MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR04

Total Repeats: 324

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013747	CG	3	6	74	79	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013747	TC	3	6	153	158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013747	GC	3	6	519	524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013747	GT	3	6	552	557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013747	GC	3	6	788	793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013747	CG	3	6	796	801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013747	TG	3	6	1254	1259	0 %	50 %	50 %	0 %	284176135
8	NC_013747	GC	3	6	2691	2696	0 %	0 %	50 %	50 %	284176135
9	NC_013747	AC	3	6	2784	2789	50 %	0 %	0 %	50 %	284176135
10	NC_013747	GC	3	6	2862	2867	0 %	0 %	50 %	50 %	284176135
11	NC_013747	CT	3	6	3110	3115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013747	GA	3	6	3769	3774	50 %	0 %	50 %	0 %	284176136
13	NC_013747	GA	3	6	4931	4936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013747	TA	3	6	5626	5631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013747	CG	3	6	6595	6600	0 %	0 %	50 %	50 %	284176139
16	NC_013747	CG	3	6	7163	7168	0 %	0 %	50 %	50 %	284176140
17	NC_013747	TC	3	6	7498	7503	0 %	50 %	0 %	50 %	284176140
18	NC_013747	GC	3	6	7834	7839	0 %	0 %	50 %	50 %	284176140
19	NC_013747	CG	3	6	8184	8189	0 %	0 %	50 %	50 %	284176140
20	NC_013747	GC	3	6	8368	8373	0 %	0 %	50 %	50 %	284176140
21	NC_013747	GA	3	6	8756	8761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013747	GC	3	6	9763	9768	0 %	0 %	50 %	50 %	284176141
23	NC_013747	CG	3	6	9988	9993	0 %	0 %	50 %	50 %	284176141
24	NC_013747	GA	3	6	10005	10010	50 %	0 %	50 %	0 %	284176141
25	NC_013747	GC	3	6	10289	10294	0 %	0 %	50 %	50 %	284176142
26	NC_013747	GC	4	8	11899	11906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013747	AT	3	6	11916	11921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013747	TG	3	6	12340	12345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013747	CA	3	6	12913	12918	50 %	0 %	0 %	50 %	284176143
30	NC_013747	GC	4	8	14068	14075	0 %	0 %	50 %	50 %	284176144
31	NC_013747	AG	3	6	14971	14976	50 %	0 %	50 %	0 %	284176145
32	NC_013747	CG	3	6	15554	15559	0 %	0 %	50 %	50 %	284176145
33	NC_013747	GC	3	6	15825	15830	0 %	0 %	50 %	50 %	284176145
34	NC_013747	GC	3	6	16768	16773	0 %	0 %	50 %	50 %	284176146
35	NC_013747	TG	3	6	17581	17586	0 %	50 %	50 %	0 %	284176146
36	NC_013747	CG	3	6	17993	17998	0 %	0 %	50 %	50 %	284176146
37	NC_013747	CG	3	6	18155	18160	0 %	0 %	50 %	50 %	284176147
38	NC_013747	GC	3	6	18611	18616	0 %	0 %	50 %	50 %	284176147
39	NC_013747	GC	3	6	19100	19105	0 %	0 %	50 %	50 %	284176147
40	NC_013747	CG	3	6	19329	19334	0 %	0 %	50 %	50 %	284176147
41	NC_013747	CG	3	6	20268	20273	0 %	0 %	50 %	50 %	284176148
42	NC_013747	CG	3	6	20707	20712	0 %	0 %	50 %	50 %	284176149
43	NC_013747	GC	3	6	21209	21214	0 %	0 %	50 %	50 %	284176150
44	NC_013747	TC	3	6	21218	21223	0 %	50 %	0 %	50 %	284176150
45	NC_013747	GA	3	6	21602	21607	50 %	0 %	50 %	0 %	284176150
46	NC_013747	GC	3	6	22501	22506	0 %	0 %	50 %	50 %	284176150
47	NC_013747	CG	3	6	22608	22613	0 %	0 %	50 %	50 %	284176150
48	NC_013747	TC	3	6	22724	22729	0 %	50 %	0 %	50 %	284176150
49	NC_013747	CG	4	8	23190	23197	0 %	0 %	50 %	50 %	284176150
50	NC_013747	TG	3	6	24180	24185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013747	AC	3	6	24519	24524	50 %	0 %	0 %	50 %	284176152
52	NC_013747	CG	3	6	24697	24702	0 %	0 %	50 %	50 %	284176152
53	NC_013747	CT	3	6	25308	25313	0 %	50 %	0 %	50 %	284176153
54	NC_013747	TC	3	6	25766	25771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013747	CT	3	6	28073	28078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013747	GC	3	6	28287	28292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013747	GC	3	6	28502	28507	0 %	0 %	50 %	50 %	284176158
58	NC_013747	GC	4	8	29067	29074	0 %	0 %	50 %	50 %	284176159
59	NC_013747	GA	3	6	29242	29247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013747	CG	3	6	29646	29651	0 %	0 %	50 %	50 %	284176160
61	NC_013747	GA	3	6	29758	29763	50 %	0 %	50 %	0 %	284176160
62	NC_013747	GA	3	6	30438	30443	50 %	0 %	50 %	0 %	284176161
63	NC_013747	TG	3	6	30638	30643	0 %	50 %	50 %	0 %	284176162
64	NC_013747	CT	3	6	30953	30958	0 %	50 %	0 %	50 %	284176162
65	NC_013747	CT	3	6	31325	31330	0 %	50 %	0 %	50 %	284176162
66	NC_013747	AT	3	6	31800	31805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013747	TC	3	6	31881	31886	0 %	50 %	0 %	50 %	284176163
68	NC_013747	GA	3	6	32882	32887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013747	GA	3	6	34029	34034	50 %	0 %	50 %	0 %	284176164
70	NC_013747	CG	3	6	34799	34804	0 %	0 %	50 %	50 %	284176165
71	NC_013747	CG	3	6	35289	35294	0 %	0 %	50 %	50 %	284176165
72	NC_013747	CG	3	6	35703	35708	0 %	0 %	50 %	50 %	284176165
73	NC_013747	GT	3	6	36296	36301	0 %	50 %	50 %	0 %	284176166
74	NC_013747	CG	3	6	37342	37347	0 %	0 %	50 %	50 %	284176167
75	NC_013747	CG	3	6	37389	37394	0 %	0 %	50 %	50 %	284176167
76	NC_013747	TA	3	6	38829	38834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013747	CG	3	6	39136	39141	0 %	0 %	50 %	50 %	284176170
78	NC_013747	CG	3	6	39327	39332	0 %	0 %	50 %	50 %	284176170
79	NC_013747	GA	3	6	40118	40123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013747	GC	3	6	40560	40565	0 %	0 %	50 %	50 %	284176173
81	NC_013747	AT	3	6	42490	42495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013747	AG	3	6	43084	43089	50 %	0 %	50 %	0 %	284176175
83	NC_013747	GA	3	6	43705	43710	50 %	0 %	50 %	0 %	284176176
84	NC_013747	CG	3	6	43877	43882	0 %	0 %	50 %	50 %	284176176
85	NC_013747	TC	3	6	45199	45204	0 %	50 %	0 %	50 %	284176177
86	NC_013747	CG	3	6	45959	45964	0 %	0 %	50 %	50 %	284176177
87	NC_013747	CT	3	6	46709	46714	0 %	50 %	0 %	50 %	284176178
88	NC_013747	GC	3	6	46896	46901	0 %	0 %	50 %	50 %	284176178
89	NC_013747	GC	3	6	47868	47873	0 %	0 %	50 %	50 %	284176178
90	NC_013747	GT	4	8	48775	48782	0 %	50 %	50 %	0 %	284176179
91	NC_013747	CG	3	6	49099	49104	0 %	0 %	50 %	50 %	284176179
92	NC_013747	GT	3	6	50886	50891	0 %	50 %	50 %	0 %	284176180
93	NC_013747	CG	3	6	51250	51255	0 %	0 %	50 %	50 %	284176180
94	NC_013747	CT	3	6	52744	52749	0 %	50 %	0 %	50 %	284176183
95	NC_013747	GC	3	6	52777	52782	0 %	0 %	50 %	50 %	284176183
96	NC_013747	CG	3	6	53576	53581	0 %	0 %	50 %	50 %	284176185
97	NC_013747	CG	3	6	53903	53908	0 %	0 %	50 %	50 %	284176186
98	NC_013747	GC	3	6	56728	56733	0 %	0 %	50 %	50 %	284176190
99	NC_013747	GA	3	6	56787	56792	50 %	0 %	50 %	0 %	284176190
100	NC_013747	GA	3	6	56973	56978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013747	AT	3	6	57364	57369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013747	GC	3	6	57551	57556	0 %	0 %	50 %	50 %	284176192
103	NC_013747	CG	3	6	58511	58516	0 %	0 %	50 %	50 %	284176192
104	NC_013747	CG	3	6	59743	59748	0 %	0 %	50 %	50 %	284176193
105	NC_013747	TC	3	6	60240	60245	0 %	50 %	0 %	50 %	284176194
106	NC_013747	GC	3	6	61844	61849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013747	GC	4	8	62630	62637	0 %	0 %	50 %	50 %	284176196
108	NC_013747	CG	3	6	62919	62924	0 %	0 %	50 %	50 %	284176196
109	NC_013747	GA	3	6	63100	63105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013747	CG	3	6	63701	63706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013747	GA	3	6	63917	63922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013747	CG	3	6	64196	64201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013747	GA	3	6	64919	64924	50 %	0 %	50 %	0 %	284176198
114	NC_013747	GA	3	6	66485	66490	50 %	0 %	50 %	0 %	284176199
115	NC_013747	GA	3	6	66776	66781	50 %	0 %	50 %	0 %	284176199
116	NC_013747	GA	3	6	67217	67222	50 %	0 %	50 %	0 %	284176199
117	NC_013747	CG	3	6	67289	67294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013747	TC	4	8	68088	68095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013747	TG	3	6	68358	68363	0 %	50 %	50 %	0 %	284176201
120	NC_013747	GC	3	6	68508	68513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013747	TC	3	6	69479	69484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013747	CG	3	6	69897	69902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013747	AG	3	6	70025	70030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013747	GA	3	6	71429	71434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013747	CG	4	8	74629	74636	0 %	0 %	50 %	50 %	284176208
126	NC_013747	CG	3	6	74879	74884	0 %	0 %	50 %	50 %	284176208
127	NC_013747	CG	3	6	75873	75878	0 %	0 %	50 %	50 %	284176209
128	NC_013747	CG	3	6	76120	76125	0 %	0 %	50 %	50 %	284176209
129	NC_013747	CG	4	8	76631	76638	0 %	0 %	50 %	50 %	284176209
130	NC_013747	GC	3	6	76727	76732	0 %	0 %	50 %	50 %	284176209
131	NC_013747	GA	3	6	78285	78290	50 %	0 %	50 %	0 %	284176211
132	NC_013747	GA	3	6	79192	79197	50 %	0 %	50 %	0 %	284176213
133	NC_013747	CG	3	6	79242	79247	0 %	0 %	50 %	50 %	284176213
134	NC_013747	CG	3	6	79395	79400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013747	GA	3	6	79870	79875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013747	GC	3	6	81159	81164	0 %	0 %	50 %	50 %	284176216
137	NC_013747	GA	3	6	82265	82270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013747	TA	3	6	82683	82688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013747	TA	3	6	82708	82713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013747	CG	3	6	83811	83816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013747	GA	4	8	84231	84238	50 %	0 %	50 %	0 %	284176221
142	NC_013747	GA	3	6	86314	86319	50 %	0 %	50 %	0 %	284176222
143	NC_013747	CG	3	6	86739	86744	0 %	0 %	50 %	50 %	284176222
144	NC_013747	CG	3	6	87643	87648	0 %	0 %	50 %	50 %	284176223
145	NC_013747	GC	3	6	88702	88707	0 %	0 %	50 %	50 %	284176225
146	NC_013747	TG	3	6	90555	90560	0 %	50 %	50 %	0 %	284176227
147	NC_013747	GT	3	6	91058	91063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.