MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR04

Total Repeats: 2895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013747	CTC	2	6	197	202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176134
2	NC_013747	TCG	2	6	213	218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176134
3	NC_013747	TCG	2	6	249	254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176134
4	NC_013747	TCG	2	6	330	335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176134
5	NC_013747	CCG	2	6	337	342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176134
6	NC_013747	CTG	3	9	344	352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176134
7	NC_013747	TCG	2	6	363	368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176134
8	NC_013747	GCT	2	6	1300	1305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
9	NC_013747	CGA	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
10	NC_013747	CGC	2	6	1434	1439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176135
11	NC_013747	CGA	2	6	1519	1524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
12	NC_013747	CGT	2	6	1540	1545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
13	NC_013747	ATC	2	6	1556	1561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176135
14	NC_013747	CGA	2	6	1663	1668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
15	NC_013747	CGA	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
16	NC_013747	CGC	2	6	1765	1770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176135
17	NC_013747	CGC	2	6	1782	1787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176135
18	NC_013747	GTC	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
19	NC_013747	GGA	2	6	1801	1806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176135
20	NC_013747	GTT	2	6	1862	1867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284176135
21	NC_013747	CGT	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
22	NC_013747	TCG	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
23	NC_013747	ACG	3	9	1899	1907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
24	NC_013747	AGC	2	6	2028	2033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
25	NC_013747	TCG	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
26	NC_013747	CCT	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176135
27	NC_013747	CGC	2	6	2167	2172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176135
28	NC_013747	GCC	2	6	2251	2256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176135
29	NC_013747	CGA	3	9	2260	2268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
30	NC_013747	GCG	2	6	2295	2300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176135
31	NC_013747	CGG	2	6	2304	2309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176135
32	NC_013747	CGT	2	6	2371	2376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
33	NC_013747	CCG	2	6	2385	2390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176135
34	NC_013747	CGA	2	6	2401	2406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
35	NC_013747	CGC	2	6	2443	2448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176135
36	NC_013747	TCC	2	6	2462	2467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176135
37	NC_013747	GCT	2	6	2485	2490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
38	NC_013747	CGC	2	6	2503	2508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176135
39	NC_013747	GCT	2	6	2545	2550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176135
40	NC_013747	CGA	2	6	2581	2586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176135
41	NC_013747	CTT	2	6	2647	2652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176135
42	NC_013747	CTA	2	6	2992	2997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176135
43	NC_013747	CCT	2	6	3007	3012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176135
44	NC_013747	CGA	2	6	3503	3508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176136
45	NC_013747	CGA	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176136
46	NC_013747	CGA	2	6	3653	3658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176136
47	NC_013747	CGT	2	6	3665	3670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176136
48	NC_013747	GGC	2	6	3671	3676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176136
49	NC_013747	CGT	2	6	3687	3692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176136
50	NC_013747	CCG	2	6	3817	3822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176136
51	NC_013747	CGC	2	6	3833	3838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176136
52	NC_013747	CGA	2	6	3929	3934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176136
53	NC_013747	CGT	2	6	3956	3961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176136
54	NC_013747	CCG	2	6	3981	3986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176136
55	NC_013747	GAG	2	6	4020	4025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176136
56	NC_013747	CGC	2	6	4124	4129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176136
57	NC_013747	TCG	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176136
58	NC_013747	GTC	2	6	4233	4238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176136
59	NC_013747	GAC	2	6	4239	4244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176136
60	NC_013747	CGC	2	6	4335	4340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176136
61	NC_013747	GGC	3	9	4398	4406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176136
62	NC_013747	TCG	2	6	4471	4476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176136
63	NC_013747	AGT	2	6	4481	4486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284176136
64	NC_013747	GCA	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176136
65	NC_013747	CGC	2	6	4647	4652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176136
66	NC_013747	AAC	2	6	4656	4661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284176136
67	NC_013747	CGT	2	6	5194	5199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176137
68	NC_013747	AGG	2	6	5918	5923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176138
69	NC_013747	CGC	2	6	5928	5933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176138
70	NC_013747	CAG	2	6	6126	6131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176139
71	NC_013747	CCG	2	6	6149	6154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176139
72	NC_013747	CGA	2	6	6227	6232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176139
73	NC_013747	CGC	2	6	6329	6334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176139
74	NC_013747	CGA	3	9	6365	6373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176139
75	NC_013747	GCC	2	6	6378	6383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176139
76	NC_013747	CGA	2	6	6518	6523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176139
77	NC_013747	CGT	2	6	6533	6538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176139
78	NC_013747	CGA	2	6	6554	6559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176139
79	NC_013747	GCT	2	6	6603	6608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176139
80	NC_013747	GTC	2	6	6624	6629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176139
81	NC_013747	CGA	2	6	6647	6652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176139
82	NC_013747	GTC	2	6	6705	6710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176139
83	NC_013747	CGG	2	6	6716	6721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176139
84	NC_013747	CCG	2	6	6786	6791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176139
85	NC_013747	CGG	2	6	6796	6801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176139
86	NC_013747	CGA	2	6	6956	6961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176139
87	NC_013747	GCG	2	6	6968	6973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176139
88	NC_013747	TCG	2	6	7063	7068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176139
89	NC_013747	CGT	2	6	7089	7094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176139
90	NC_013747	GGT	2	6	7135	7140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284176140
91	NC_013747	CGT	2	6	7153	7158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176140
92	NC_013747	CGT	2	6	7196	7201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176140
93	NC_013747	CTC	2	6	7202	7207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176140
94	NC_013747	CGA	2	6	7216	7221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176140
95	NC_013747	TCG	2	6	7300	7305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176140
96	NC_013747	TCG	2	6	7326	7331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176140
97	NC_013747	CGG	2	6	7345	7350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176140
98	NC_013747	CGA	2	6	7351	7356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176140
99	NC_013747	CGA	2	6	7420	7425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176140
100	NC_013747	TCG	2	6	7470	7475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176140
101	NC_013747	CGC	2	6	7706	7711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176140
102	NC_013747	ATC	2	6	7716	7721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176140
103	NC_013747	GCG	3	9	7773	7781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176140
104	NC_013747	CGG	2	6	7810	7815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176140
105	NC_013747	CGG	2	6	7852	7857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176140
106	NC_013747	CGT	2	6	7904	7909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176140
107	NC_013747	GCC	3	9	7925	7933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176140
108	NC_013747	GCC	2	6	8103	8108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176140
109	NC_013747	GGA	2	6	8155	8160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176140
110	NC_013747	TCC	2	6	8340	8345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284176140
111	NC_013747	CGG	2	6	8387	8392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176140
112	NC_013747	CAC	2	6	8483	8488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284176140
113	NC_013747	TTC	2	6	8544	8549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284176140
114	NC_013747	CGG	2	6	8585	8590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176140
115	NC_013747	TCG	2	6	8641	8646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176140
116	NC_013747	AGC	2	6	8712	8717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176140
117	NC_013747	CGG	2	6	9020	9025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176141
118	NC_013747	GGC	2	6	9091	9096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284176141
119	NC_013747	ACG	2	6	9102	9107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176141
120	NC_013747	GTC	2	6	9170	9175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176141
121	NC_013747	TAC	2	6	9209	9214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176141
122	NC_013747	CGA	3	9	9265	9273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176141
123	NC_013747	ACT	2	6	9297	9302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284176141
124	NC_013747	CGA	2	6	9370	9375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176141
125	NC_013747	CGA	2	6	9400	9405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176141
126	NC_013747	ACG	2	6	9495	9500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176141
127	NC_013747	CGC	2	6	9508	9513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176141
128	NC_013747	CGA	2	6	9562	9567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176141
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130	NC_013747	CGT	2	6	9730	9735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284176141
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133	NC_013747	CGC	2	6	9928	9933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176141
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496	NC_013747	GCC	2	6	29931	29936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284176160
497	NC_013747	GAC	2	6	30066	30071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176160
498	NC_013747	GAC	2	6	30095	30100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176160
499	NC_013747	CGA	2	6	30193	30198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284176161
500	NC_013747	GAG	2	6	30206	30211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284176161

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