MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR02

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013745	TCCGG	2	10	426	435	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_013745	AACAA	2	10	2407	2416	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013745	TCTCC	2	10	9033	9042	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4	NC_013745	GTTCG	2	10	10974	10983	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013745	GACCG	2	10	11083	11092	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_013745	TTTCG	2	10	24628	24637	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013745	CCGTC	2	10	34768	34777	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_013745	GATCG	2	10	44317	44326	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013745	GACCG	2	10	44384	44393	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_013745	GTACG	2	10	47380	47389	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013745	CGGAT	2	10	56172	56181	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013745	TCTGC	2	10	62953	62962	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_013745	TTCCG	2	10	69363	69372	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013745	GACGG	2	10	78405	78414	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013745	GACGG	2	10	78472	78481	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013745	TCGTT	2	10	79409	79418	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013745	CCGAA	2	10	85693	85702	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013745	TCCGC	2	10	85801	85810	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_013745	CGCCC	2	10	86988	86997	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
20	NC_013745	TTCCG	2	10	89887	89896	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_013745	TCGAC	2	10	91183	91192	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_013745	GGTCT	2	10	94844	94853	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013745	TCCGA	2	10	97915	97924	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_013745	CTCGA	2	10	97995	98004	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_013745	GTCCC	2	10	98421	98430	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_013745	CGCTC	2	10	108010	108019	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_013745	CCAAT	2	10	113401	113410	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_013745	CAACT	2	10	114277	114286	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_013745	TCGCC	2	10	117848	117857	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_013745	AAACA	2	10	122208	122217	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013745	CGTCG	2	10	128519	128528	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_013745	GGTGG	2	10	128703	128712	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013745	CGGTG	2	10	131821	131830	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013745	TCGTC	2	10	132413	132422	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_013745	TGCTG	2	10	135442	135451	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_013745	TCTCT	2	10	138044	138053	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_013745	TCGGT	2	10	138142	138151	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013745	GACGA	2	10	138210	138219	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013745	CGCGC	2	10	138589	138598	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
40	NC_013745	CCGAC	2	10	139075	139084	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_013745	GTGCG	2	10	141930	141939	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013745	GCTAT	2	10	145414	145423	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_013745	CATAT	2	10	146557	146566	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013745	GAACA	2	10	147418	147427	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013745	TGCGG	2	10	157185	157194	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013745	ATCGA	2	10	158114	158123	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013745	GCGCC	2	10	161536	161545	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NC_013745	CGGTG	2	10	162473	162482	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013745	GAATG	2	10	164474	164483	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013745	AATAG	2	10	164603	164612	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013745	ACCGT	2	10	173284	173293	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_013745	TTCTG	2	10	184037	184046	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013745	CGGTG	2	10	188683	188692	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013745	GCTAT	2	10	188950	188959	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013745	CCGAG	2	10	193846	193855	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_013745	GGATC	2	10	199015	199024	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013745	CAGTA	2	10	204723	204732	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013745	TCGTG	2	10	205292	205301	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013745	GTTCG	2	10	207481	207490	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013745	AAGAT	2	10	207918	207927	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013745	ACAGG	2	10	215252	215261	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013745	ACGCG	2	10	218820	218829	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_013745	ACTGA	2	10	222430	222439	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013745	AAGGT	2	10	222727	222736	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013745	CTGGT	2	10	224000	224009	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013745	ACGCG	2	10	229465	229474	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_013745	CATCT	2	10	234184	234193	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_013745	ACGAC	2	10	234246	234255	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_013745	AGTAC	2	10	238348	238357	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_013745	AGATT	2	10	239366	239375	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013745	ACGCG	2	10	239820	239829	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_013745	GACGG	2	10	239842	239851	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013745	CGATC	2	10	239985	239994	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_013745	GACCG	2	10	240712	240721	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_013745	ATCCC	2	10	254917	254926	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_013745	AGTCG	2	10	267640	267649	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_013745	CGCGC	2	10	268060	268069	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_013745	GCATC	2	10	268514	268523	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_013745	CAGTA	2	10	268922	268931	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013745	TCGAT	2	10	271453	271462	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013745	GACAT	2	10	274857	274866	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013745	TACGG	2	10	287972	287981	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013745	TACAC	2	10	316874	316883	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_013745	AACGC	2	10	319184	319193	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_013745	TCCGT	2	10	319648	319657	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_013745	CGAAC	2	10	320396	320405	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_013745	TCCGA	2	10	330670	330679	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_013745	CGTTT	2	10	330853	330862	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013745	CGGTT	2	10	340021	340030	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_013745	TCCGA	2	10	340116	340125	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_013745	GCTCG	2	10	340573	340582	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_013745	TCGAA	2	10	342083	342092	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013745	GTGAG	2	10	358196	358205	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013745	TCGCG	2	10	360343	360352	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_013745	GGTCT	2	10	364354	364363	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013745	TACAA	2	10	368438	368447	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_013745	TCAGT	2	10	368575	368584	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_013745	ACGCG	2	10	378318	378327	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_013745	GCCCA	2	10	387365	387374	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_013745	GAAAT	2	10	387520	387529	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013745	GAAAT	2	10	387642	387651	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013745	CTTCC	2	10	388529	388538	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
103	NC_013745	ACGAG	2	10	391568	391577	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_013745	GCACT	2	10	403606	403615	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.