MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 286

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013740	TCCCT	2	10	1659	1668	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_013740	CTATA	2	10	1761	1770	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013740	AAAAT	2	10	15303	15312	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013740	CCTTT	2	10	17175	17184	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_013740	CCATA	2	10	17221	17230	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_013740	CTATA	2	10	24388	24397	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013740	TCGTG	2	10	25758	25767	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013740	ACAAA	2	10	26357	26366	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013740	TGATG	2	10	26375	26384	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013740	GGGAA	2	10	26759	26768	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013740	GGGCT	2	10	29151	29160	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013740	GGGCG	2	10	29975	29984	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013740	AAGGA	2	10	32487	32496	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013740	CATAC	2	10	45973	45982	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_013740	CTATA	2	10	57423	57432	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013740	TCGTG	2	10	58793	58802	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013740	ACAAA	2	10	59392	59401	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013740	TGATG	2	10	59410	59419	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013740	GGGAA	2	10	59794	59803	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013740	GGGCT	2	10	62187	62196	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013740	GGGCG	2	10	63011	63020	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013740	TTTTA	2	10	64638	64647	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013740	GAAAA	2	10	66261	66270	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013740	AGTAA	2	10	87268	87277	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013740	TATGA	2	10	107441	107450	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013740	AGGAA	2	10	107688	107697	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013740	AAAGA	2	10	108947	108956	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013740	CAAAC	2	10	108958	108967	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_013740	ATGAA	2	10	111733	111742	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013740	TTTCC	2	10	114295	114304	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_013740	ATCTG	2	10	115573	115582	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013740	CTCTT	2	10	117940	117949	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_013740	GTTTT	2	10	119420	119429	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013740	CCCTG	2	10	148111	148120	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_013740	TCCAG	2	10	148180	148189	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_013740	TGACC	2	10	149134	149143	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_013740	GAAAA	2	10	152365	152374	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013740	GCATG	2	10	169488	169497	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013740	ACCAT	2	10	175307	175316	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_013740	TGGAA	2	10	178435	178444	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013740	GCAGT	2	10	185784	185793	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013740	TATAT	2	10	207161	207170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013740	AGTAT	2	10	212102	212111	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013740	CCGGG	2	10	250925	250934	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_013740	ATAAA	2	10	252132	252141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013740	CTTTT	2	10	255183	255192	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013740	GAAAA	2	10	274767	274776	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013740	CAGGG	2	10	278622	278631	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013740	CATGG	2	10	288151	288160	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013740	TCCGG	2	10	288382	288391	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_013740	GGTCT	2	10	288970	288979	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013740	GGAAG	2	10	289461	289470	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013740	ATATA	2	10	297594	297603	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013740	CATTT	2	10	315867	315876	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013740	TCAAT	2	10	332857	332866	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013740	CTTTT	2	10	333188	333197	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013740	TTGTA	2	10	354013	354022	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013740	GAGAA	2	10	359093	359102	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013740	TGAAA	2	10	380077	380086	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013740	ATAAA	2	10	380308	380317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013740	TCGTG	2	10	381562	381571	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013740	ACAAA	2	10	382161	382170	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013740	GGGAA	2	10	382455	382464	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013740	GGGCT	2	10	384848	384857	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013740	AAGGA	2	10	406691	406700	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013740	TATAA	2	10	408807	408816	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013740	GATAT	2	10	416443	416452	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013740	ACAGT	2	10	416561	416570	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013740	AACGA	2	10	434043	434052	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_013740	TGCCG	2	10	435824	435833	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_013740	TATAC	2	10	439795	439804	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013740	CTTTT	2	10	442832	442841	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013740	TTTTA	2	10	462140	462149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013740	AGGAA	2	10	511384	511393	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013740	AAGAA	2	10	516343	516352	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013740	TTTTA	2	10	518963	518972	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013740	TGATA	2	10	526240	526249	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013740	GAAAA	2	10	527485	527494	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013740	GATCC	2	10	530392	530401	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_013740	GTTCC	2	10	530421	530430	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_013740	TTCCT	2	10	565340	565349	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_013740	TTCCG	2	10	570033	570042	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_013740	TTGTT	2	10	578160	578169	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013740	GAAAC	2	10	583414	583423	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013740	TGCTA	2	10	591646	591655	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013740	CATTT	2	10	614185	614194	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_013740	GGATA	2	10	615549	615558	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013740	ACAGG	2	10	627821	627830	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013740	TAAAA	2	10	629932	629941	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013740	TCGTG	2	10	638064	638073	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013740	TTGAA	2	10	638724	638733	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013740	ACAAA	2	10	638890	638899	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013740	GGGAA	2	10	639292	639301	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013740	GGGCT	2	10	641684	641693	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013740	TAAAA	2	10	647937	647946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013740	TTGAT	2	10	682168	682177	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013740	ATTTT	2	10	682193	682202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013740	TATTG	2	10	685683	685692	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013740	CCAGC	2	10	685847	685856	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
100	NC_013740	GTTTT	2	10	690254	690263	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013740	ATATT	2	10	705260	705269	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013740	ATAGA	2	10	712579	712588	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013740	TGAAT	2	10	732489	732498	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013740	AAAAC	2	10	751603	751612	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013740	GGGGA	2	10	752226	752235	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013740	TATAC	2	10	793070	793079	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013740	AATTT	2	10	811379	811388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013740	CAGGG	2	10	818946	818955	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013740	ATAAG	2	10	834430	834439	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013740	TCTTT	2	10	835076	835085	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_013740	TATAC	2	10	842354	842363	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_013740	TAATG	2	10	847607	847616	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013740	TTGAA	2	10	856519	856528	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013740	CTAAA	2	10	857825	857834	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013740	TGGCT	2	10	859944	859953	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013740	TGAAT	2	10	860093	860102	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013740	AATTT	2	10	866293	866302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013740	GTAAA	2	10	872441	872450	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013740	GAACG	2	10	889754	889763	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_013740	CCGGT	2	10	895718	895727	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_013740	AAGGA	2	10	912716	912725	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013740	TCCTT	2	10	920129	920138	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_013740	GGAGT	2	10	935571	935580	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013740	GCAGG	2	10	948658	948667	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013740	AGGGA	2	10	948822	948831	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013740	TAAAA	2	10	951412	951421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013740	TAGAC	2	10	1003281	1003290	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013740	TAGAT	2	10	1003291	1003300	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013740	TAGTT	2	10	1003301	1003310	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013740	CTGTA	2	10	1014305	1014314	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013740	AAAGC	2	10	1022767	1022776	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_013740	ATTAT	2	10	1028901	1028910	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013740	GCAGG	2	10	1050299	1050308	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_013740	CGGAA	2	10	1053674	1053683	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_013740	TGGCC	2	10	1063266	1063275	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_013740	TGACA	2	10	1065389	1065398	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013740	GATGA	2	10	1084150	1084159	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013740	AAAAT	2	10	1086210	1086219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013740	TCAAA	2	10	1086322	1086331	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_013740	AAGTC	2	10	1087263	1087272	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_013740	CACAT	2	10	1087377	1087386	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_013740	ACGGA	2	10	1090755	1090764	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_013740	AAAAT	2	10	1093044	1093053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013740	AAAGG	2	10	1093657	1093666	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013740	GAAAA	2	10	1099095	1099104	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013740	GGACG	2	10	1099519	1099528	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
147	NC_013740	TATAA	2	10	1099757	1099766	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.