MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR03

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013746	GTTTA	2	10	279	288	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013746	CCGAT	2	10	3083	3092	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013746	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013746	CGTCT	2	10	6378	6387	0 %	40 %	20 %	40 %	284172860
5	NC_013746	AGACC	2	10	8186	8195	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_013746	AACGA	2	10	13134	13143	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013746	CAGAC	2	10	13593	13602	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_013746	TAACA	2	10	13756	13765	60 %	20 %	0 %	20 %	284172868
9	NC_013746	CAGCC	2	10	14290	14299	20 %	0 %	20 %	60 %	284172868
10	NC_013746	GTCTT	2	10	15645	15654	0 %	60 %	20 %	20 %	284172869
11	NC_013746	TGGGG	2	10	24403	24412	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013746	TGTCC	2	10	26106	26115	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_013746	CTAAA	2	10	29052	29061	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013746	GGCGA	2	10	29117	29126	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013746	CTCCG	2	10	29408	29417	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_013746	ATCTT	2	10	29581	29590	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013746	TGGCT	2	10	31318	31327	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013746	ATCGT	2	10	31688	31697	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013746	ATACT	2	10	32193	32202	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013746	TCCAC	2	10	36877	36886	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_013746	GACCG	2	10	39130	39139	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_013746	TTTCT	2	10	46352	46361	0 %	80 %	0 %	20 %	284172899
23	NC_013746	TCTTG	2	10	48027	48036	0 %	60 %	20 %	20 %	284172901
24	NC_013746	GAGCG	2	10	48459	48468	20 %	0 %	60 %	20 %	284172901
25	NC_013746	CCCCT	2	10	48949	48958	0 %	20 %	0 %	80 %	284172901
26	NC_013746	GCACG	2	10	49752	49761	20 %	0 %	40 %	40 %	284172901
27	NC_013746	GAGTG	2	10	49940	49949	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013746	TCGCG	2	10	52897	52906	0 %	20 %	40 %	40 %	284172906
29	NC_013746	TCTCG	2	10	54335	54344	0 %	40 %	20 %	40 %	284172908
30	NC_013746	GGCCG	2	10	56843	56852	0 %	0 %	60 %	40 %	284172911
31	NC_013746	TCGGC	2	10	59700	59709	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_013746	TTCGA	2	10	65737	65746	20 %	40 %	20 %	20 %	284172919
33	NC_013746	CGTCA	2	10	68055	68064	20 %	20 %	20 %	40 %	284172920
34	NC_013746	TTCTG	2	10	71551	71560	0 %	60 %	20 %	20 %	284172922
35	NC_013746	GAAGC	2	10	71587	71596	40 %	0 %	40 %	20 %	284172922
36	NC_013746	CGTCC	2	10	73106	73115	0 %	20 %	20 %	60 %	284172923
37	NC_013746	AGACG	2	10	74543	74552	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013746	CGTTC	2	10	74793	74802	0 %	40 %	20 %	40 %	284172924
39	NC_013746	ATCGG	2	10	74812	74821	20 %	20 %	40 %	20 %	284172924
40	NC_013746	CGTCA	2	10	78386	78395	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_013746	GCTTA	2	10	79122	79131	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013746	TCACT	2	10	80051	80060	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_013746	CGGCG	2	10	82643	82652	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_013746	GTTCG	2	10	89401	89410	0 %	40 %	40 %	20 %	284172936
45	NC_013746	CTGAT	2	10	89847	89856	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013746	ACAGT	2	10	90039	90048	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013746	CGCTG	2	10	90985	90994	0 %	20 %	40 %	40 %	284172937
48	NC_013746	GGTCA	2	10	94408	94417	20 %	20 %	40 %	20 %	284172940
49	NC_013746	TTCCG	2	10	95539	95548	0 %	40 %	20 %	40 %	284172941
50	NC_013746	CGCGA	2	10	95556	95565	20 %	0 %	40 %	40 %	284172941
51	NC_013746	TCGGC	2	10	95684	95693	0 %	20 %	40 %	40 %	284172941
52	NC_013746	AAATC	2	10	97758	97767	60 %	20 %	0 %	20 %	284172942
53	NC_013746	AACCA	2	10	97806	97815	60 %	0 %	0 %	40 %	284172942
54	NC_013746	CCCTC	2	10	101076	101085	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
55	NC_013746	ACGCT	2	10	105620	105629	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
56	NC_013746	AACGG	2	10	108812	108821	40 %	0 %	40 %	20 %	284172954
57	NC_013746	TACGA	2	10	111250	111259	40 %	20 %	20 %	20 %	284172957
58	NC_013746	ACCGA	2	10	112453	112462	40 %	0 %	20 %	40 %	284172959
59	NC_013746	TGACG	2	10	114895	114904	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013746	TGAAG	2	10	120411	120420	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013746	TGTCC	2	10	121506	121515	0 %	40 %	20 %	40 %	284172974
62	NC_013746	ACCTC	2	10	122620	122629	20 %	20 %	0 %	60 %	284172977
63	NC_013746	CGTCT	2	10	123698	123707	0 %	40 %	20 %	40 %	284172978
64	NC_013746	TGCGT	2	10	125911	125920	0 %	40 %	40 %	20 %	284172981
65	NC_013746	TGGGT	2	10	126646	126655	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013746	TCATA	2	10	127379	127388	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013746	GTGCC	2	10	128724	128733	0 %	20 %	40 %	40 %	284172987
68	NC_013746	AGTCA	2	10	129086	129095	40 %	20 %	20 %	20 %	284172987
69	NC_013746	CAAAA	2	10	129622	129631	80 %	0 %	0 %	20 %	284172988
70	NC_013746	GTTCC	2	10	136298	136307	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_013746	AGCGA	2	10	138401	138410	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013746	CGTCC	2	10	138809	138818	0 %	20 %	20 %	60 %	284172995
73	NC_013746	TCAGC	2	10	139849	139858	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_013746	GCGAA	2	10	140777	140786	40 %	0 %	40 %	20 %	284172996
75	NC_013746	TTTCC	2	10	145736	145745	0 %	60 %	0 %	40 %	284173001
76	NC_013746	TCCGC	2	10	146178	146187	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_013746	GAACA	2	10	146679	146688	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013746	TCATC	2	10	146779	146788	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_013746	CTCGT	2	10	148102	148111	0 %	40 %	20 %	40 %	284173002
80	NC_013746	TACAA	2	10	148528	148537	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013746	TCGAT	2	10	150937	150946	20 %	40 %	20 %	20 %	284173005
82	NC_013746	CGAGG	2	10	152399	152408	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013746	GCAGC	2	10	154551	154560	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_013746	TGCGG	2	10	154630	154639	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013746	CTCCC	2	10	155831	155840	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
86	NC_013746	TCCAC	2	10	156627	156636	20 %	20 %	0 %	60 %	284173012
87	NC_013746	ACTCA	2	10	157250	157259	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_013746	GTCGG	2	10	159456	159465	0 %	20 %	60 %	20 %	284173014
89	NC_013746	ACGAG	2	10	159739	159748	40 %	0 %	40 %	20 %	284173014
90	NC_013746	GGATG	2	10	159850	159859	20 %	20 %	60 %	0 %	284173014
91	NC_013746	ATGTC	2	10	160020	160029	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013746	TCGCG	2	10	161926	161935	0 %	20 %	40 %	40 %	284173015
93	NC_013746	TCGTG	2	10	167817	167826	0 %	40 %	40 %	20 %	284173017
94	NC_013746	ATCGG	2	10	169955	169964	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013746	GAACG	2	10	172334	172343	40 %	0 %	40 %	20 %	284173021
96	NC_013746	TGTCG	2	10	174608	174617	0 %	40 %	40 %	20 %	284173023
97	NC_013746	ATGAA	2	10	174784	174793	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013746	GTTTC	2	10	175092	175101	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_013746	ATAAA	2	10	175231	175240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013746	GGACG	2	10	176223	176232	20 %	0 %	60 %	20 %	284173024
101	NC_013746	TCACT	2	10	176751	176760	20 %	40 %	0 %	40 %	284173025
102	NC_013746	GATCC	2	10	177642	177651	20 %	20 %	20 %	40 %	284173026
103	NC_013746	GTCGT	2	10	178716	178725	0 %	40 %	40 %	20 %	284173028

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.