MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR03

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013746	GCCG	2	8	772	779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013746	TGGA	2	8	1493	1500	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013746	CGTA	2	8	1630	1637	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013746	CGGC	2	8	2956	2963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013746	GATG	2	8	3056	3063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013746	ACGA	2	8	3279	3286	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013746	AAGA	2	8	3870	3877	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013746	GGTC	2	8	4850	4857	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013746	CTGT	2	8	4931	4938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013746	CGTG	2	8	4985	4992	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013746	GAAA	2	8	5204	5211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013746	GAAA	2	8	5587	5594	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013746	TAAC	2	8	7447	7454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013746	CGAA	2	8	7494	7501	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013746	TCGA	2	8	7869	7876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013746	AAAC	2	8	8556	8563	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013746	CGGC	2	8	9647	9654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013746	AACT	2	8	10026	10033	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013746	AACT	2	8	10276	10283	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013746	GCTA	2	8	11597	11604	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013746	GTCG	2	8	12616	12623	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013746	CTTC	2	8	12728	12735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013746	CGAG	2	8	12754	12761	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013746	ACCG	2	8	12870	12877	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013746	AAAC	2	8	13247	13254	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013746	GATC	2	8	15082	15089	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013746	CGGT	2	8	16647	16654	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013746	GCCG	2	8	16663	16670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013746	TTCA	2	8	17195	17202	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013746	GAAG	2	8	18034	18041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013746	TAGC	2	8	18969	18976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013746	TACC	2	8	19078	19085	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013746	TTTC	2	8	20154	20161	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013746	TGAC	2	8	20253	20260	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013746	CACC	2	8	21283	21290	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_013746	AACC	2	8	21514	21521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013746	CGGT	2	8	22457	22464	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013746	ACTG	2	8	22761	22768	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013746	ATGA	2	8	23032	23039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013746	GCGT	2	8	23170	23177	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013746	CCGA	2	8	23436	23443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013746	TCAA	2	8	23470	23477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013746	ATTA	2	8	24309	24316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013746	AGGA	2	8	24667	24674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013746	TGAC	2	8	24911	24918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013746	TCAC	2	8	25321	25328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013746	GTCT	2	8	25330	25337	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013746	TGAC	2	8	25603	25610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013746	CGAT	2	8	25627	25634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013746	CCGA	2	8	25792	25799	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013746	CTGT	2	8	26053	26060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013746	GCCA	2	8	26296	26303	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013746	CACG	2	8	26388	26395	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013746	TTCA	2	8	26567	26574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013746	CGTG	2	8	26794	26801	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013746	TCCA	2	8	27031	27038	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013746	CGAA	2	8	28879	28886	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013746	GCCG	2	8	28950	28957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013746	CGCT	2	8	30318	30325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013746	AACC	2	8	30839	30846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013746	GCCA	2	8	31118	31125	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013746	TCGG	2	8	31878	31885	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013746	CGTC	2	8	33085	33092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013746	CACC	2	8	34370	34377	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_013746	GTAC	2	8	34466	34473	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013746	TCGG	2	8	34527	34534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013746	GTCG	2	8	34768	34775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013746	TCGA	2	8	34824	34831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013746	ACGG	2	8	35967	35974	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013746	ATCG	2	8	36749	36756	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013746	TGTA	2	8	37822	37829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013746	AAGA	2	8	37941	37948	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013746	TTCG	2	8	39007	39014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013746	TCGT	2	8	39038	39045	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013746	ACAG	2	8	43307	43314	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013746	GTCG	2	8	43357	43364	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013746	TACC	2	8	43767	43774	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013746	CAAC	2	8	44035	44042	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013746	TCGC	2	8	44508	44515	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013746	GTAT	2	8	44718	44725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013746	GCCA	2	8	44841	44848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013746	ACGG	2	8	44861	44868	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013746	ATTG	2	8	44904	44911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013746	TAGG	2	8	45374	45381	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013746	TCAG	2	8	45906	45913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013746	TAGA	2	8	53034	53041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013746	TTCT	2	8	53604	53611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013746	CAAC	2	8	53626	53633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013746	AACT	2	8	58598	58605	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013746	ATAA	2	8	58895	58902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013746	AACA	2	8	59047	59054	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013746	TGAC	2	8	59719	59726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013746	GGCC	2	8	59801	59808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013746	TGCT	2	8	60591	60598	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_013746	TAGA	2	8	63681	63688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013746	GAAT	2	8	63755	63762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013746	TGAT	2	8	63907	63914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013746	ATTT	2	8	63949	63956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013746	CCTC	2	8	64298	64305	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_013746	ACGT	2	8	64307	64314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013746	CCAG	2	8	65025	65032	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013746	CTGC	2	8	65063	65070	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013746	TCAG	2	8	66237	66244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013746	TAAG	2	8	66252	66259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013746	GTGC	2	8	66327	66334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013746	TCGA	2	8	66356	66363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013746	GCCG	2	8	68925	68932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013746	CCAT	2	8	69049	69056	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013746	ACCG	2	8	69282	69289	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013746	TGCC	2	8	69332	69339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013746	CGAA	2	8	70991	70998	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013746	CGGA	2	8	72424	72431	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013746	GAAA	2	8	72437	72444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013746	GTGA	2	8	72453	72460	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013746	CAAG	2	8	73609	73616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013746	AACG	2	8	73913	73920	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013746	TCCG	2	8	74330	74337	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013746	CCGT	2	8	74424	74431	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013746	CGGA	2	8	74577	74584	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013746	TGCA	2	8	74717	74724	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013746	CGCC	2	8	76171	76178	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_013746	CGAG	2	8	76844	76851	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013746	GAGC	2	8	77043	77050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013746	GTCG	2	8	79033	79040	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013746	CGAG	2	8	79364	79371	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013746	GCAC	2	8	79975	79982	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013746	GAAG	2	8	80015	80022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013746	CGAC	2	8	80227	80234	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013746	GCTG	2	8	80538	80545	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013746	TCGA	2	8	82824	82831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013746	GAGC	2	8	83756	83763	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013746	GCGA	2	8	83768	83775	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013746	TCGC	2	8	83918	83925	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013746	GACG	2	8	84094	84101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013746	ACGA	2	8	84191	84198	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013746	TTCG	2	8	85192	85199	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013746	ACTC	2	8	85508	85515	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013746	GACC	2	8	86085	86092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013746	TCGA	2	8	86267	86274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013746	CCTT	2	8	87940	87947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013746	CATA	2	8	88028	88035	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013746	CCCA	2	8	88448	88455	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_013746	GTCA	2	8	88807	88814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013746	GACG	2	8	88914	88921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013746	GTGC	2	8	90056	90063	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013746	GAAC	2	8	92158	92165	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013746	GGTG	2	8	92215	92222	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013746	GTAT	2	8	92480	92487	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013746	TCCA	2	8	92492	92499	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013746	TCGG	2	8	92556	92563	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013746	CGTT	2	8	92576	92583	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_013746	CGGA	2	8	96038	96045	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_013746	TGAT	2	8	96206	96213	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013746	CTAA	2	8	96980	96987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_013746	AATT	2	8	97230	97237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.