MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013744	CGTC	2	8	21	28	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013744	AGCA	2	8	2787	2794	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013744	CCGG	2	8	3109	3116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_013744	ACCG	2	8	4412	4419	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013744	CCGA	2	8	4690	4697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013744	GTCG	2	8	4735	4742	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013744	GTTC	2	8	7757	7764	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013744	GTTC	2	8	7772	7779	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013744	ACGA	2	8	7869	7876	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013744	CCGC	2	8	8004	8011	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_013744	TCGG	2	8	10097	10104	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013744	GACG	2	8	10736	10743	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013744	GCAC	2	8	14367	14374	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013744	AATA	2	8	14414	14421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013744	CGGA	2	8	16220	16227	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013744	TCGA	2	8	19869	19876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013744	GTCA	2	8	20910	20917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013744	CGAG	2	8	20959	20966	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013744	GCCG	2	8	21497	21504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013744	GACT	2	8	21565	21572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013744	AATC	2	8	25147	25154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013744	CGAC	2	8	26116	26123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013744	GTCG	2	8	26262	26269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013744	GAGT	2	8	30029	30036	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013744	AGCG	2	8	30172	30179	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013744	TCGG	2	8	31595	31602	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013744	CCGT	2	8	33149	33156	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013744	AACG	2	8	35132	35139	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013744	GTCA	2	8	36164	36171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013744	CTCG	2	8	36294	36301	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013744	GATC	2	8	36324	36331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013744	AAAT	2	8	40741	40748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013744	GCCG	2	8	40750	40757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013744	GAGT	2	8	40760	40767	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013744	CGAA	2	8	43627	43634	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013744	AGTG	2	8	45685	45692	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013744	AAAT	2	8	47336	47343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013744	TCGA	2	8	55680	55687	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013744	CGAT	2	8	58720	58727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013744	AAAT	2	8	59595	59602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013744	GGCC	2	8	62102	62109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013744	CCGT	2	8	62977	62984	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013744	AGCG	2	8	63009	63016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013744	TCGT	2	8	64395	64402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013744	CGGT	2	8	66904	66911	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013744	TGAC	2	8	68489	68496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013744	GTCG	2	8	68641	68648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013744	CGAA	2	8	69710	69717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013744	GTCT	2	8	73860	73867	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013744	CCGA	2	8	74693	74700	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013744	CGTC	2	8	76722	76729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013744	GGAC	2	8	79328	79335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013744	GCGG	2	8	85492	85499	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013744	TCGA	2	8	90029	90036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013744	GTGA	2	8	95256	95263	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013744	ATTT	2	8	96191	96198	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013744	CGAC	2	8	96310	96317	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013744	AACG	2	8	96993	97000	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013744	GCGA	2	8	97004	97011	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013744	AGCG	2	8	97065	97072	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013744	GGCG	2	8	101047	101054	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013744	GCGG	2	8	101312	101319	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013744	CCGA	2	8	101502	101509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013744	GACG	2	8	102369	102376	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013744	TCGG	2	8	102393	102400	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013744	GTCT	2	8	102443	102450	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013744	CGTC	2	8	102468	102475	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013744	TCCG	2	8	102724	102731	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013744	AACG	2	8	102879	102886	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013744	GCGA	2	8	110680	110687	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013744	CAAC	2	8	123393	123400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013744	CGAG	2	8	123755	123762	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013744	CTCG	2	8	125751	125758	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013744	CGGT	2	8	128161	128168	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013744	GCGG	2	8	132667	132674	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013744	GGGC	2	8	134172	134179	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013744	TCGA	2	8	137204	137211	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013744	ATCG	2	8	138594	138601	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013744	CTCG	2	8	138684	138691	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013744	GAAC	2	8	138708	138715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013744	AATA	2	8	142701	142708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013744	CGAC	2	8	144980	144987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013744	GACG	2	8	145160	145167	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013744	CGAG	2	8	145181	145188	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013744	CCGA	2	8	148472	148479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013744	CGGT	2	8	151733	151740	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013744	GAGT	2	8	151944	151951	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013744	CGAG	2	8	154954	154961	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_013744	CGGA	2	8	155038	155045	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013744	CGGG	2	8	155137	155144	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013744	CGAA	2	8	155358	155365	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013744	TCCG	2	8	155367	155374	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013744	ATCG	2	8	159289	159296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013744	CCAT	2	8	159308	159315	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013744	CCGG	2	8	159357	159364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013744	TCCA	2	8	159634	159641	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013744	GCCG	2	8	164705	164712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013744	CCGT	2	8	167744	167751	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013744	ACCC	2	8	172636	172643	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_013744	GGGT	2	8	172833	172840	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013744	TAGA	2	8	172922	172929	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013744	CGAT	2	8	173841	173848	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013744	AGCG	2	8	173965	173972	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_013744	GACT	2	8	174404	174411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013744	ATCG	2	8	174753	174760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013744	GAAA	2	8	175066	175073	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013744	TCGC	2	8	179204	179211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013744	AGCG	2	8	183599	183606	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013744	AGGG	2	8	183621	183628	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013744	CGGG	2	8	185180	185187	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013744	TCGC	2	8	186703	186710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013744	CCGC	2	8	186719	186726	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_013744	CGAC	2	8	189489	189496	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013744	TCGG	2	8	195239	195246	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013744	TTCG	2	8	198474	198481	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013744	TGCG	2	8	198494	198501	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013744	ACGA	2	8	198512	198519	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013744	CGGA	2	8	198639	198646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013744	CACG	2	8	201726	201733	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013744	TGGG	2	8	201772	201779	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013744	ACCG	2	8	202662	202669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013744	AGCC	2	8	205208	205215	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_013744	TTAT	2	8	207041	207048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013744	CAAG	2	8	209526	209533	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013744	TAGC	2	8	210003	210010	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013744	GTTC	2	8	217340	217347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013744	GACG	2	8	218594	218601	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013744	TGCG	2	8	219779	219786	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013744	TATG	2	8	219997	220004	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013744	CTGC	2	8	220309	220316	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013744	CAAA	2	8	220450	220457	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013744	CGCT	2	8	220696	220703	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013744	GACA	2	8	220711	220718	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013744	AGCG	2	8	220768	220775	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_013744	TCGA	2	8	220776	220783	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013744	GGCG	2	8	220824	220831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013744	CGCT	2	8	221005	221012	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013744	TCGC	2	8	221414	221421	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013744	TCGA	2	8	223700	223707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013744	GATG	2	8	223857	223864	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013744	CTTA	2	8	224115	224122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013744	GAGT	2	8	225549	225556	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013744	CCGT	2	8	228623	228630	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013744	GAAT	2	8	228695	228702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013744	GAGT	2	8	228722	228729	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013744	CGGT	2	8	229442	229449	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013744	ACGC	2	8	229535	229542	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_013744	CTGC	2	8	229746	229753	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013744	CTCA	2	8	233165	233172	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013744	TCGG	2	8	233295	233302	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013744	TTCC	2	8	235127	235134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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484	NC_013744	GTCG	2	8	649648	649655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_013744	TGAG	2	8	652183	652190	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
486	NC_013744	ACTC	2	8	652607	652614	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_013744	CGAT	2	8	664344	664351	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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