MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR05

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013748	GGCCG	2	10	1884	1893	0 %	0 %	60 %	40 %	284176296
2	NC_013748	CGATT	2	10	6022	6031	20 %	40 %	20 %	20 %	284176302
3	NC_013748	CCAAC	2	10	6092	6101	40 %	0 %	0 %	60 %	284176302
4	NC_013748	TCGAG	2	10	6118	6127	20 %	20 %	40 %	20 %	284176302
5	NC_013748	CGGAC	2	10	6128	6137	20 %	0 %	40 %	40 %	284176302
6	NC_013748	CACAC	2	10	6739	6748	40 %	0 %	0 %	60 %	284176302
7	NC_013748	TGGCG	2	10	8652	8661	0 %	20 %	60 %	20 %	284176302
8	NC_013748	ACCGG	2	10	10135	10144	20 %	0 %	40 %	40 %	284176303
9	NC_013748	GAACC	2	10	10430	10439	40 %	0 %	20 %	40 %	284176303
10	NC_013748	CGATC	2	10	11976	11985	20 %	20 %	20 %	40 %	284176305
11	NC_013748	CAACC	2	10	14825	14834	40 %	0 %	0 %	60 %	284176308
12	NC_013748	ACGAC	2	10	15137	15146	40 %	0 %	20 %	40 %	284176308
13	NC_013748	CCGGT	2	10	25995	26004	0 %	20 %	40 %	40 %	284176322
14	NC_013748	GACGG	2	10	30540	30549	20 %	0 %	60 %	20 %	284176325
15	NC_013748	CCCGA	2	10	30776	30785	20 %	0 %	20 %	60 %	284176326
16	NC_013748	TCAAC	2	10	32529	32538	40 %	20 %	0 %	40 %	284176328
17	NC_013748	GAATT	2	10	34459	34468	40 %	40 %	20 %	0 %	284176329
18	NC_013748	TGCGT	2	10	34812	34821	0 %	40 %	40 %	20 %	284176329
19	NC_013748	GAGGT	2	10	41390	41399	20 %	20 %	60 %	0 %	284176339
20	NC_013748	CGGGA	2	10	42341	42350	20 %	0 %	60 %	20 %	284176341
21	NC_013748	CGGCG	2	10	43265	43274	0 %	0 %	60 %	40 %	284176345
22	NC_013748	GCCCG	2	10	44008	44017	0 %	0 %	40 %	60 %	284176348
23	NC_013748	CGCCA	2	10	47869	47878	20 %	0 %	20 %	60 %	284176353
24	NC_013748	TCGGC	2	10	48755	48764	0 %	20 %	40 %	40 %	284176354
25	NC_013748	TCGCT	2	10	50759	50768	0 %	40 %	20 %	40 %	284176361
26	NC_013748	CGAAA	2	10	51417	51426	60 %	0 %	20 %	20 %	284176362
27	NC_013748	GGTCG	2	10	51851	51860	0 %	20 %	60 %	20 %	284176363
28	NC_013748	TTCGA	2	10	54136	54145	20 %	40 %	20 %	20 %	284176369
29	NC_013748	CGTCC	2	10	54322	54331	0 %	20 %	20 %	60 %	284176371
30	NC_013748	TCGAG	2	10	55042	55051	20 %	20 %	40 %	20 %	284176372
31	NC_013748	GTCCC	2	10	55528	55537	0 %	20 %	20 %	60 %	284176373
32	NC_013748	GGTCG	2	10	56208	56217	0 %	20 %	60 %	20 %	284176374
33	NC_013748	TGCTG	2	10	56564	56573	0 %	40 %	40 %	20 %	284176374
34	NC_013748	AGTCG	2	10	59064	59073	20 %	20 %	40 %	20 %	284176376
35	NC_013748	GATCG	2	10	59239	59248	20 %	20 %	40 %	20 %	284176376
36	NC_013748	GTTCC	2	10	60014	60023	0 %	40 %	20 %	40 %	284176377
37	NC_013748	ACGAG	2	10	60822	60831	40 %	0 %	40 %	20 %	284176379
38	NC_013748	GGATC	2	10	61503	61512	20 %	20 %	40 %	20 %	284176380
39	NC_013748	GCAAA	2	10	70200	70209	60 %	0 %	20 %	20 %	284176389
40	NC_013748	CCGAC	2	10	70473	70482	20 %	0 %	20 %	60 %	284176389

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.