MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR03

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013746	CGTCT	2	10	6378	6387	0 %	40 %	20 %	40 %	284172860
2	NC_013746	TAACA	2	10	13756	13765	60 %	20 %	0 %	20 %	284172868
3	NC_013746	CAGCC	2	10	14290	14299	20 %	0 %	20 %	60 %	284172868
4	NC_013746	GTCTT	2	10	15645	15654	0 %	60 %	20 %	20 %	284172869
5	NC_013746	TTTCT	2	10	46352	46361	0 %	80 %	0 %	20 %	284172899
6	NC_013746	TCTTG	2	10	48027	48036	0 %	60 %	20 %	20 %	284172901
7	NC_013746	GAGCG	2	10	48459	48468	20 %	0 %	60 %	20 %	284172901
8	NC_013746	CCCCT	2	10	48949	48958	0 %	20 %	0 %	80 %	284172901
9	NC_013746	GCACG	2	10	49752	49761	20 %	0 %	40 %	40 %	284172901
10	NC_013746	TCGCG	2	10	52897	52906	0 %	20 %	40 %	40 %	284172906
11	NC_013746	TCTCG	2	10	54335	54344	0 %	40 %	20 %	40 %	284172908
12	NC_013746	GGCCG	2	10	56843	56852	0 %	0 %	60 %	40 %	284172911
13	NC_013746	TTCGA	2	10	65737	65746	20 %	40 %	20 %	20 %	284172919
14	NC_013746	CGTCA	2	10	68055	68064	20 %	20 %	20 %	40 %	284172920
15	NC_013746	TTCTG	2	10	71551	71560	0 %	60 %	20 %	20 %	284172922
16	NC_013746	GAAGC	2	10	71587	71596	40 %	0 %	40 %	20 %	284172922
17	NC_013746	CGTCC	2	10	73106	73115	0 %	20 %	20 %	60 %	284172923
18	NC_013746	CGTTC	2	10	74793	74802	0 %	40 %	20 %	40 %	284172924
19	NC_013746	ATCGG	2	10	74812	74821	20 %	20 %	40 %	20 %	284172924
20	NC_013746	GTTCG	2	10	89401	89410	0 %	40 %	40 %	20 %	284172936
21	NC_013746	CGCTG	2	10	90985	90994	0 %	20 %	40 %	40 %	284172937
22	NC_013746	GGTCA	2	10	94408	94417	20 %	20 %	40 %	20 %	284172940
23	NC_013746	TTCCG	2	10	95539	95548	0 %	40 %	20 %	40 %	284172941
24	NC_013746	CGCGA	2	10	95556	95565	20 %	0 %	40 %	40 %	284172941
25	NC_013746	TCGGC	2	10	95684	95693	0 %	20 %	40 %	40 %	284172941
26	NC_013746	AAATC	2	10	97758	97767	60 %	20 %	0 %	20 %	284172942
27	NC_013746	AACCA	2	10	97806	97815	60 %	0 %	0 %	40 %	284172942
28	NC_013746	AACGG	2	10	108812	108821	40 %	0 %	40 %	20 %	284172954
29	NC_013746	TACGA	2	10	111250	111259	40 %	20 %	20 %	20 %	284172957
30	NC_013746	ACCGA	2	10	112453	112462	40 %	0 %	20 %	40 %	284172959
31	NC_013746	TGTCC	2	10	121506	121515	0 %	40 %	20 %	40 %	284172974
32	NC_013746	ACCTC	2	10	122620	122629	20 %	20 %	0 %	60 %	284172977
33	NC_013746	CGTCT	2	10	123698	123707	0 %	40 %	20 %	40 %	284172978
34	NC_013746	TGCGT	2	10	125911	125920	0 %	40 %	40 %	20 %	284172981
35	NC_013746	GTGCC	2	10	128724	128733	0 %	20 %	40 %	40 %	284172987
36	NC_013746	AGTCA	2	10	129086	129095	40 %	20 %	20 %	20 %	284172987
37	NC_013746	CAAAA	2	10	129622	129631	80 %	0 %	0 %	20 %	284172988
38	NC_013746	CGTCC	2	10	138809	138818	0 %	20 %	20 %	60 %	284172995
39	NC_013746	GCGAA	2	10	140777	140786	40 %	0 %	40 %	20 %	284172996
40	NC_013746	TTTCC	2	10	145736	145745	0 %	60 %	0 %	40 %	284173001
41	NC_013746	CTCGT	2	10	148102	148111	0 %	40 %	20 %	40 %	284173002
42	NC_013746	TCGAT	2	10	150937	150946	20 %	40 %	20 %	20 %	284173005
43	NC_013746	TCCAC	2	10	156627	156636	20 %	20 %	0 %	60 %	284173012
44	NC_013746	GTCGG	2	10	159456	159465	0 %	20 %	60 %	20 %	284173014
45	NC_013746	ACGAG	2	10	159739	159748	40 %	0 %	40 %	20 %	284173014
46	NC_013746	GGATG	2	10	159850	159859	20 %	20 %	60 %	0 %	284173014
47	NC_013746	TCGCG	2	10	161926	161935	0 %	20 %	40 %	40 %	284173015
48	NC_013746	TCGTG	2	10	167817	167826	0 %	40 %	40 %	20 %	284173017
49	NC_013746	GAACG	2	10	172334	172343	40 %	0 %	40 %	20 %	284173021
50	NC_013746	TGTCG	2	10	174608	174617	0 %	40 %	40 %	20 %	284173023
51	NC_013746	GGACG	2	10	176223	176232	20 %	0 %	60 %	20 %	284173024
52	NC_013746	TCACT	2	10	176751	176760	20 %	40 %	0 %	40 %	284173025
53	NC_013746	GATCC	2	10	177642	177651	20 %	20 %	20 %	40 %	284173026
54	NC_013746	GTCGT	2	10	178716	178725	0 %	40 %	40 %	20 %	284173028

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.