MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR03

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013746	AATCCG	2	12	7036	7047	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284172861
2	NC_013746	AAAAGA	2	12	7633	7644	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013746	TCCGGT	2	12	9555	9566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013746	TTGGAG	2	12	10563	10574	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013746	CTGTGT	2	12	11525	11536	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	284172865
6	NC_013746	ACTCCC	2	12	16264	16275	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	284172869
7	NC_013746	CTTCCA	2	12	18432	18443	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	284172871
8	NC_013746	TCGACA	2	12	21957	21968	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284172874
9	NC_013746	GGACGC	2	12	23798	23809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	284172875
10	NC_013746	CGCTGG	2	12	23976	23987	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284172875
11	NC_013746	AATAGA	2	12	27142	27153	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013746	TCTGGT	2	12	29903	29914	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013746	ATTCGG	2	12	30587	30598	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284172879
14	NC_013746	GACGTA	2	12	40908	40919	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284172894
15	NC_013746	TCACGG	2	12	51295	51306	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013746	GCTGTC	2	12	51551	51562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013746	CCTGCC	2	12	55510	55521	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	284172909
18	NC_013746	TAGTCG	2	12	56458	56469	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284172911
19	NC_013746	TCGATA	2	12	61078	61089	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284172917
20	NC_013746	TCCCGG	2	12	61805	61816	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284172917
21	NC_013746	GGGAAT	2	12	64945	64956	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013746	CGTCCG	2	12	65187	65198	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284172919
23	NC_013746	TGGCGT	2	12	67244	67255	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	284172920
24	NC_013746	GAGTTC	2	12	67416	67427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284172920
25	NC_013746	TCGACA	2	12	69128	69139	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013746	GCGCGA	2	12	69500	69511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013746	ATTTGT	2	12	70727	70738	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013746	TCTCTT	2	12	71631	71642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172922
29	NC_013746	GTCACG	2	12	79863	79874	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013746	CATCAC	2	12	81115	81126	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013746	TCGCTC	2	12	81471	81482	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	284172928
32	NC_013746	GTCCCG	2	12	83083	83094	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284172929
33	NC_013746	ATCGCC	2	12	87810	87821	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284172935
34	NC_013746	CCGTGA	2	12	90540	90551	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284172937
35	NC_013746	AGAAAC	2	12	91048	91059	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284172937
36	NC_013746	ACTGGA	2	12	97835	97846	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284172942
37	NC_013746	TCTGAT	2	12	97997	98008	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284172942
38	NC_013746	AGACGA	2	12	106888	106899	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284172951
39	NC_013746	TGAGAG	2	12	108296	108307	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	284172953
40	NC_013746	ATGTTA	2	12	108927	108938	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284172954
41	NC_013746	CGGCTT	2	12	115375	115386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172963
42	NC_013746	CAGATC	2	12	115848	115859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284172963
43	NC_013746	TCGGTG	2	12	116103	116114	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	284172963
44	NC_013746	AGTGAA	2	12	117826	117837	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013746	AGAATC	2	12	119828	119839	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013746	GGTACT	2	12	120557	120568	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013746	ATCTTC	2	12	132072	132083	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	284172989
48	NC_013746	CCTCTC	2	12	138164	138175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_013746	TCCACG	2	12	139233	139244	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284172995
50	NC_013746	TCGTCT	2	12	140184	140195	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013746	GACGAG	2	12	141502	141513	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	284172996
52	NC_013746	CGTTTC	2	12	146262	146273	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013746	GATCGA	2	12	147537	147548	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284173002
54	NC_013746	AGACGT	2	12	152342	152353	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013746	GCTGTC	2	12	152510	152521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013746	GATCGG	2	12	159673	159684	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284173014
57	NC_013746	ACGTCA	2	12	160595	160606	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284173015
58	NC_013746	CACGAA	2	12	163536	163547	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	284173015
59	NC_013746	TCGCTG	2	12	164620	164631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284173016
60	NC_013746	ATCTCG	2	12	166245	166256	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284173016
61	NC_013746	GGCGCT	2	12	167403	167414	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284173017
62	NC_013746	GCTTCC	2	12	168221	168232	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	284173018
63	NC_013746	GAAGCT	2	12	172220	172231	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284173021
64	NC_013746	CGCTGG	2	12	172358	172369	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284173021
65	NC_013746	TATTTA	2	12	174008	174019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013746	ATCGTG	2	12	174441	174452	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	284173023
67	NC_013746	TCACGT	2	12	175866	175877	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284173024
68	NC_013746	ATCGTG	2	12	176366	176377	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013746	AGCAGT	2	12	178688	178699	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284173028

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.