MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR03

Total Repeats: 1666

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013746	CAG	2	6	406	411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172855
2	NC_013746	CGA	2	6	456	461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172855
3	NC_013746	CGA	2	6	825	830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172856
4	NC_013746	TCC	2	6	837	842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172856
5	NC_013746	GCC	2	6	949	954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172856
6	NC_013746	GAC	3	9	970	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172856
7	NC_013746	GAT	2	6	994	999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172856
8	NC_013746	CTC	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172856
9	NC_013746	CTG	2	6	2238	2243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172857
10	NC_013746	CCT	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172857
11	NC_013746	GCC	2	6	2382	2387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172857
12	NC_013746	GAG	2	6	2411	2416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172857
13	NC_013746	GAG	2	6	2420	2425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172857
14	NC_013746	CGC	2	6	2426	2431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172857
15	NC_013746	GTA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172857
16	NC_013746	TGG	2	6	2461	2466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172857
17	NC_013746	GCC	2	6	2485	2490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172857
18	NC_013746	TGT	2	6	2562	2567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284172857
19	NC_013746	TGC	2	6	2643	2648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172857
20	NC_013746	GTC	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172858
21	NC_013746	GTC	2	6	3402	3407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172858
22	NC_013746	CTC	2	6	3410	3415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172858
23	NC_013746	GGA	2	6	3448	3453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172858
24	NC_013746	GTT	2	6	3461	3466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284172858
25	NC_013746	CCA	2	6	3486	3491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172858
26	NC_013746	TGA	2	6	3639	3644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172858
27	NC_013746	AAC	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172859
28	NC_013746	GAA	2	6	4291	4296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172859
29	NC_013746	CAA	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172859
30	NC_013746	AGC	2	6	4350	4355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172859
31	NC_013746	TTA	2	6	4414	4419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172859
32	NC_013746	TTC	2	6	4454	4459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172859
33	NC_013746	ACC	2	6	4472	4477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172859
34	NC_013746	ATT	2	6	4501	4506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172859
35	NC_013746	ATG	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172859
36	NC_013746	CGA	2	6	4596	4601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172859
37	NC_013746	CGT	2	6	4644	4649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172859
38	NC_013746	GAA	2	6	5844	5849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172860
39	NC_013746	AGC	2	6	5923	5928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172860
40	NC_013746	CTC	2	6	5964	5969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172860
41	NC_013746	ACG	2	6	5989	5994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172860
42	NC_013746	TTC	2	6	6045	6050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172860
43	NC_013746	CCG	2	6	6078	6083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172860
44	NC_013746	CGT	2	6	6134	6139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172860
45	NC_013746	CGG	2	6	6172	6177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172860
46	NC_013746	CGG	2	6	6288	6293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172860
47	NC_013746	TCG	2	6	6328	6333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172860
48	NC_013746	CTC	2	6	6357	6362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172860
49	NC_013746	GGA	2	6	6393	6398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172860
50	NC_013746	GGT	2	6	6534	6539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172860
51	NC_013746	GTA	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172860
52	NC_013746	TCG	2	6	6649	6654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172860
53	NC_013746	TCG	2	6	6658	6663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172860
54	NC_013746	TCG	2	6	6742	6747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172860
55	NC_013746	TTA	2	6	6833	6838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172861
56	NC_013746	TTC	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172861
57	NC_013746	CAG	2	6	6895	6900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172861
58	NC_013746	CGA	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172861
59	NC_013746	AAC	2	6	8655	8660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172862
60	NC_013746	GGA	2	6	8770	8775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172862
61	NC_013746	CGG	2	6	8800	8805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172862
62	NC_013746	GAA	2	6	8968	8973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172862
63	NC_013746	CCG	2	6	8977	8982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172862
64	NC_013746	ATC	2	6	8994	8999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172862
65	NC_013746	GCG	2	6	9014	9019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172862
66	NC_013746	ATG	2	6	9292	9297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172863
67	NC_013746	CGA	3	9	9315	9323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172863
68	NC_013746	GAG	2	6	9370	9375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172863
69	NC_013746	GAG	2	6	10878	10883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172864
70	NC_013746	CAA	2	6	10940	10945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172864
71	NC_013746	ATG	2	6	10977	10982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172864
72	NC_013746	TGA	2	6	11054	11059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172864
73	NC_013746	TCT	2	6	11078	11083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172864
74	NC_013746	ATC	2	6	11088	11093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172864
75	NC_013746	GCA	2	6	11105	11110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172864
76	NC_013746	GTT	2	6	11217	11222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284172864
77	NC_013746	GTT	2	6	11398	11403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284172865
78	NC_013746	TCT	2	6	11411	11416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172865
79	NC_013746	GAG	2	6	11487	11492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172865
80	NC_013746	TGG	2	6	11543	11548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172865
81	NC_013746	TTA	2	6	11642	11647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284172866
82	NC_013746	ACA	2	6	11730	11735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284172866
83	NC_013746	CGA	2	6	12085	12090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172866
84	NC_013746	GTG	2	6	12232	12237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172867
85	NC_013746	CGG	2	6	12260	12265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172867
86	NC_013746	GCG	2	6	12284	12289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172867
87	NC_013746	GGT	2	6	13722	13727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172868
88	NC_013746	ATG	2	6	13847	13852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172868
89	NC_013746	CAG	2	6	13870	13875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172868
90	NC_013746	TTC	2	6	13951	13956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172868
91	NC_013746	TCG	2	6	14063	14068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172868
92	NC_013746	TTC	2	6	14086	14091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172868
93	NC_013746	TCT	2	6	14231	14236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172868
94	NC_013746	CGT	2	6	14277	14282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172868
95	NC_013746	TCC	2	6	14372	14377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172868
96	NC_013746	GCA	2	6	14393	14398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172868
97	NC_013746	CGC	3	9	14465	14473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172868
98	NC_013746	CAT	2	6	14496	14501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172868
99	NC_013746	GAT	2	6	14559	14564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172868
100	NC_013746	CTA	2	6	14685	14690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172868
101	NC_013746	CTT	2	6	14730	14735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172868
102	NC_013746	GGA	2	6	14808	14813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172868
103	NC_013746	GTC	2	6	15182	15187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172869
104	NC_013746	CGG	3	9	15193	15201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172869
105	NC_013746	TCG	2	6	15288	15293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172869
106	NC_013746	CGA	2	6	15335	15340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172869
107	NC_013746	CGA	2	6	15388	15393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172869
108	NC_013746	ACC	3	9	15415	15423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284172869
109	NC_013746	CGA	2	6	15433	15438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172869
110	NC_013746	CGT	2	6	15541	15546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172869
111	NC_013746	CGA	2	6	15613	15618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172869
112	NC_013746	CGT	2	6	15633	15638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172869
113	NC_013746	CGA	2	6	15676	15681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172869
114	NC_013746	CGG	2	6	15772	15777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172869
115	NC_013746	GGA	2	6	15853	15858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172869
116	NC_013746	CTG	2	6	15863	15868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172869
117	NC_013746	GTA	2	6	15929	15934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284172869
118	NC_013746	CCG	2	6	15942	15947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172869
119	NC_013746	TCC	2	6	15972	15977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172869
120	NC_013746	GAA	2	6	15995	16000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172869
121	NC_013746	TCT	2	6	16039	16044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284172869
122	NC_013746	GAG	2	6	16076	16081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284172869
123	NC_013746	CCT	2	6	16087	16092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284172869
124	NC_013746	CAT	2	6	16094	16099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284172869
125	NC_013746	CGA	2	6	16106	16111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172869
126	NC_013746	ACG	2	6	16224	16229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172869
127	NC_013746	CGA	2	6	16318	16323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172869
128	NC_013746	AGA	2	6	16366	16371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284172869
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130	NC_013746	GAC	2	6	16442	16447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172869
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249	NC_013746	GAC	2	6	35300	35305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284172886
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251	NC_013746	GCG	2	6	35346	35351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284172886
252	NC_013746	TGG	2	6	35440	35445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284172886
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498	NC_013746	TCG	2	6	57190	57195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172911
499	NC_013746	CGC	2	6	57269	57274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284172911
500	NC_013746	TCG	2	6	57320	57325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284172911

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