MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013744	TCGAG	2	10	17810	17819	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013744	TCCGA	2	10	20937	20946	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_013744	GGTGA	2	10	33347	33356	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013744	TACCG	2	10	56830	56839	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_013744	TCCGA	2	10	68549	68558	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_013744	CGTCT	2	10	69641	69650	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_013744	AACAA	2	10	72684	72693	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013744	GAGAC	2	10	90396	90405	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013744	GGCGC	2	10	101555	101564	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_013744	CGAGT	2	10	113615	113624	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013744	CCGAC	2	10	113685	113694	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_013744	ACCGA	2	10	151888	151897	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_013744	TTTTC	2	10	164692	164701	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013744	GATCT	2	10	165093	165102	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013744	TAATA	2	10	169360	169369	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013744	ACCCC	2	10	171193	171202	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
17	NC_013744	TCCTA	2	10	173217	173226	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013744	AATCG	2	10	173350	173359	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013744	CGGTC	2	10	178656	178665	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_013744	CACAC	2	10	179481	179490	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_013744	CTGTT	2	10	183656	183665	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013744	GCCAC	2	10	186761	186770	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_013744	CGCGG	2	10	191300	191309	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_013744	TCCCG	2	10	209786	209795	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_013744	GGTAA	2	10	220642	220651	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013744	CGATC	2	10	221148	221157	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_013744	CCTCG	2	10	222180	222189	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_013744	GCGAG	2	10	223816	223825	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013744	ATCGG	2	10	228656	228665	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013744	GAACT	2	10	229284	229293	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013744	GTCGA	2	10	246536	246545	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013744	TTCAG	2	10	251712	251721	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_013744	CGGTG	2	10	259750	259759	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013744	AGCGA	2	10	269655	269664	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013744	ACCGC	2	10	276787	276796	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_013744	CCGAC	2	10	277529	277538	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_013744	TGTGT	2	10	282979	282988	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013744	AGTCT	2	10	289935	289944	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013744	ACTCT	2	10	302198	302207	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_013744	TTCGC	2	10	305651	305660	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_013744	GCCTG	2	10	305737	305746	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013744	GAGGG	2	10	307237	307246	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013744	TCTGA	2	10	320795	320804	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013744	TTATA	2	10	321214	321223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013744	AAAAT	2	10	321372	321381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013744	TCCCT	2	10	321430	321439	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_013744	TTATA	2	10	321964	321973	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013744	TGTCG	2	10	325628	325637	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013744	AGACG	2	10	325860	325869	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013744	ATATA	2	10	326285	326294	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013744	TATCG	2	10	326911	326920	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013744	GAATG	2	10	336326	336335	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013744	AGTAT	2	10	362353	362362	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013744	CGTCT	2	10	363169	363178	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_013744	GAAGC	2	10	363354	363363	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013744	ATACT	2	10	366885	366894	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013744	AGGGG	2	10	367275	367284	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013744	GTTCC	2	10	373724	373733	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_013744	ATCCA	2	10	374898	374907	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_013744	CCGCA	2	10	375015	375024	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_013744	TTCGC	2	10	394374	394383	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_013744	TCGTC	2	10	402477	402486	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_013744	GATTC	2	10	420708	420717	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013744	TCGGA	2	10	433857	433866	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013744	TTCGA	2	10	444947	444956	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013744	GATTT	2	10	468409	468418	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013744	TATTT	2	10	468451	468460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013744	CGAAC	2	10	469218	469227	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_013744	ACAGC	2	10	470834	470843	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_013744	TCGAG	2	10	480412	480421	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_013744	ACTCG	2	10	485225	485234	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_013744	CGACC	2	10	485479	485488	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_013744	CGGCG	2	10	485535	485544	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_013744	GACGG	2	10	487964	487973	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_013744	ATATT	2	10	521887	521896	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013744	GTCTG	2	10	522001	522010	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_013744	AGCCG	2	10	522649	522658	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_013744	CGAAC	2	10	556603	556612	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_013744	CCGGT	2	10	570704	570713	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_013744	CGTCG	2	10	589894	589903	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_013744	GCAGA	2	10	593541	593550	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013744	CGGAC	2	10	594186	594195	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_013744	CGCTC	2	10	594616	594625	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_013744	TCTCT	2	10	599161	599170	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_013744	ACGGG	2	10	600029	600038	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013744	CGTCC	2	10	602011	602020	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
87	NC_013744	TGGAG	2	10	608775	608784	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013744	GATCG	2	10	613180	613189	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013744	TCTAC	2	10	615543	615552	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_013744	GCTCC	2	10	621511	621520	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_013744	TAATG	2	10	637508	637517	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013744	CACCG	2	10	642189	642198	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_013744	GAACG	2	10	643199	643208	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013744	CCGAA	2	10	653538	653547	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_013744	CGACG	2	10	658536	658545	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_013744	ACCCC	2	10	664235	664244	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
97	NC_013744	CGAGC	2	10	669416	669425	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_013744	ATCGG	2	10	674643	674652	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_013744	CACAG	2	10	678523	678532	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_013744	CTCGA	2	10	679715	679724	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.