MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR02

Total Repeats: 417

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013745	TTCT	2	8	82	89	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013745	GGTC	2	8	128	135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013745	CGTT	2	8	500	507	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013745	GATC	2	8	2358	2365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013745	CCGT	2	8	3522	3529	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013745	ATTT	2	8	3655	3662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013745	CCGC	2	8	6234	6241	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_013745	TTCG	2	8	6246	6253	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013745	ACCG	2	8	7335	7342	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013745	CCGT	2	8	8397	8404	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013745	TCCC	2	8	8943	8950	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_013745	TCAG	2	8	8999	9006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013745	TTAG	2	8	9347	9354	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013745	TCGA	2	8	11128	11135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013745	CGTC	2	8	12242	12249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013745	TTCG	2	8	12559	12566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013745	TGGC	2	8	14225	14232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013745	TCCG	2	8	14281	14288	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013745	CTGA	2	8	16560	16567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013745	GCCG	2	8	17976	17983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013745	GCTC	3	12	18039	18050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013745	CGGC	2	8	18071	18078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013745	TCGA	2	8	30660	30667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013745	CGAA	2	8	32794	32801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013745	GTCC	2	8	32886	32893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013745	AATA	2	8	35209	35216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013745	CGAC	2	8	39577	39584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013745	ACCG	2	8	39616	39623	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013745	AGGA	2	8	43625	43632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013745	CGCC	2	8	43801	43808	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_013745	CGAT	2	8	43907	43914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013745	CGAT	2	8	43946	43953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013745	TCGG	2	8	44037	44044	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013745	CGAA	2	8	44111	44118	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013745	GAGC	2	8	44189	44196	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013745	CGCA	2	8	45175	45182	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013745	GACC	2	8	46899	46906	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013745	ACGG	2	8	46957	46964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013745	AATT	2	8	56048	56055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013745	TCGA	2	8	56443	56450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013745	TCGG	2	8	58368	58375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013745	ACGA	2	8	58510	58517	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013745	TCGA	2	8	58531	58538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013745	GACC	2	8	60844	60851	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013745	ATCG	2	8	63017	63024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013745	TCGT	2	8	65942	65949	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013745	CGGG	2	8	66062	66069	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013745	TACA	2	8	66385	66392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013745	CTGT	2	8	66497	66504	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013745	ACCG	2	8	66520	66527	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013745	GACG	2	8	74089	74096	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013745	GTCG	2	8	74321	74328	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013745	ACGG	2	8	75907	75914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013745	AGCG	2	8	78299	78306	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013745	CGAC	2	8	78504	78511	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013745	GTCC	2	8	79358	79365	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013745	TCGA	2	8	80938	80945	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013745	GTCG	2	8	82421	82428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013745	GTAC	2	8	82451	82458	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013745	GAGG	2	8	87060	87067	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013745	GCCC	2	8	87144	87151	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_013745	ACGC	2	8	87188	87195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013745	GTCC	2	8	89875	89882	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013745	AGAT	2	8	94730	94737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013745	GACT	2	8	94814	94821	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013745	ATCG	2	8	98399	98406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013745	ACCG	2	8	98569	98576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013745	GGCT	2	8	105512	105519	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013745	TAAT	2	8	107110	107117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013745	AGTG	2	8	107263	107270	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013745	ATCA	2	8	107297	107304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_013745	GACT	2	8	107713	107720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013745	CCGA	2	8	107729	107736	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013745	GCTT	2	8	107897	107904	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013745	CACG	2	8	107996	108003	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013745	CGTC	2	8	108268	108275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013745	GTCC	2	8	108660	108667	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013745	CGAT	2	8	108681	108688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013745	GGAC	2	8	109019	109026	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013745	GCCC	2	8	109797	109804	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_013745	TCGA	2	8	109865	109872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013745	GCGA	2	8	110416	110423	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013745	ATCC	2	8	112418	112425	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013745	CTGG	2	8	113029	113036	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013745	CAAG	2	8	113671	113678	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013745	CAGC	2	8	114067	114074	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013745	ATCG	2	8	114922	114929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013745	GAGT	2	8	115240	115247	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013745	CAGA	2	8	116876	116883	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013745	GAAT	2	8	117383	117390	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013745	TTTA	2	8	117516	117523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013745	AAAC	2	8	117532	117539	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_013745	TAGT	2	8	117633	117640	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013745	CCGG	2	8	117681	117688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013745	CCCG	2	8	119009	119016	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_013745	TGAC	2	8	119077	119084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013745	TTAC	2	8	120037	120044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013745	TAGA	2	8	121020	121027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013745	ATTC	2	8	121883	121890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013745	GTCC	2	8	122668	122675	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013745	ACGG	2	8	122888	122895	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013745	CGTC	2	8	123162	123169	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013745	GCCA	2	8	123377	123384	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013745	GATC	2	8	123794	123801	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013745	TTCG	2	8	123816	123823	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013745	AGCG	2	8	125278	125285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013745	GGAG	2	8	125303	125310	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013745	CGCC	2	8	125863	125870	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_013745	TCGA	2	8	125921	125928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013745	TGGC	2	8	128226	128233	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013745	TGTT	2	8	128578	128585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013745	CCAG	2	8	129570	129577	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013745	CGCT	2	8	129583	129590	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013745	TATC	2	8	130935	130942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013745	ATCT	2	8	131504	131511	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013745	CGTG	2	8	131772	131779	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013745	AACG	2	8	132832	132839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013745	CTTG	2	8	134194	134201	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013745	GGCT	2	8	135429	135436	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013745	TTCC	2	8	136040	136047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013745	GTGA	2	8	136091	136098	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013745	AACT	2	8	136788	136795	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013745	GAAG	2	8	137891	137898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013745	CCAT	2	8	138885	138892	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013745	TCGC	2	8	139124	139131	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013745	CAGT	2	8	139244	139251	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013745	TGAG	2	8	139262	139269	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013745	ACCG	2	8	139865	139872	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013745	ACCG	2	8	140723	140730	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013745	GTCG	2	8	141696	141703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013745	TCGA	2	8	141752	141759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013745	GATG	2	8	142113	142120	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013745	GTGG	2	8	143426	143433	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013745	TCTG	2	8	143504	143511	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013745	TCAG	2	8	143514	143521	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013745	CGGC	2	8	143748	143755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013745	GCAA	2	8	144566	144573	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013745	TGCG	2	8	145145	145152	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013745	TTGA	2	8	145438	145445	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013745	AGGT	2	8	145477	145484	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013745	CCCG	2	8	146013	146020	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
142	NC_013745	ATTC	2	8	146436	146443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013745	ATGA	2	8	148095	148102	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013745	ATCG	2	8	152756	152763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013745	CTCG	2	8	153087	153094	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013745	CTCA	2	8	153172	153179	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_013745	AGTG	2	8	154781	154788	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013745	GTCG	2	8	155289	155296	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_013745	TGAC	2	8	155590	155597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_013745	CGTG	2	8	155601	155608	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013745	CATC	2	8	156125	156132	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_013745	AAGC	2	8	156693	156700	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_013745	TCTA	2	8	156984	156991	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_013745	GGTG	3	12	157153	157164	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_013745	CCGA	2	8	158411	158418	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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161	NC_013745	ATCG	2	8	163476	163483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.