MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 375

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013744	CA	3	6	2611	2616	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013744	GC	3	6	2780	2785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013744	GA	3	6	4524	4529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013744	TG	3	6	14495	14500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013744	AC	3	6	17544	17549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013744	CT	3	6	21505	21510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013744	TG	3	6	21596	21601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013744	TA	3	6	30190	30195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013744	AG	3	6	33183	33188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013744	GA	3	6	38933	38938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013744	CG	3	6	43747	43752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_013744	AG	3	6	55628	55633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013744	TG	3	6	59019	59024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013744	GA	3	6	59090	59095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013744	AC	3	6	62225	62230	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013744	CG	3	6	62940	62945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013744	AT	3	6	64451	64456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013744	AG	3	6	66236	66241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013744	GC	3	6	66954	66959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013744	AT	3	6	67011	67016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013744	GA	3	6	69653	69658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013744	TA	4	8	72643	72650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013744	GA	3	6	72736	72741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013744	CG	3	6	93765	93770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013744	TA	4	8	95201	95208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013744	GA	3	6	96255	96260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013744	CA	3	6	96287	96292	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013744	GT	3	6	96453	96458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013744	GA	3	6	96590	96595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013744	AG	3	6	96703	96708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013744	GA	3	6	99990	99995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013744	GA	3	6	102173	102178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013744	TC	4	8	102415	102422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013744	GC	3	6	102541	102546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013744	GT	3	6	105679	105684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013744	TA	3	6	105880	105885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013744	TC	3	6	110666	110671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013744	CG	3	6	110703	110708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013744	CG	3	6	113556	113561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013744	AT	3	6	113846	113851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013744	TA	3	6	125859	125864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013744	GC	3	6	130203	130208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013744	AG	3	6	132383	132388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013744	TA	3	6	137239	137244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013744	AC	3	6	151808	151813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013744	GA	3	6	154925	154930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013744	TA	3	6	155507	155512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013744	AG	3	6	159276	159281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013744	GA	3	6	159668	159673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013744	GC	4	8	164841	164848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013744	AG	3	6	165057	165062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013744	AG	3	6	169547	169552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013744	GA	3	6	171023	171028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013744	GA	3	6	172765	172770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013744	GA	3	6	172827	172832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013744	AG	3	6	172865	172870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013744	AG	3	6	172879	172884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013744	GA	3	6	172913	172918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013744	GT	3	6	173194	173199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013744	TC	3	6	173200	173205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013744	TG	3	6	173277	173282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013744	TC	3	6	173324	173329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013744	TG	3	6	173910	173915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013744	TG	3	6	174332	174337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013744	TC	3	6	174346	174351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013744	AT	3	6	174716	174721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013744	AT	3	6	174866	174871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013744	TC	3	6	174946	174951	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013744	TC	4	8	174994	175001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013744	CT	3	6	175025	175030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013744	TC	5	10	179305	179314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_013744	AC	3	6	179362	179367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013744	CG	3	6	180943	180948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013744	GA	3	6	183552	183557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013744	TA	3	6	185192	185197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013744	TG	3	6	185241	185246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013744	TA	3	6	189519	189524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013744	CG	3	6	191287	191292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013744	GA	3	6	198333	198338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013744	TC	3	6	198554	198559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013744	AC	3	6	198647	198652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013744	AT	3	6	201763	201768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013744	CG	3	6	206920	206925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013744	CA	3	6	209654	209659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013744	GC	3	6	209694	209699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013744	CA	3	6	218787	218792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013744	GA	3	6	220966	220971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013744	GT	3	6	220990	220995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013744	GT	3	6	221829	221834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013744	TC	3	6	223877	223882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013744	GT	3	6	226042	226047	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013744	GA	3	6	228580	228585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013744	CT	3	6	228778	228783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013744	TC	3	6	228808	228813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013744	TC	3	6	229212	229217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013744	TC	3	6	229580	229585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013744	TC	3	6	229598	229603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013744	TC	3	6	230040	230045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013744	GA	3	6	230268	230273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013744	TG	3	6	231538	231543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013744	AG	3	6	234954	234959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013744	CT	3	6	235293	235298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013744	TC	4	8	236177	236184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013744	CT	3	6	238641	238646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013744	TC	4	8	241347	241354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013744	AT	3	6	241928	241933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013744	GA	3	6	242818	242823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013744	TG	3	6	242846	242851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013744	AC	3	6	246067	246072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013744	CT	3	6	248249	248254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013744	AC	3	6	248667	248672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013744	AG	3	6	251608	251613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013744	CG	3	6	254619	254624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013744	GT	4	8	255472	255479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013744	AT	3	6	263203	263208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013744	AT	3	6	265131	265136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013744	TA	3	6	265860	265865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013744	AT	3	6	268189	268194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013744	AT	3	6	268212	268217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013744	CA	4	8	268576	268583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013744	AT	3	6	268674	268679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013744	GA	3	6	268780	268785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013744	GA	3	6	268831	268836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013744	TC	3	6	269742	269747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013744	AC	3	6	273035	273040	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013744	CG	3	6	273508	273513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013744	GT	3	6	274968	274973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013744	GC	3	6	276505	276510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013744	GA	3	6	277922	277927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013744	GA	4	8	278094	278101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013744	AT	3	6	279059	279064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013744	CA	3	6	282989	282994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013744	GT	3	6	284024	284029	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013744	TC	3	6	284705	284710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013744	TC	3	6	286836	286841	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013744	GC	3	6	287483	287488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_013744	TC	3	6	289148	289153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013744	CG	3	6	289864	289869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013744	GA	3	6	291575	291580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013744	TA	3	6	291602	291607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013744	GA	3	6	293248	293253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013744	GT	3	6	293320	293325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013744	CG	3	6	299910	299915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013744	AT	3	6	301341	301346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013744	GA	3	6	307663	307668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013744	GA	3	6	312280	312285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013744	AT	3	6	317413	317418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013744	AC	3	6	319838	319843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013744	CT	3	6	320489	320494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013744	GT	3	6	320619	320624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013744	TA	3	6	321732	321737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013744	CT	4	8	321845	321852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_013744	AT	3	6	322388	322393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013744	CG	3	6	322512	322517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.