MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR04

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013747	GTTC	2	8	470	477	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013747	CGGT	2	8	562	569	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013747	CGGT	2	8	616	623	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013747	CGAT	2	8	675	682	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013747	CGCT	2	8	738	745	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013747	TCGC	2	8	820	827	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013747	GGGA	2	8	985	992	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013747	CGAT	2	8	1124	1131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013747	CGTC	2	8	3163	3170	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013747	TCGC	2	8	4834	4841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013747	TCGT	2	8	5275	5282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013747	CCGA	2	8	5432	5439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013747	CGGA	2	8	5451	5458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013747	CGAT	2	8	5533	5540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013747	GACC	2	8	5717	5724	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013747	GATC	2	8	11987	11994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013747	TTCG	2	8	16250	16257	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013747	CGTA	2	8	20578	20585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013747	ACGA	2	8	26127	26134	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013747	TCCG	2	8	27203	27210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013747	TAGT	2	8	27483	27490	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013747	GATG	2	8	28062	28069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013747	CGGT	2	8	29110	29117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013747	AGTT	2	8	30586	30593	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013747	CAGT	2	8	35869	35876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013747	TCGC	2	8	37266	37273	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013747	ATCC	2	8	37963	37970	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013747	TCCC	2	8	40777	40784	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_013747	CGGA	2	8	40808	40815	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013747	AATC	2	8	40995	41002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013747	GCCG	2	8	42524	42531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013747	TCGG	2	8	43496	43503	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013747	GCCG	2	8	54792	54799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013747	ACGA	2	8	54829	54836	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013747	CCGA	2	8	54887	54894	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013747	TCGC	2	8	56293	56300	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013747	CGAG	2	8	57066	57073	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013747	AATA	2	8	57317	57324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013747	GAGC	2	8	61979	61986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013747	TAAC	2	8	63165	63172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013747	CTCG	2	8	63809	63816	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013747	TCGA	2	8	63902	63909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013747	CGAT	2	8	63964	63971	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013747	ATTG	2	8	64011	64018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013747	CCGA	2	8	64065	64072	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013747	ACGG	2	8	65039	65046	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013747	CGGT	2	8	68101	68108	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013747	CGGA	2	8	68220	68227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013747	CTGG	2	8	68710	68717	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013747	CGAA	2	8	68995	69002	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013747	CCGA	2	8	69404	69411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013747	CACG	2	8	69950	69957	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013747	GCCG	2	8	71316	71323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013747	CGTG	2	8	71501	71508	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013747	GAGC	2	8	71516	71523	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013747	GACG	2	8	71584	71591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013747	GCGA	2	8	71626	71633	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013747	AGCG	2	8	71681	71688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013747	CCGG	2	8	71692	71699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013747	TGAC	2	8	72448	72455	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013747	GTTA	2	8	78440	78447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013747	TCGA	2	8	80475	80482	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013747	TCGG	2	8	80485	80492	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013747	TGGT	2	8	82768	82775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013747	GGTC	2	8	83740	83747	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013747	TCGG	2	8	88578	88585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013747	GAAA	2	8	91113	91120	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013747	CGAA	2	8	92072	92079	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013747	ACCC	2	8	92805	92812	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_013747	ACGA	2	8	93081	93088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013747	TCCG	2	8	93817	93824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013747	CGAA	2	8	98245	98252	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013747	CGTC	2	8	100856	100863	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013747	CTCC	2	8	100929	100936	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_013747	TCAA	2	8	101608	101615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013747	ACGA	2	8	101854	101861	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013747	CTCC	3	12	104203	104214	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_013747	GACA	2	8	104381	104388	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013747	TGGT	2	8	104610	104617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013747	CCCT	2	8	105088	105095	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_013747	CCCT	2	8	105246	105253	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_013747	ACGG	2	8	107038	107045	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013747	GTTC	2	8	110961	110968	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013747	CGGT	2	8	113201	113208	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013747	GGTC	2	8	115876	115883	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013747	CCGA	2	8	116039	116046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013747	CCGA	2	8	116062	116069	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013747	CCAT	2	8	119070	119077	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013747	CTCC	2	8	119468	119475	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_013747	CGAC	2	8	119734	119741	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013747	GTCG	2	8	119924	119931	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013747	TCGG	2	8	121503	121510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013747	GTGA	2	8	121620	121627	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013747	GGAT	2	8	123806	123813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013747	GACG	2	8	123945	123952	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_013747	TCGT	2	8	125285	125292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013747	CGGT	2	8	125455	125462	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013747	CTGA	2	8	125510	125517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013747	GTTC	2	8	134991	134998	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013747	GAAC	2	8	135123	135130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013747	AGAC	2	8	136613	136620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013747	AACC	2	8	136682	136689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013747	AGAC	2	8	136878	136885	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013747	TCGA	2	8	137532	137539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013747	TATT	2	8	138647	138654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013747	CGCA	2	8	138887	138894	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013747	CGCC	2	8	140312	140319	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_013747	GTTC	2	8	142486	142493	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013747	ATCG	2	8	142673	142680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013747	GCGG	2	8	144350	144357	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013747	TCGA	2	8	145723	145730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013747	CCGA	2	8	146216	146223	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013747	CGTT	2	8	146928	146935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013747	CGCT	2	8	147150	147157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_013747	GGAA	2	8	150745	150752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013747	CGAA	2	8	150815	150822	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013747	AACG	2	8	150868	150875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013747	ATGA	2	8	152077	152084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013747	ACTC	2	8	152404	152411	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013747	GCTC	2	8	154400	154407	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013747	ATCG	2	8	154716	154723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013747	CGGA	2	8	156702	156709	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013747	GGAC	2	8	158129	158136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013747	CCGT	2	8	158348	158355	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013747	CGGT	2	8	160089	160096	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013747	GTTC	2	8	160218	160225	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013747	CCGA	2	8	161243	161250	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013747	TTCG	2	8	164427	164434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013747	CCGT	2	8	165675	165682	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013747	CTGT	2	8	167051	167058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013747	ACGC	2	8	167514	167521	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.