MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Archaeoglobus profundus DSM 5631 chromosome

Total Repeats: 370

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013741	CCAT	2	8	4820	4827	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013741	GGAT	2	8	9212	9219	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013741	TTTA	2	8	21585	21592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013741	TCCT	2	8	26924	26931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_013741	GAAG	2	8	27271	27278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013741	AATT	2	8	36687	36694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013741	ATGG	2	8	39518	39525	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013741	ACAA	2	8	40556	40563	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013741	TTAA	2	8	45763	45770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013741	AAGG	2	8	80885	80892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013741	TAAA	2	8	81270	81277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013741	GAAG	2	8	81524	81531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013741	AATT	2	8	81869	81876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013741	GGAT	2	8	81991	81998	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013741	ATGT	2	8	94866	94873	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013741	GATG	2	8	98890	98897	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013741	ATAG	2	8	99222	99229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013741	TTCA	2	8	99265	99272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013741	GTTT	2	8	99315	99322	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013741	AACA	2	8	107313	107320	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013741	TCGT	2	8	107345	107352	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_013741	GTTA	2	8	107381	107388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013741	TTGG	2	8	128994	129001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013741	TAAA	2	8	129012	129019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013741	AGGT	2	8	129991	129998	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013741	GGTA	2	8	130736	130743	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013741	GTCA	2	8	131002	131009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013741	AGCT	2	8	131104	131111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013741	ATCT	2	8	131418	131425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013741	TAGA	2	8	131505	131512	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013741	AATA	2	8	131621	131628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013741	TTCC	2	8	131675	131682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013741	AATA	2	8	132057	132064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013741	TTTG	2	8	154100	154107	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013741	TCTA	2	8	154182	154189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013741	CCTG	2	8	159943	159950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013741	CATG	2	8	182252	182259	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013741	AACG	2	8	182404	182411	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013741	TAAT	2	8	185373	185380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013741	ATGT	2	8	185939	185946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013741	CGAC	2	8	191010	191017	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013741	CATC	2	8	195911	195918	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013741	TGGT	2	8	196316	196323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013741	ACAA	2	8	196874	196881	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013741	TAAA	2	8	202433	202440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013741	TATC	2	8	205312	205319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013741	TTAT	2	8	230391	230398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013741	TAAA	2	8	246268	246275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013741	AAAT	2	8	246553	246560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013741	ATTG	2	8	246572	246579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013741	TTTA	2	8	246658	246665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013741	TAGA	2	8	250113	250120	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013741	ATTT	2	8	260691	260698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013741	TTTA	2	8	267960	267967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013741	ATTT	2	8	286495	286502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013741	ATCT	2	8	288632	288639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013741	CCGG	2	8	293916	293923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013741	TAGA	2	8	293994	294001	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013741	TTCG	2	8	298552	298559	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013741	ATGT	2	8	306976	306983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013741	GGGT	2	8	314020	314027	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013741	AGGG	2	8	314028	314035	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013741	ACCC	2	8	314110	314117	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_013741	TCCC	2	8	320474	320481	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_013741	TCAT	2	8	321931	321938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013741	GGGT	2	8	322142	322149	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013741	CCCT	2	8	322224	322231	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_013741	ACCC	2	8	322232	322239	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_013741	AGTG	2	8	325156	325163	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013741	TGAT	2	8	328676	328683	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013741	ATTA	2	8	328703	328710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013741	TTTG	2	8	330351	330358	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013741	CCAG	2	8	336740	336747	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_013741	GAGG	2	8	338408	338415	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013741	GATC	2	8	338751	338758	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013741	TGGG	2	8	361297	361304	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013741	TACA	2	8	382325	382332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013741	CATA	2	8	382337	382344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013741	ATTT	2	8	382663	382670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013741	TACT	2	8	383069	383076	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013741	TCTT	2	8	383342	383349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013741	TCTT	2	8	383707	383714	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013741	TAAC	2	8	383833	383840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013741	TTAG	2	8	383850	383857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013741	TTAA	2	8	386174	386181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013741	CAAT	2	8	389036	389043	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_013741	GTTT	2	8	402851	402858	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013741	CTTC	2	8	411058	411065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013741	AACT	2	8	411868	411875	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013741	ATCT	2	8	418976	418983	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013741	AGCA	2	8	419110	419117	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013741	ATGA	2	8	419182	419189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013741	CTTG	2	8	419595	419602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013741	TCGC	2	8	427803	427810	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013741	TAAT	2	8	443787	443794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013741	ACCA	2	8	448934	448941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013741	CATA	2	8	452576	452583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013741	CGAA	2	8	466164	466171	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013741	ATCA	2	8	468264	468271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013741	AACA	2	8	478173	478180	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013741	AATA	2	8	479879	479886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013741	TATC	2	8	515357	515364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013741	TTGT	2	8	515422	515429	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013741	GAAA	2	8	515472	515479	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013741	TTTA	2	8	516159	516166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013741	TAAA	2	8	521779	521786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013741	ATGC	2	8	523315	523322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013741	GTAA	2	8	523349	523356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013741	TTCC	2	8	523636	523643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013741	CTTT	2	8	525342	525349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_013741	TTTC	2	8	526422	526429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013741	GTAA	2	8	537999	538006	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013741	TAAA	2	8	552983	552990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013741	CTCC	2	8	564504	564511	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_013741	CAAA	2	8	564785	564792	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013741	AAGA	3	12	565089	565100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013741	TTAT	2	8	565170	565177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013741	TCTA	2	8	568341	568348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013741	CCAC	2	8	571200	571207	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_013741	AGTT	2	8	576047	576054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013741	TCGA	2	8	577428	577435	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013741	GAAA	2	8	592965	592972	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013741	CTAA	2	8	597386	597393	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013741	AAAT	2	8	599700	599707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013741	GATG	2	8	602379	602386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013741	AAAT	2	8	605864	605871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013741	CGAT	2	8	621112	621119	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013741	GGTA	2	8	633374	633381	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013741	TAGT	2	8	640174	640181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013741	TTCA	2	8	640845	640852	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_013741	TTAA	2	8	656579	656586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013741	TAAT	2	8	668886	668893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013741	TGAT	2	8	669166	669173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013741	ATAA	2	8	672793	672800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013741	GTAT	2	8	683601	683608	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013741	GAAT	2	8	688990	688997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013741	TATT	2	8	692235	692242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013741	AAAT	2	8	693739	693746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013741	TCAG	2	8	703697	703704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013741	TGAT	2	8	707086	707093	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013741	AAAG	2	8	707787	707794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013741	GCCC	2	8	707852	707859	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_013741	TAAA	2	8	711498	711505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013741	CTCA	2	8	720508	720515	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_013741	AGTT	2	8	722404	722411	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013741	ATTT	2	8	735778	735785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013741	CTAT	2	8	735814	735821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013741	TAAA	2	8	745513	745520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013741	AAAG	2	8	746010	746017	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013741	TAAA	2	8	747511	747518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013741	TCCC	2	8	752400	752407	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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370	NC_013741	ATTA	2	8	1544163	1544170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.