MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR04

Total Repeats: 431

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013747	TCT	2	6	41	46	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013747	TCG	5	15	136	150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013747	GAC	2	6	174	179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013747	TCA	2	6	395	400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013747	CCG	4	12	507	518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013747	CCG	2	6	525	530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_013747	CGA	2	6	896	901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013747	TAG	2	6	1030	1035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013747	TGC	2	6	1054	1059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013747	CGT	2	6	1092	1097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013747	GCC	2	6	3068	3073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_013747	ACC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_013747	CTA	2	6	4709	4714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013747	CGA	2	6	4759	4764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013747	TCG	3	9	4797	4805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013747	GGC	2	6	4823	4828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013747	CGT	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013747	GCC	2	6	4862	4867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_013747	CGG	2	6	4881	4886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013747	CTG	2	6	4945	4950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013747	GCG	2	6	5009	5014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013747	GTT	2	6	5056	5061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013747	CCG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_013747	CGA	2	6	5416	5421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013747	CGA	2	6	5496	5501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013747	ATT	2	6	5569	5574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013747	GCC	2	6	5593	5598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013747	GCC	2	6	5685	5690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_013747	CCG	2	6	5703	5708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_013747	CCG	2	6	5735	5740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013747	CGC	2	6	6075	6080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013747	GCC	2	6	8796	8801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013747	TGG	2	6	8933	8938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013747	CTG	2	6	11981	11986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013747	CGT	2	6	12100	12105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013747	GGT	2	6	12197	12202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013747	CCG	2	6	12253	12258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_013747	AAT	2	6	12272	12277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013747	TTC	2	6	12304	12309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013747	ATC	2	6	12349	12354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013747	TAC	2	6	12385	12390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013747	TCG	2	6	12425	12430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013747	ACT	2	6	12485	12490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013747	CGC	2	6	12527	12532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_013747	GGC	2	6	12616	12621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013747	CGT	2	6	12754	12759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013747	CGG	2	6	16229	16234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013747	CCG	2	6	16277	16282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_013747	GCC	2	6	20568	20573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_013747	CGG	2	6	21170	21175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013747	GGT	2	6	21180	21185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013747	GTG	2	6	21186	21191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013747	CGT	2	6	23481	23486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013747	CGG	2	6	23492	23497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013747	CGC	2	6	25132	25137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013747	CGC	2	6	25200	25205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_013747	CGA	2	6	25752	25757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013747	GCC	3	9	25787	25795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013747	CTC	2	6	25836	25841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_013747	CGA	2	6	26108	26113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013747	GCC	2	6	26178	26183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_013747	TAG	2	6	26863	26868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013747	GTA	2	6	26960	26965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013747	ACT	2	6	27043	27048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013747	GCC	2	6	27102	27107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_013747	CGT	2	6	27433	27438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013747	CTC	2	6	28086	28091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_013747	GAG	2	6	28098	28103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013747	CGA	2	6	28156	28161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013747	CGT	2	6	29120	29125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013747	TGC	2	6	29134	29139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013747	TCG	2	6	29160	29165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013747	GGC	2	6	29190	29195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013747	CGA	2	6	29211	29216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013747	CAG	2	6	31556	31561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013747	TGG	2	6	31568	31573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013747	CGT	2	6	31714	31719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013747	TGC	2	6	31746	31751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013747	GGT	2	6	32762	32767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013747	AGG	2	6	32836	32841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013747	AGC	2	6	32860	32865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013747	GAG	2	6	32932	32937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013747	CAC	2	6	34289	34294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_013747	GTC	2	6	35925	35930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013747	GAA	2	6	37149	37154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013747	GCG	2	6	37698	37703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013747	ACC	2	6	37751	37756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_013747	CGT	2	6	37763	37768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013747	ATC	2	6	37895	37900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013747	GGC	2	6	37935	37940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013747	GGA	2	6	38003	38008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013747	CCG	2	6	38027	38032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_013747	GTC	2	6	38807	38812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013747	GAG	2	6	38878	38883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013747	CGG	2	6	40036	40041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013747	ACG	2	6	40052	40057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013747	TCG	2	6	40086	40091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013747	CAG	2	6	40862	40867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013747	ACT	2	6	42409	42414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013747	AGT	2	6	42544	42549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013747	ACG	2	6	42583	42588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013747	CGG	2	6	43483	43488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013747	GTC	2	6	43528	43533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013747	GAT	2	6	44834	44839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013747	GCG	3	9	44842	44850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013747	TGC	2	6	44866	44871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013747	TCG	2	6	54733	54738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013747	ACG	2	6	54871	54876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013747	ACG	2	6	56312	56317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013747	GTG	2	6	56495	56500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013747	CAG	2	6	56967	56972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013747	GCG	3	9	57098	57106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013747	GTC	2	6	57305	57310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013747	TTC	2	6	57398	57403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013747	GGC	2	6	59935	59940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013747	GCG	2	6	59975	59980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013747	GCG	2	6	60027	60032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013747	GTG	2	6	60282	60287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013747	TCG	2	6	60354	60359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013747	CGG	2	6	60433	60438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013747	GTC	3	9	60440	60448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013747	GGC	2	6	63027	63032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013747	AGA	2	6	63055	63060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013747	GTC	2	6	63085	63090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013747	TAG	2	6	63122	63127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013747	CGC	2	6	63179	63184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_013747	GCC	2	6	63617	63622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_013747	CGT	2	6	63631	63636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013747	CCG	3	9	63667	63675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_013747	TAC	2	6	63756	63761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013747	GAC	2	6	63867	63872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013747	CGA	2	6	63876	63881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013747	GTC	2	6	63882	63887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013747	TCG	2	6	63888	63893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013747	GGC	2	6	63949	63954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013747	TCG	2	6	64125	64130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013747	CGG	2	6	64205	64210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013747	CGG	2	6	64256	64261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013747	CAA	2	6	64936	64941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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406	NC_013747	GGT	2	6	152348	152353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
407	NC_013747	GCG	2	6	152562	152567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
408	NC_013747	CGA	2	6	154559	154564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
409	NC_013747	GCC	2	6	154633	154638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
410	NC_013747	CGG	2	6	154690	154695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_013747	CTG	2	6	160021	160026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_013747	ATG	2	6	160035	160040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
413	NC_013747	CCG	2	6	160182	160187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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415	NC_013747	GCT	2	6	161290	161295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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427	NC_013747	CCG	2	6	167750	167755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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431	NC_013747	CCG	2	6	171121	171126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.