MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Archaeoglobus profundus DSM 5631 chromosome

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013741	TTTAA	2	10	41720	41729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013741	ACGGA	2	10	81249	81258	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013741	TCAAT	2	10	99042	99051	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013741	TTTAG	2	10	99347	99356	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013741	TTATT	2	10	108099	108108	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013741	TTATT	2	10	108154	108163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013741	AAAAT	2	10	112413	112422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013741	AATTT	2	10	117197	117206	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013741	AGTTG	2	10	129033	129042	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013741	CAGTC	2	10	130155	130164	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_013741	GAATT	2	10	131225	131234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013741	ATTTA	2	10	132043	132052	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013741	TTGAG	2	10	205923	205932	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013741	TTTTC	2	10	246158	246167	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013741	TATGC	2	10	246226	246235	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013741	AACTT	2	10	265375	265384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013741	AATTC	2	10	310464	310473	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013741	GTCCC	2	10	320443	320452	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_013741	GAAAA	2	10	320557	320566	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013741	AAATA	2	10	321796	321805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013741	ATTGC	2	10	325178	325187	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013741	CTTTC	2	10	328582	328591	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_013741	GTTCA	2	10	336660	336669	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013741	AATTG	2	10	338589	338598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013741	ATTTC	2	10	382795	382804	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013741	AGTTG	2	10	409812	409821	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013741	TGAAA	2	10	440122	440131	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013741	TAAAG	2	10	478498	478507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013741	CTTTA	2	10	484977	484986	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013741	GCCCT	2	10	521558	521567	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
31	NC_013741	TCAAT	2	10	525406	525415	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013741	TGTGT	2	10	526486	526495	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013741	ACGAT	2	10	526691	526700	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013741	ACATT	2	10	564690	564699	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013741	AAAAT	2	10	597252	597261	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013741	TAAGG	2	10	646898	646907	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013741	TATAT	2	10	714898	714907	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013741	AAAAT	2	10	715000	715009	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013741	CCTTC	2	10	735791	735800	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_013741	TTACT	2	10	749294	749303	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013741	TTAAT	2	10	766059	766068	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013741	AACAC	2	10	782796	782805	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_013741	GGGGT	2	10	782818	782827	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013741	TACTC	2	10	782939	782948	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_013741	GCTTT	2	10	793461	793470	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013741	TTATT	2	10	797931	797940	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013741	ATTGA	2	10	802265	802274	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013741	CTTTT	2	10	836754	836763	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013741	CAATT	2	10	849811	849820	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013741	TAAAT	2	10	865555	865564	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013741	ATTTT	2	10	898899	898908	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013741	TTCTA	2	10	898912	898921	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013741	TTAAA	2	10	899055	899064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013741	GAGCC	2	10	928003	928012	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_013741	TTAGT	2	10	929616	929625	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013741	TTAAA	2	10	939183	939192	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013741	ATAAA	2	10	958047	958056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013741	TAAGC	2	10	958129	958138	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013741	AGAGA	2	10	958358	958367	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013741	GGCTC	2	10	958418	958427	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_013741	TCGGT	2	10	958433	958442	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013741	TAAGC	2	10	958650	958659	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013741	AGCTA	2	10	963828	963837	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013741	TACCC	2	10	964883	964892	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_013741	TTCTT	2	10	977915	977924	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013741	CTGTA	2	10	988864	988873	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013741	CGACC	2	10	992485	992494	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_013741	GCAAC	2	10	992495	992504	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_013741	CTTTA	2	10	996175	996184	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_013741	GAATT	2	10	999477	999486	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013741	TTAAA	2	10	1002207	1002216	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013741	AAAAT	2	10	1008914	1008923	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013741	ATTAA	2	10	1012374	1012383	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013741	AAAAC	2	10	1030521	1030530	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_013741	ATCAC	2	10	1036580	1036589	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_013741	AAAAT	2	10	1037072	1037081	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013741	CCCGG	2	10	1047463	1047472	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_013741	TTTCC	2	10	1049531	1049540	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_013741	CGAGC	2	10	1049669	1049678	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_013741	ATTTT	2	10	1057339	1057348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013741	TTTTA	2	10	1069037	1069046	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013741	AAATA	2	10	1095991	1096000	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013741	TATTC	2	10	1111459	1111468	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_013741	ATTAT	2	10	1174805	1174814	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013741	TAAGA	2	10	1178261	1178270	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013741	TCACC	2	10	1187236	1187245	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
87	NC_013741	GAAAA	2	10	1194264	1194273	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013741	GTCCC	2	10	1198312	1198321	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_013741	TTAGC	2	10	1198531	1198540	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_013741	CCTCT	2	10	1204978	1204987	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
91	NC_013741	ATGAT	2	10	1213970	1213979	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013741	AGATT	2	10	1236371	1236380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013741	ATTAA	2	10	1287840	1287849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013741	TATAT	2	10	1287985	1287994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013741	ATCCT	2	10	1294853	1294862	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_013741	TTATT	2	10	1317698	1317707	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013741	AGCTA	2	10	1322777	1322786	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_013741	CCGGG	2	10	1365972	1365981	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
99	NC_013741	ACTAA	2	10	1369273	1369282	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_013741	TTATT	2	10	1375759	1375768	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013741	CCGGG	2	10	1375956	1375965	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_013741	AGCGT	2	10	1378443	1378452	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013741	ATTCA	2	10	1406043	1406052	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_013741	AATTG	2	10	1429193	1429202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013741	TGCTA	2	10	1431811	1431820	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013741	ATGCT	2	10	1435580	1435589	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013741	TATTT	2	10	1436660	1436669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013741	ATTTA	2	10	1448357	1448366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013741	GTTTT	2	10	1458850	1458859	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013741	CAAAA	2	10	1477041	1477050	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_013741	GTGAG	2	10	1479406	1479415	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013741	TGAAC	2	10	1500204	1500213	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013741	CAAAT	2	10	1523612	1523621	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_013741	TTAAC	2	10	1536101	1536110	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013741	CAAAA	2	10	1536219	1536228	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013741	GAATA	2	10	1536796	1536805	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013741	AAGCT	2	10	1544276	1544285	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.