MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR04

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013747	GAACG	2	10	3146	3155	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013747	TTCCA	2	10	5392	5401	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013747	TTCAG	2	10	12239	12248	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013747	TTATC	2	10	12497	12506	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013747	TCCCG	2	10	40098	40107	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_013747	TGAAT	2	10	41018	41027	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013747	CGCGA	2	10	56336	56345	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_013747	CGCGG	2	10	59896	59905	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_013747	ATCCA	2	10	64403	64412	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_013747	CGCTC	2	10	71189	71198	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_013747	CAGGG	2	10	72582	72591	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013747	CACGG	2	10	72686	72695	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_013747	TCTAC	2	10	78468	78477	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013747	AGTAC	2	10	82725	82734	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013747	GCACG	2	10	90308	90317	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_013747	ATGAG	2	10	101525	101534	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013747	CGAAC	2	10	105338	105347	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013747	GCGTC	2	10	107079	107088	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013747	GTCGA	2	10	117388	117397	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013747	CACCC	2	10	119476	119485	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
21	NC_013747	GTGGA	2	10	119719	119728	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013747	GCGCG	2	10	136578	136587	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_013747	TCGCG	2	10	145777	145786	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_013747	GTGTC	2	10	145944	145953	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013747	TCAGT	2	10	145954	145963	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013747	GTCGC	2	10	150989	150998	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_013747	GAACC	2	10	152207	152216	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_013747	GATCG	2	10	156252	156261	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013747	CACGG	2	10	156796	156805	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_013747	CGATC	2	10	158365	158374	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_013747	GCCGC	2	10	165509	165518	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_013747	CGGTT	2	10	167717	167726	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.