MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 4632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013740	CAAA	2	8	1939	1946	75 %	0 %	0 %	25 %	284047388
2	NC_013740	GAAC	2	8	1993	2000	50 %	0 %	25 %	25 %	284047388
3	NC_013740	GCTG	2	8	2789	2796	0 %	25 %	50 %	25 %	284047389
4	NC_013740	CTGG	2	8	2834	2841	0 %	25 %	50 %	25 %	284047389
5	NC_013740	AAGG	2	8	3009	3016	50 %	0 %	50 %	0 %	284047389
6	NC_013740	CCCT	2	8	3018	3025	0 %	25 %	0 %	75 %	284047389
7	NC_013740	GCCG	2	8	3086	3093	0 %	0 %	50 %	50 %	284047389
8	NC_013740	GCCG	2	8	4847	4854	0 %	0 %	50 %	50 %	284047390
9	NC_013740	CCCG	2	8	4984	4991	0 %	0 %	25 %	75 %	284047390
10	NC_013740	CGGA	2	8	5261	5268	25 %	0 %	50 %	25 %	284047390
11	NC_013740	ACCA	2	8	5425	5432	50 %	0 %	0 %	50 %	284047390
12	NC_013740	TTCC	2	8	5663	5670	0 %	50 %	0 %	50 %	284047391
13	NC_013740	CCTT	2	8	5694	5701	0 %	50 %	0 %	50 %	284047391
14	NC_013740	AGGC	2	8	6362	6369	25 %	0 %	50 %	25 %	284047391
15	NC_013740	ACGG	2	8	6401	6408	25 %	0 %	50 %	25 %	284047391
16	NC_013740	GTCC	2	8	6449	6456	0 %	25 %	25 %	50 %	284047391
17	NC_013740	CTCC	2	8	6892	6899	0 %	25 %	0 %	75 %	284047392
18	NC_013740	TCCG	2	8	7287	7294	0 %	25 %	25 %	50 %	284047392
19	NC_013740	GTAT	2	8	7708	7715	25 %	50 %	25 %	0 %	284047394
20	NC_013740	GGAA	2	8	8329	8336	50 %	0 %	50 %	0 %	284047394
21	NC_013740	TGGA	2	8	9133	9140	25 %	25 %	50 %	0 %	284047394
22	NC_013740	TCCT	2	8	10497	10504	0 %	50 %	0 %	50 %	284047396
23	NC_013740	GTTC	2	8	10726	10733	0 %	50 %	25 %	25 %	284047396
24	NC_013740	GGAA	2	8	11933	11940	50 %	0 %	50 %	0 %	284047397
25	NC_013740	GAAG	2	8	12698	12705	50 %	0 %	50 %	0 %	284047397
26	NC_013740	AGCC	2	8	12824	12831	25 %	0 %	25 %	50 %	284047397
27	NC_013740	TGAT	2	8	13051	13058	25 %	50 %	25 %	0 %	284047397
28	NC_013740	ACGG	2	8	13271	13278	25 %	0 %	50 %	25 %	284047397
29	NC_013740	GACC	2	8	13337	13344	25 %	0 %	25 %	50 %	284047397
30	NC_013740	ACGG	2	8	13453	13460	25 %	0 %	50 %	25 %	284047397
31	NC_013740	GAAG	2	8	14049	14056	50 %	0 %	50 %	0 %	284047398
32	NC_013740	CGGA	2	8	14420	14427	25 %	0 %	50 %	25 %	284047399
33	NC_013740	CCGG	2	8	15804	15811	0 %	0 %	50 %	50 %	284047400
34	NC_013740	GGGC	2	8	16225	16232	0 %	0 %	75 %	25 %	284047400
35	NC_013740	AGCC	2	8	16471	16478	25 %	0 %	25 %	50 %	284047400
36	NC_013740	CCAT	2	8	16506	16513	25 %	25 %	0 %	50 %	284047400
37	NC_013740	AGGA	2	8	16959	16966	50 %	0 %	50 %	0 %	284047400
38	NC_013740	GATG	2	8	17995	18002	25 %	25 %	50 %	0 %	284047401
39	NC_013740	GTAC	2	8	18124	18131	25 %	25 %	25 %	25 %	284047401
40	NC_013740	CCAT	2	8	18369	18376	25 %	25 %	0 %	50 %	284047401
41	NC_013740	GCGG	2	8	19182	19189	0 %	0 %	75 %	25 %	284047402
42	NC_013740	GGTG	2	8	19791	19798	0 %	25 %	75 %	0 %	284047403
43	NC_013740	GGAT	2	8	19832	19839	25 %	25 %	50 %	0 %	284047403
44	NC_013740	CGGA	2	8	20102	20109	25 %	0 %	50 %	25 %	284047403
45	NC_013740	GCCC	2	8	21495	21502	0 %	0 %	25 %	75 %	284047405
46	NC_013740	GACA	2	8	21603	21610	50 %	0 %	25 %	25 %	284047405
47	NC_013740	CGGG	2	8	21918	21925	0 %	0 %	75 %	25 %	284047405
48	NC_013740	GGTG	2	8	22467	22474	0 %	25 %	75 %	0 %	284047406
49	NC_013740	GTCT	2	8	22992	22999	0 %	50 %	25 %	25 %	284047408
50	NC_013740	CGGC	2	8	23094	23101	0 %	0 %	50 %	50 %	284047408
51	NC_013740	AAAG	2	8	23420	23427	75 %	0 %	25 %	0 %	284047408
52	NC_013740	TACC	2	8	23435	23442	25 %	25 %	0 %	50 %	284047408
53	NC_013740	TGGC	2	8	23932	23939	0 %	25 %	50 %	25 %	284047409
54	NC_013740	AGCC	2	8	24320	24327	25 %	0 %	25 %	50 %	284047409
55	NC_013740	GCCA	2	8	30643	30650	25 %	0 %	25 %	50 %	284047411
56	NC_013740	GCCG	2	8	30896	30903	0 %	0 %	50 %	50 %	284047411
57	NC_013740	AGGT	2	8	31488	31495	25 %	25 %	50 %	0 %	284047412
58	NC_013740	TGGA	2	8	32724	32731	25 %	25 %	50 %	0 %	284047414
59	NC_013740	CATG	2	8	34911	34918	25 %	25 %	25 %	25 %	284047415
60	NC_013740	GCAT	2	8	35096	35103	25 %	25 %	25 %	25 %	284047415
61	NC_013740	GTCC	2	8	35364	35371	0 %	25 %	25 %	50 %	284047415
62	NC_013740	GCCC	2	8	35499	35506	0 %	0 %	25 %	75 %	284047415
63	NC_013740	GCGG	2	8	35540	35547	0 %	0 %	75 %	25 %	284047415
64	NC_013740	ACGG	2	8	36545	36552	25 %	0 %	50 %	25 %	284047416
65	NC_013740	CTGG	2	8	37509	37516	0 %	25 %	50 %	25 %	284047417
66	NC_013740	AGGG	2	8	37670	37677	25 %	0 %	75 %	0 %	284047417
67	NC_013740	GGCT	2	8	38040	38047	0 %	25 %	50 %	25 %	284047418
68	NC_013740	TGGG	2	8	38193	38200	0 %	25 %	75 %	0 %	284047418
69	NC_013740	GGAC	2	8	39098	39105	25 %	0 %	50 %	25 %	284047418
70	NC_013740	TACC	2	8	39215	39222	25 %	25 %	0 %	50 %	284047418
71	NC_013740	GGAC	2	8	40648	40655	25 %	0 %	50 %	25 %	284047420
72	NC_013740	GGGA	2	8	40729	40736	25 %	0 %	75 %	0 %	284047420
73	NC_013740	AACC	2	8	40966	40973	50 %	0 %	0 %	50 %	284047420
74	NC_013740	ACGA	2	8	41183	41190	50 %	0 %	25 %	25 %	284047420
75	NC_013740	GGCC	2	8	41581	41588	0 %	0 %	50 %	50 %	284047420
76	NC_013740	CTGA	2	8	41972	41979	25 %	25 %	25 %	25 %	284047420
77	NC_013740	CAGC	2	8	42378	42385	25 %	0 %	25 %	50 %	284047420
78	NC_013740	CAGG	2	8	42503	42510	25 %	0 %	50 %	25 %	284047420
79	NC_013740	GATG	2	8	42673	42680	25 %	25 %	50 %	0 %	284047420
80	NC_013740	GATC	2	8	43051	43058	25 %	25 %	25 %	25 %	284047420
81	NC_013740	TGAT	2	8	43647	43654	25 %	50 %	25 %	0 %	284047420
82	NC_013740	TGAC	2	8	44622	44629	25 %	25 %	25 %	25 %	284047420
83	NC_013740	GGCA	2	8	45754	45761	25 %	0 %	50 %	25 %	284047420
84	NC_013740	TATT	2	8	46036	46043	25 %	75 %	0 %	0 %	284047421
85	NC_013740	TGCT	2	8	47124	47131	0 %	50 %	25 %	25 %	284047422
86	NC_013740	GGAG	2	8	47225	47232	25 %	0 %	75 %	0 %	284047422
87	NC_013740	CAGC	2	8	47783	47790	25 %	0 %	25 %	50 %	284047422
88	NC_013740	CGGC	2	8	49806	49813	0 %	0 %	50 %	50 %	284047426
89	NC_013740	CCCA	2	8	49963	49970	25 %	0 %	0 %	75 %	284047426
90	NC_013740	GTCC	2	8	50696	50703	0 %	25 %	25 %	50 %	284047427
91	NC_013740	AAGG	2	8	50910	50917	50 %	0 %	50 %	0 %	284047427
92	NC_013740	ACCG	2	8	51156	51163	25 %	0 %	25 %	50 %	284047427
93	NC_013740	CCAT	2	8	51658	51665	25 %	25 %	0 %	50 %	284047427
94	NC_013740	TGAA	2	8	51709	51716	50 %	25 %	25 %	0 %	284047427
95	NC_013740	GCTG	2	8	52334	52341	0 %	25 %	50 %	25 %	284047427
96	NC_013740	GAAT	2	8	54562	54569	50 %	25 %	25 %	0 %	284047429
97	NC_013740	TGGA	2	8	55910	55917	25 %	25 %	50 %	0 %	284047430
98	NC_013740	GGCT	2	8	57001	57008	0 %	25 %	50 %	25 %	284047431
99	NC_013740	CCGG	2	8	63894	63901	0 %	0 %	50 %	50 %	284047432
100	NC_013740	GCTG	2	8	66969	66976	0 %	25 %	50 %	25 %	284047434
101	NC_013740	CTTT	2	8	67362	67369	0 %	75 %	0 %	25 %	284047435
102	NC_013740	GATG	2	8	67404	67411	25 %	25 %	50 %	0 %	284047435
103	NC_013740	CAGG	2	8	67998	68005	25 %	0 %	50 %	25 %	284047435
104	NC_013740	CAGC	2	8	68655	68662	25 %	0 %	25 %	50 %	284047435
105	NC_013740	TCTG	2	8	68897	68904	0 %	50 %	25 %	25 %	284047436
106	NC_013740	AGGG	2	8	69309	69316	25 %	0 %	75 %	0 %	284047436
107	NC_013740	CTGG	2	8	69670	69677	0 %	25 %	50 %	25 %	284047436
108	NC_013740	CTGG	2	8	70212	70219	0 %	25 %	50 %	25 %	284047437
109	NC_013740	CGGA	2	8	70833	70840	25 %	0 %	50 %	25 %	284047438
110	NC_013740	GGCA	2	8	71117	71124	25 %	0 %	50 %	25 %	284047438
111	NC_013740	ACCA	2	8	71157	71164	50 %	0 %	0 %	50 %	284047438
112	NC_013740	CCTG	2	8	71209	71216	0 %	25 %	25 %	50 %	284047438
113	NC_013740	GGCT	2	8	71571	71578	0 %	25 %	50 %	25 %	284047438
114	NC_013740	TGAG	2	8	71716	71723	25 %	25 %	50 %	0 %	284047438
115	NC_013740	TCTT	2	8	71976	71983	0 %	75 %	0 %	25 %	284047439
116	NC_013740	GCGG	2	8	72087	72094	0 %	0 %	75 %	25 %	284047439
117	NC_013740	GGCA	2	8	72786	72793	25 %	0 %	50 %	25 %	284047439
118	NC_013740	GGAC	2	8	74750	74757	25 %	0 %	50 %	25 %	284047442
119	NC_013740	ACCA	2	8	75676	75683	50 %	0 %	0 %	50 %	284047443
120	NC_013740	GTCC	2	8	76539	76546	0 %	25 %	25 %	50 %	284047444
121	NC_013740	AGAA	2	8	77727	77734	75 %	0 %	25 %	0 %	284047445
122	NC_013740	CCTG	2	8	77881	77888	0 %	25 %	25 %	50 %	284047445
123	NC_013740	TGAG	2	8	77901	77908	25 %	25 %	50 %	0 %	284047445
124	NC_013740	AATG	2	8	77982	77989	50 %	25 %	25 %	0 %	284047445
125	NC_013740	GGAA	2	8	78066	78073	50 %	0 %	50 %	0 %	284047446
126	NC_013740	GAAA	2	8	78264	78271	75 %	0 %	25 %	0 %	284047446
127	NC_013740	TCCT	2	8	78412	78419	0 %	50 %	0 %	50 %	284047446
128	NC_013740	CCGG	2	8	78729	78736	0 %	0 %	50 %	50 %	284047447
129	NC_013740	CCGG	2	8	79383	79390	0 %	0 %	50 %	50 %	284047447
130	NC_013740	CCTG	2	8	79395	79402	0 %	25 %	25 %	50 %	284047447
131	NC_013740	CTTC	2	8	79494	79501	0 %	50 %	0 %	50 %	284047447
132	NC_013740	GCCG	2	8	79642	79649	0 %	0 %	50 %	50 %	284047447
133	NC_013740	TCCT	2	8	79985	79992	0 %	50 %	0 %	50 %	284047448
134	NC_013740	CAGC	2	8	80952	80959	25 %	0 %	25 %	50 %	284047449
135	NC_013740	CGGC	2	8	81003	81010	0 %	0 %	50 %	50 %	284047449
136	NC_013740	CCGG	2	8	81533	81540	0 %	0 %	50 %	50 %	284047449
137	NC_013740	CTGG	2	8	81546	81553	0 %	25 %	50 %	25 %	284047449
138	NC_013740	ATCC	2	8	81970	81977	25 %	25 %	0 %	50 %	284047449
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