MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013743	TCGGAG	2	12	7638	7649	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013743	ATTTTC	2	12	36834	36845	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013743	GAATCG	2	12	48386	48397	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013743	ACTTCG	2	12	52856	52867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013743	GACCGC	2	12	75762	75773	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013743	CAGCAC	2	12	130119	130130	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013743	TCGATA	2	12	173590	173601	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013743	CGAGCG	2	12	213794	213805	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013743	GACCGC	2	12	217967	217978	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013743	CGAGAC	2	12	220135	220146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013743	TTTCAC	2	12	231555	231566	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013743	CGATAC	2	12	252787	252798	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013743	TGGGGG	2	12	367930	367941	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013743	GCTGAC	2	12	396997	397008	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013743	TCGCCG	2	12	453769	453780	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013743	CCGGTT	2	12	460625	460636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013743	CGGTCG	2	12	462548	462559	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013743	TCACTT	2	12	463110	463121	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013743	CAGCGG	2	12	475426	475437	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013743	ACGCGT	2	12	512961	512972	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013743	AGTCGG	2	12	533193	533204	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013743	GACGGC	2	12	550868	550879	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013743	TGGGCG	2	12	571471	571482	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013743	GCGTCG	2	12	633788	633799	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013743	CGCGGA	2	12	634071	634082	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013743	ACCCGA	2	12	670432	670443	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013743	CGTCCG	2	12	705452	705463	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013743	CGGCGC	2	12	742428	742439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013743	CGGCGC	2	12	751991	752002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013743	ACTGAA	2	12	759901	759912	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013743	GCCCCA	2	12	772594	772605	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013743	GTTCTC	2	12	812823	812834	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013743	CAGTTC	2	12	826682	826693	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013743	AAGAAC	2	12	892422	892433	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013743	GCGTCG	2	12	912234	912245	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013743	CGTCGA	2	12	936306	936317	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013743	CGGCGA	2	12	936462	936473	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013743	GTTCGA	3	18	937742	937759	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013743	TTTCGC	2	12	995698	995709	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013743	TCGAAC	2	12	1044773	1044784	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013743	CCGCGG	2	12	1071865	1071876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013743	ACCCGT	2	12	1080628	1080639	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013743	CGACGG	2	12	1099108	1099119	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013743	TCGGCG	2	12	1130808	1130819	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013743	GTCCGC	2	12	1145029	1145040	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013743	CGCCGT	2	12	1178533	1178544	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013743	GTCGAT	2	12	1189474	1189485	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013743	CGGCGA	2	12	1202285	1202296	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013743	GGGTCT	2	12	1211311	1211322	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013743	CGGCTC	2	12	1254442	1254453	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013743	CACTAG	2	12	1269163	1269174	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013743	CGCTAG	2	12	1269230	1269241	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013743	TGACTG	2	12	1275661	1275672	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013743	GCTTTC	2	12	1278697	1278708	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013743	TCGTGC	2	12	1299043	1299054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013743	CTAGTA	2	12	1300015	1300026	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013743	GTCCGG	2	12	1313274	1313285	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013743	AGCGGA	2	12	1313932	1313943	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013743	TGACGA	2	12	1336475	1336486	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013743	CGCTGC	2	12	1372712	1372723	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_013743	GTCGCC	2	12	1415618	1415629	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_013743	CGATCT	2	12	1437628	1437639	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013743	GAGCGA	2	12	1438851	1438862	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013743	ATGGAT	2	12	1474757	1474768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013743	ATCGGT	2	12	1484161	1484172	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013743	CGTCAC	2	12	1505925	1505936	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013743	GTCACG	2	12	1526283	1526294	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013743	GCGTCG	2	12	1548217	1548228	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013743	TCGAGA	2	12	1557348	1557359	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013743	CCGTTT	2	12	1612558	1612569	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013743	GAACGT	2	12	1619339	1619350	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013743	AACTAC	2	12	1625876	1625887	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013743	CGCGGG	2	12	1630242	1630253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013743	TCGCCG	2	12	1643014	1643025	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013743	CCGACG	2	12	1645315	1645326	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013743	GACCGA	2	12	1645342	1645353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013743	GCGCCG	2	12	1689615	1689626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_013743	GGTCGC	2	12	1705979	1705990	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013743	GCACGT	2	12	1729856	1729867	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013743	CCGTCG	2	12	1784245	1784256	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013743	GGCGCA	2	12	1797750	1797761	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013743	CTCCCG	2	12	1802011	1802022	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_013743	CTCGCG	2	12	1817875	1817886	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013743	CAGTCG	2	12	1825926	1825937	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013743	CTGCGA	2	12	1858572	1858583	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013743	TCGAAC	2	12	1871393	1871404	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013743	GCGATC	2	12	1883834	1883845	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013743	ACGCGC	2	12	1909120	1909131	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013743	CTAGAT	2	12	1918000	1918011	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013743	AATTCG	2	12	1931335	1931346	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013743	GGGTCG	2	12	1940443	1940454	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013743	AGCGGA	2	12	1962080	1962091	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_013743	ACTCGA	2	12	1964156	1964167	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013743	AACTGA	2	12	1966219	1966230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013743	CTATCG	2	12	2023646	2023657	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013743	ATTCAG	2	12	2029381	2029392	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_013743	GCCGCT	2	12	2034705	2034716	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_013743	TCGCCG	2	12	2052857	2052868	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013743	CTCGGT	2	12	2056624	2056635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013743	TCAGGT	2	12	2058355	2058366	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_013743	CCGAAC	2	12	2065177	2065188	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013743	CGAGCG	2	12	2065256	2065267	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013743	AAGTGA	2	12	2093232	2093243	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013743	CGCGGC	2	12	2120755	2120766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013743	GGAAAC	2	12	2142194	2142205	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_013743	TCCCGC	2	12	2163161	2163172	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_013743	CGGAGT	2	12	2179577	2179588	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013743	CACGTA	2	12	2194027	2194038	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013743	TCACGT	2	12	2220610	2220621	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013743	CCGGCG	2	12	2224203	2224214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013743	TCGCGC	2	12	2260375	2260386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_013743	TACACC	2	12	2291768	2291779	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013743	CGTGAT	2	12	2326579	2326590	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_013743	CGGCTG	2	12	2335084	2335095	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013743	CGTCGC	2	12	2405248	2405259	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013743	ACGATC	2	12	2424863	2424874	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013743	GAAGTC	2	12	2434243	2434254	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_013743	CGGTCG	2	12	2438304	2438315	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013743	CGCCGT	2	12	2455790	2455801	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013743	ACACGA	2	12	2462328	2462339	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013743	ACGCTG	2	12	2468375	2468386	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013743	GGAACG	2	12	2493308	2493319	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_013743	GTTTTC	2	12	2504896	2504907	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_013743	CGGTGC	2	12	2505053	2505064	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013743	GATCGG	2	12	2519369	2519380	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_013743	CGAGTC	2	12	2550457	2550468	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013743	CGAGTC	2	12	2577121	2577132	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013743	TCGCAC	2	12	2610554	2610565	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
129	NC_013743	GGCCCC	2	12	2622857	2622868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_013743	CCTCTG	2	12	2678321	2678332	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013743	GTCGTT	2	12	2679732	2679743	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_013743	GTCGCC	2	12	2689752	2689763	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_013743	CGATCT	2	12	2691286	2691297	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013743	ACCGGA	2	12	2691300	2691311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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137	NC_013743	AAGACA	2	12	2727536	2727547	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_013743	CGGCCG	2	12	2748433	2748444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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142	NC_013743	TTCGAC	2	12	2870435	2870446	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013743	ATCCCG	2	12	2874497	2874508	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013743	ACTTTC	2	12	2913938	2913949	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013743	CGCACA	2	12	2914225	2914236	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
146	NC_013743	GGGTGA	2	12	2947536	2947547	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013743	GCCGTC	2	12	2979679	2979690	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_013743	TTTTCG	2	12	3009853	3009864	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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150	NC_013743	CGATAG	2	12	3036860	3036871	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_013743	CTCCTG	2	12	3060992	3061003	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
152	NC_013743	ACCGAA	2	12	3078549	3078560	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.