MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 71360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013743	GAC	2	6	161	166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
2	NC_013743	CGG	2	6	220	225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163296
3	NC_013743	CGA	2	6	256	261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
4	NC_013743	CGA	2	6	283	288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
5	NC_013743	GCG	2	6	297	302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163296
6	NC_013743	AGG	2	6	321	326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163296
7	NC_013743	CGA	2	6	390	395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
8	NC_013743	TCG	2	6	399	404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
9	NC_013743	CAA	2	6	595	600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284163296
10	NC_013743	GAA	2	6	610	615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163296
11	NC_013743	CGA	2	6	628	633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
12	NC_013743	CGA	2	6	640	645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
13	NC_013743	GCT	2	6	655	660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
14	NC_013743	CCA	2	6	684	689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163296
15	NC_013743	GCC	2	6	704	709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163296
16	NC_013743	CGA	2	6	739	744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
17	NC_013743	GAC	3	9	773	781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
18	NC_013743	CGA	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
19	NC_013743	GAC	3	9	956	964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
20	NC_013743	ACC	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163296
21	NC_013743	GAG	2	6	1127	1132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163296
22	NC_013743	TCT	2	6	1173	1178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163296
23	NC_013743	ACG	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
24	NC_013743	GTC	3	9	1205	1213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
25	NC_013743	TCG	2	6	1239	1244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
26	NC_013743	AGA	2	6	1245	1250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163296
27	NC_013743	GCG	2	6	1251	1256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163296
28	NC_013743	ATC	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163296
29	NC_013743	GAG	3	9	1385	1393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163296
30	NC_013743	ACG	2	6	1410	1415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
31	NC_013743	GCG	2	6	1467	1472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163296
32	NC_013743	CCT	2	6	1549	1554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163296
33	NC_013743	TCG	2	6	1599	1604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
34	NC_013743	CGT	2	6	1648	1653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
35	NC_013743	ATC	2	6	1703	1708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163296
36	NC_013743	GAG	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163296
37	NC_013743	TCA	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163296
38	NC_013743	CGT	3	9	1861	1869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163296
39	NC_013743	GAG	2	6	1922	1927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163296
40	NC_013743	TCC	2	6	1938	1943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163296
41	NC_013743	CGA	2	6	1969	1974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163296
42	NC_013743	ACG	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163297
43	NC_013743	CTC	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163297
44	NC_013743	TCG	2	6	2240	2245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163297
45	NC_013743	GTC	2	6	2281	2286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163297
46	NC_013743	CGA	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163297
47	NC_013743	GAG	2	6	2401	2406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163297
48	NC_013743	TCC	2	6	2435	2440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163297
49	NC_013743	CGT	2	6	2475	2480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163297
50	NC_013743	ACG	2	6	2494	2499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163297
51	NC_013743	TCG	2	6	2537	2542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163297
52	NC_013743	ACG	2	6	2543	2548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163297
53	NC_013743	CGA	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163297
54	NC_013743	CCG	2	6	2981	2986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163298
55	NC_013743	CCG	2	6	3129	3134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163298
56	NC_013743	GAC	2	6	3215	3220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163298
57	NC_013743	GTC	3	9	3222	3230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
58	NC_013743	CGT	2	6	3286	3291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
59	NC_013743	CCG	2	6	3416	3421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163298
60	NC_013743	TTG	2	6	3462	3467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284163298
61	NC_013743	CGA	2	6	3538	3543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163298
62	NC_013743	CGA	2	6	3559	3564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163298
63	NC_013743	GCG	2	6	3622	3627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163298
64	NC_013743	CGC	2	6	3634	3639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163298
65	NC_013743	CGA	2	6	3670	3675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163298
66	NC_013743	GCT	2	6	3683	3688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
67	NC_013743	TCG	3	9	3717	3725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
68	NC_013743	ACG	2	6	3744	3749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163298
69	NC_013743	CGT	2	6	3751	3756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
70	NC_013743	CGT	2	6	3772	3777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
71	NC_013743	CGT	2	6	3785	3790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
72	NC_013743	CGC	2	6	3791	3796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163298
73	NC_013743	CGG	2	6	3826	3831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163298
74	NC_013743	TCG	2	6	3864	3869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
75	NC_013743	TCG	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
76	NC_013743	GTC	2	6	3899	3904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163298
77	NC_013743	GGC	2	6	4268	4273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163299
78	NC_013743	CGT	2	6	4283	4288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
79	NC_013743	GTC	2	6	4314	4319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
80	NC_013743	CCG	2	6	4405	4410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163299
81	NC_013743	TCG	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
82	NC_013743	ACC	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284163299
83	NC_013743	CGG	2	6	4673	4678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163299
84	NC_013743	TGA	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163299
85	NC_013743	CGA	2	6	4814	4819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
86	NC_013743	ACT	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163299
87	NC_013743	CGA	2	6	4829	4834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
88	NC_013743	GAC	2	6	4863	4868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
89	NC_013743	TCG	2	6	4882	4887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
90	NC_013743	GGC	2	6	4952	4957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163299
91	NC_013743	CCT	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163299
92	NC_013743	TCG	2	6	5128	5133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
93	NC_013743	AGA	2	6	5173	5178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163299
94	NC_013743	TGA	2	6	5200	5205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163299
95	NC_013743	ACG	2	6	5218	5223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
96	NC_013743	CGA	2	6	5255	5260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
97	NC_013743	GAA	2	6	5391	5396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163299
98	NC_013743	ACG	2	6	5407	5412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163299
99	NC_013743	GGA	2	6	5516	5521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163299
100	NC_013743	GCT	2	6	5602	5607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
101	NC_013743	AGA	2	6	5629	5634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284163299
102	NC_013743	TCG	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163299
103	NC_013743	CCT	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163300
104	NC_013743	TCG	2	6	6182	6187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163300
105	NC_013743	TCC	2	6	6239	6244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163300
106	NC_013743	CGC	2	6	6339	6344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163300
107	NC_013743	TCG	2	6	6351	6356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163300
108	NC_013743	CAG	2	6	6370	6375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163300
109	NC_013743	CGT	3	9	6396	6404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163300
110	NC_013743	CGT	2	6	6459	6464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163300
111	NC_013743	CGA	2	6	6710	6715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163301
112	NC_013743	GGC	2	6	6776	6781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163301
113	NC_013743	TCC	2	6	6859	6864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163301
114	NC_013743	CGG	2	6	6868	6873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163301
115	NC_013743	CTC	2	6	6942	6947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163301
116	NC_013743	CGA	3	9	6998	7006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163301
117	NC_013743	CGG	2	6	7012	7017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163301
118	NC_013743	CGT	2	6	7019	7024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163301
119	NC_013743	CCG	2	6	7090	7095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163301
120	NC_013743	CGC	2	6	7124	7129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163301
121	NC_013743	CGG	2	6	7157	7162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163301
122	NC_013743	GAG	2	6	7212	7217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284163301
123	NC_013743	CTG	2	6	7247	7252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163301
124	NC_013743	ACG	2	6	7306	7311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163301
125	NC_013743	TCG	2	6	7377	7382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163301
126	NC_013743	TCG	2	6	7399	7404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163301
127	NC_013743	TCT	2	6	7519	7524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284163301
128	NC_013743	TCG	2	6	7738	7743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163302
129	NC_013743	CGA	2	6	7898	7903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163302
130	NC_013743	GCT	2	6	8024	8029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163302
131	NC_013743	CTC	2	6	8118	8123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163302
132	NC_013743	GTA	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163302
133	NC_013743	GGC	2	6	8239	8244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163303
134	NC_013743	GAT	2	6	8256	8261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284163303
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136	NC_013743	TCG	2	6	8347	8352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163303
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141	NC_013743	ATC	2	6	8545	8550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163303
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150	NC_013743	CGA	2	6	8975	8980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163303
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161	NC_013743	TCC	2	6	9688	9693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284163303
162	NC_013743	TCG	2	6	9727	9732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163303
163	NC_013743	GCA	2	6	9742	9747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163303
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252	NC_013743	TCG	2	6	14434	14439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163308
253	NC_013743	CGG	2	6	14474	14479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163308
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257	NC_013743	TCG	2	6	14650	14655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163308
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371	NC_013743	TCG	2	6	19712	19717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163313
372	NC_013743	AGC	2	6	19751	19756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163313
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374	NC_013743	CGC	2	6	19812	19817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284163313
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495	NC_013743	CTG	2	6	27173	27178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163322
496	NC_013743	CGG	2	6	27196	27201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163322
497	NC_013743	GAC	2	6	27365	27370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284163322
498	NC_013743	TCG	2	6	27517	27522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284163323
499	NC_013743	CGG	3	9	27596	27604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284163323
500	NC_013743	CAT	2	6	27624	27629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284163323

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