MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR03

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013746	GTTTA	2	10	279	288	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013746	CCGAT	2	10	3083	3092	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013746	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013746	AGACC	2	10	8186	8195	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_013746	AACGA	2	10	13134	13143	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013746	CAGAC	2	10	13593	13602	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_013746	TGGGG	2	10	24403	24412	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013746	TGTCC	2	10	26106	26115	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_013746	CTAAA	2	10	29052	29061	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013746	GGCGA	2	10	29117	29126	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013746	CTCCG	2	10	29408	29417	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_013746	ATCTT	2	10	29581	29590	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013746	TGGCT	2	10	31318	31327	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013746	ATCGT	2	10	31688	31697	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013746	ATACT	2	10	32193	32202	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013746	TCCAC	2	10	36877	36886	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_013746	GACCG	2	10	39130	39139	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013746	GAGTG	2	10	49940	49949	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013746	TCGGC	2	10	59700	59709	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_013746	AGACG	2	10	74543	74552	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013746	CGTCA	2	10	78386	78395	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_013746	GCTTA	2	10	79122	79131	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013746	TCACT	2	10	80051	80060	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_013746	CGGCG	2	10	82643	82652	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_013746	CTGAT	2	10	89847	89856	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013746	ACAGT	2	10	90039	90048	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013746	CCCTC	2	10	101076	101085	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
28	NC_013746	ACGCT	2	10	105620	105629	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_013746	TGACG	2	10	114895	114904	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013746	TGAAG	2	10	120411	120420	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013746	TGGGT	2	10	126646	126655	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013746	TCATA	2	10	127379	127388	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_013746	GTTCC	2	10	136298	136307	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_013746	AGCGA	2	10	138401	138410	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013746	TCAGC	2	10	139849	139858	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_013746	TCCGC	2	10	146178	146187	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_013746	GAACA	2	10	146679	146688	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013746	TCATC	2	10	146779	146788	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_013746	TACAA	2	10	148528	148537	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013746	CGAGG	2	10	152399	152408	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013746	GCAGC	2	10	154551	154560	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013746	TGCGG	2	10	154630	154639	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_013746	CTCCC	2	10	155831	155840	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
44	NC_013746	ACTCA	2	10	157250	157259	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_013746	ATGTC	2	10	160020	160029	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013746	ATCGG	2	10	169955	169964	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013746	ATGAA	2	10	174784	174793	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013746	GTTTC	2	10	175092	175101	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013746	ATAAA	2	10	175231	175240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.