MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR05

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013748	GA	3	6	238	243	50 %	0 %	50 %	0 %	284176294
2	NC_013748	GC	3	6	1053	1058	0 %	0 %	50 %	50 %	284176295
3	NC_013748	GC	3	6	1469	1474	0 %	0 %	50 %	50 %	284176296
4	NC_013748	CG	3	6	1478	1483	0 %	0 %	50 %	50 %	284176296
5	NC_013748	GA	4	8	2673	2680	50 %	0 %	50 %	0 %	284176297
6	NC_013748	AT	3	6	2828	2833	50 %	50 %	0 %	0 %	284176297
7	NC_013748	AC	3	6	4237	4242	50 %	0 %	0 %	50 %	284176299
8	NC_013748	AT	3	6	4258	4263	50 %	50 %	0 %	0 %	284176299
9	NC_013748	TC	3	6	5405	5410	0 %	50 %	0 %	50 %	284176301
10	NC_013748	GA	3	6	6040	6045	50 %	0 %	50 %	0 %	284176302
11	NC_013748	CA	3	6	6281	6286	50 %	0 %	0 %	50 %	284176302
12	NC_013748	AG	3	6	6611	6616	50 %	0 %	50 %	0 %	284176302
13	NC_013748	CG	3	6	7149	7154	0 %	0 %	50 %	50 %	284176302
14	NC_013748	GC	3	6	7375	7380	0 %	0 %	50 %	50 %	284176302
15	NC_013748	AC	3	6	7843	7848	50 %	0 %	0 %	50 %	284176302
16	NC_013748	CG	3	6	8283	8288	0 %	0 %	50 %	50 %	284176302
17	NC_013748	GC	3	6	8934	8939	0 %	0 %	50 %	50 %	284176302
18	NC_013748	GA	3	6	8976	8981	50 %	0 %	50 %	0 %	284176303
19	NC_013748	AC	3	6	9068	9073	50 %	0 %	0 %	50 %	284176303
20	NC_013748	CT	3	6	9426	9431	0 %	50 %	0 %	50 %	284176303
21	NC_013748	GC	3	6	9564	9569	0 %	0 %	50 %	50 %	284176303
22	NC_013748	TC	3	6	9582	9587	0 %	50 %	0 %	50 %	284176303
23	NC_013748	GT	3	6	9983	9988	0 %	50 %	50 %	0 %	284176303
24	NC_013748	AC	4	8	11349	11356	50 %	0 %	0 %	50 %	284176305
25	NC_013748	CT	3	6	11414	11419	0 %	50 %	0 %	50 %	284176305
26	NC_013748	TC	3	6	14139	14144	0 %	50 %	0 %	50 %	284176307
27	NC_013748	GC	3	6	15234	15239	0 %	0 %	50 %	50 %	284176308
28	NC_013748	CG	3	6	16276	16281	0 %	0 %	50 %	50 %	284176309
29	NC_013748	GC	3	6	16827	16832	0 %	0 %	50 %	50 %	284176311
30	NC_013748	GC	3	6	18448	18453	0 %	0 %	50 %	50 %	284176314
31	NC_013748	CT	3	6	19240	19245	0 %	50 %	0 %	50 %	284176315
32	NC_013748	AC	3	6	19952	19957	50 %	0 %	0 %	50 %	284176318
33	NC_013748	CA	3	6	21333	21338	50 %	0 %	0 %	50 %	284176319
34	NC_013748	GC	3	6	21895	21900	0 %	0 %	50 %	50 %	284176320
35	NC_013748	GA	3	6	22712	22717	50 %	0 %	50 %	0 %	284176320
36	NC_013748	AC	3	6	25044	25049	50 %	0 %	0 %	50 %	284176322
37	NC_013748	GA	3	6	28280	28285	50 %	0 %	50 %	0 %	284176324
38	NC_013748	CG	3	6	28425	28430	0 %	0 %	50 %	50 %	284176324
39	NC_013748	GC	3	6	28470	28475	0 %	0 %	50 %	50 %	284176324
40	NC_013748	GC	3	6	29701	29706	0 %	0 %	50 %	50 %	284176325
41	NC_013748	GT	3	6	30909	30914	0 %	50 %	50 %	0 %	284176326
42	NC_013748	AT	3	6	33826	33831	50 %	50 %	0 %	0 %	284176329
43	NC_013748	TG	3	6	33873	33878	0 %	50 %	50 %	0 %	284176329
44	NC_013748	AT	3	6	35092	35097	50 %	50 %	0 %	0 %	284176329
45	NC_013748	GT	3	6	35719	35724	0 %	50 %	50 %	0 %	284176329
46	NC_013748	CT	3	6	36093	36098	0 %	50 %	0 %	50 %	284176329
47	NC_013748	AT	3	6	36125	36130	50 %	50 %	0 %	0 %	284176329
48	NC_013748	GA	3	6	36158	36163	50 %	0 %	50 %	0 %	284176329
49	NC_013748	CT	3	6	36822	36827	0 %	50 %	0 %	50 %	284176329
50	NC_013748	TG	3	6	37130	37135	0 %	50 %	50 %	0 %	284176330
51	NC_013748	AG	3	6	38350	38355	50 %	0 %	50 %	0 %	284176331
52	NC_013748	CG	3	6	39229	39234	0 %	0 %	50 %	50 %	284176333
53	NC_013748	GC	3	6	39397	39402	0 %	0 %	50 %	50 %	284176334
54	NC_013748	CG	3	6	40371	40376	0 %	0 %	50 %	50 %	284176337
55	NC_013748	GA	3	6	40793	40798	50 %	0 %	50 %	0 %	284176338
56	NC_013748	CG	3	6	40805	40810	0 %	0 %	50 %	50 %	284176338
57	NC_013748	TC	3	6	41340	41345	0 %	50 %	0 %	50 %	284176339
58	NC_013748	GC	3	6	41616	41621	0 %	0 %	50 %	50 %	284176340
59	NC_013748	GA	3	6	42319	42324	50 %	0 %	50 %	0 %	284176341
60	NC_013748	AC	3	6	43908	43913	50 %	0 %	0 %	50 %	284176348
61	NC_013748	CG	3	6	44334	44339	0 %	0 %	50 %	50 %	284176348
62	NC_013748	TG	3	6	45194	45199	0 %	50 %	50 %	0 %	284176350
63	NC_013748	TG	3	6	47783	47788	0 %	50 %	50 %	0 %	284176353
64	NC_013748	CG	3	6	49234	49239	0 %	0 %	50 %	50 %	284176355
65	NC_013748	CG	3	6	49523	49528	0 %	0 %	50 %	50 %	284176356
66	NC_013748	CG	3	6	49746	49751	0 %	0 %	50 %	50 %	284176356
67	NC_013748	CT	3	6	50416	50421	0 %	50 %	0 %	50 %	284176360
68	NC_013748	GC	3	6	52105	52110	0 %	0 %	50 %	50 %	284176364
69	NC_013748	TC	3	6	53168	53173	0 %	50 %	0 %	50 %	284176366
70	NC_013748	CG	3	6	53623	53628	0 %	0 %	50 %	50 %	284176368
71	NC_013748	CG	3	6	53735	53740	0 %	0 %	50 %	50 %	284176368
72	NC_013748	CG	3	6	53938	53943	0 %	0 %	50 %	50 %	284176369
73	NC_013748	GA	3	6	55244	55249	50 %	0 %	50 %	0 %	284176372
74	NC_013748	CG	3	6	55466	55471	0 %	0 %	50 %	50 %	284176373
75	NC_013748	CG	3	6	55882	55887	0 %	0 %	50 %	50 %	284176374
76	NC_013748	GC	3	6	56693	56698	0 %	0 %	50 %	50 %	284176374
77	NC_013748	CG	3	6	56816	56821	0 %	0 %	50 %	50 %	284176374
78	NC_013748	CG	3	6	56834	56839	0 %	0 %	50 %	50 %	284176374
79	NC_013748	CG	3	6	57225	57230	0 %	0 %	50 %	50 %	284176374
80	NC_013748	GC	3	6	57262	57267	0 %	0 %	50 %	50 %	284176374
81	NC_013748	CG	3	6	57461	57466	0 %	0 %	50 %	50 %	284176374
82	NC_013748	AG	3	6	57477	57482	50 %	0 %	50 %	0 %	284176374
83	NC_013748	CG	4	8	57936	57943	0 %	0 %	50 %	50 %	284176376
84	NC_013748	GC	3	6	58229	58234	0 %	0 %	50 %	50 %	284176376
85	NC_013748	GT	3	6	58862	58867	0 %	50 %	50 %	0 %	284176376
86	NC_013748	CG	3	6	59002	59007	0 %	0 %	50 %	50 %	284176376
87	NC_013748	TC	3	6	59349	59354	0 %	50 %	0 %	50 %	284176376
88	NC_013748	CG	3	6	60185	60190	0 %	0 %	50 %	50 %	284176377
89	NC_013748	GA	3	6	61253	61258	50 %	0 %	50 %	0 %	284176380
90	NC_013748	TC	3	6	61945	61950	0 %	50 %	0 %	50 %	284176381
91	NC_013748	AC	3	6	62253	62258	50 %	0 %	0 %	50 %	284176382
92	NC_013748	TC	3	6	62781	62786	0 %	50 %	0 %	50 %	284176382
93	NC_013748	CG	3	6	63364	63369	0 %	0 %	50 %	50 %	284176382
94	NC_013748	GA	3	6	63413	63418	50 %	0 %	50 %	0 %	284176382
95	NC_013748	GT	3	6	63851	63856	0 %	50 %	50 %	0 %	284176382
96	NC_013748	CG	3	6	65925	65930	0 %	0 %	50 %	50 %	284176383
97	NC_013748	CG	3	6	67070	67075	0 %	0 %	50 %	50 %	284176385
98	NC_013748	TC	3	6	67933	67938	0 %	50 %	0 %	50 %	284176387
99	NC_013748	CG	3	6	69009	69014	0 %	0 %	50 %	50 %	284176388
100	NC_013748	CG	3	6	69229	69234	0 %	0 %	50 %	50 %	284176388
101	NC_013748	CG	3	6	70554	70559	0 %	0 %	50 %	50 %	284176389
102	NC_013748	GC	3	6	70807	70812	0 %	0 %	50 %	50 %	284176390

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.