %	25 %	25 %	284176400
14	NC_013749	CCAT	2	8	6232	6239	25 %	25 %	0 %	50 %	284176400
15	NC_013749	CTGG	2	8	6708	6715	0 %	25 %	50 %	25 %	284176400
16	NC_013749	CCGC	2	8	7228	7235	0 %	0 %	25 %	75 %	284176401
17	NC_013749	GTCT	2	8	7849	7856	0 %	50 %	25 %	25 %	284176401
18	NC_013749	CGAT	2	8	8068	8075	25 %	25 %	25 %	25 %	284176401
19	NC_013749	GACA	2	8	8810	8817	50 %	0 %	25 %	25 %	284176401
20	NC_013749	ACGT	2	8	8860	8867	25 %	25 %	25 %	25 %	284176401
21	NC_013749	TCGC	2	8	8955	8962	0 %	25 %	25 %	50 %	284176401
22	NC_013749	GCGA	2	8	9069	9076	25 %	0 %	50 %	25 %	284176401
23	NC_013749	CCAT	2	8	10520	10527	25 %	25 %	0 %	50 %	284176401
24	NC_013749	CGTG	2	8	11396	11403	0 %	25 %	50 %	25 %	284176402
25	NC_013749	CGGA	2	8	11940	11947	25 %	0 %	50 %	25 %	284176404
26	NC_013749	ATCG	2	8	13168	13175	25 %	25 %	25 %	25 %	284176407
27	NC_013749	CCGA	2	8	13235	13242	25 %	0 %	25 %	50 %	284176407
28	NC_013749	TGAC	2	8	13363	13370	25 %	25 %	25 %	25 %	284176408
29	NC_013749	CGTC	2	8	14536	14543	0 %	25 %	25 %	50 %	284176410
30	NC_013749	GCCG	2	8	14678	14685	0 %	0 %	50 %	50 %	284176411
31	NC_013749	TCGA	2	8	14707	14714	25 %	25 %	25 %	25 %	284176411
32	NC_013749	TCAC	2	8	15228	15235	25 %	25 %	0 %	50 %	284176412
33	NC_013749	CGAA	2	8	15261	15268	50 %	0 %	25 %	25 %	284176412
34	NC_013749	ACCT	2	8	15301	15308	25 %	25 %	0 %	50 %	284176412
35	NC_013749	CTCG	2	8	15459	15466	0 %	25 %	25 %	50 %	284176412

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.