MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidaminococcus fermentans DSM 20731 chromosome

Total Repeats: 3933

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013740	AGG	2	6	22	27	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013740	GAT	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013740	CTC	2	6	1395	1400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013740	CCG	2	6	1693	1698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_013740	CTT	2	6	1700	1705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013740	TTC	2	6	1871	1876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013740	CCG	2	6	2636	2641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_013740	TTG	2	6	4182	4187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013740	CTA	2	6	4327	4332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013740	AGG	2	6	4374	4379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013740	GGA	2	6	13634	13639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013740	CGG	2	6	13801	13806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013740	AGG	2	6	13821	13826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013740	CAA	2	6	15203	15208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013740	TAT	2	6	15276	15281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013740	AAC	2	6	15363	15368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013740	TAA	2	6	17329	17334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013740	GAA	2	6	17389	17394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013740	GTT	2	6	17404	17409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013740	AGG	2	6	18648	18653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013740	AGG	2	6	21999	22004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013740	GTT	2	6	24362	24367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013740	CAA	2	6	24438	24443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013740	GTT	2	6	24478	24483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013740	TAT	2	6	24505	24510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013740	TTG	2	6	24558	24563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013740	TGA	2	6	24592	24597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013740	GGC	2	6	24714	24719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013740	TTC	2	6	24752	24757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013740	ACA	2	6	24818	24823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013740	AGA	2	6	24910	24915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013740	TAG	2	6	24936	24941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013740	GAT	2	6	24965	24970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013740	GCA	2	6	25038	25043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013740	CGC	2	6	25085	25090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_013740	TGT	2	6	25124	25129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013740	CAG	2	6	25207	25212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013740	ATT	2	6	25248	25253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013740	GGA	2	6	25397	25402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013740	AGG	2	6	25521	25526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013740	GAA	2	6	25661	25666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013740	CTT	2	6	25713	25718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013740	GGT	2	6	25735	25740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013740	GTC	2	6	25749	25754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013740	TGG	2	6	25827	25832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013740	GGA	2	6	25863	25868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013740	TCA	2	6	25888	25893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013740	TAC	2	6	25921	25926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013740	CAA	2	6	25936	25941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013740	CAC	2	6	26099	26104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013740	GAT	2	6	26170	26175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013740	CCT	2	6	26226	26231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013740	TCG	2	6	26274	26279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013740	AGA	2	6	26350	26355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013740	ACG	2	6	26559	26564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013740	CTA	2	6	26610	26615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013740	CCA	2	6	26730	26735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_013740	GGA	2	6	26797	26802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013740	GCG	2	6	26831	26836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013740	AGG	2	6	26976	26981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013740	ACC	2	6	27034	27039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_013740	CTT	2	6	27055	27060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013740	GAA	2	6	27182	27187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013740	GGA	2	6	27340	27345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013740	TGC	2	6	27538	27543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013740	AAC	2	6	27660	27665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013740	AGC	2	6	27683	27688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013740	GTC	2	6	27825	27830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013740	TGG	2	6	27849	27854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013740	TCG	2	6	27936	27941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013740	GCC	2	6	28203	28208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_013740	AGA	2	6	28363	28368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013740	AAG	2	6	28460	28465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013740	CGG	2	6	28511	28516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013740	ACC	2	6	28782	28787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_013740	TCA	2	6	29119	29124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013740	CGT	2	6	29199	29204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013740	GCT	2	6	29253	29258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013740	GCA	2	6	29539	29544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013740	CGA	2	6	29579	29584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013740	AAG	2	6	29656	29661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013740	CAG	2	6	29782	29787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013740	GGA	2	6	29831	29836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013740	AGA	2	6	30080	30085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013740	AAG	2	6	30090	30095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013740	CTT	2	6	30368	30373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013740	ACT	2	6	30945	30950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013740	GCA	2	6	30994	30999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013740	GAA	3	9	31010	31018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013740	TAT	2	6	31027	31032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013740	GTT	2	6	31105	31110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013740	CAA	2	6	31135	31140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013740	CCT	2	6	31678	31683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_013740	GCG	2	6	31720	31725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013740	CAA	2	6	31772	31777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013740	AGG	2	6	31778	31783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013740	AAT	2	6	32325	32330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013740	ATT	2	6	32450	32455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013740	TGT	2	6	32497	32502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013740	TCC	2	6	34208	34213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_013740	GGC	2	6	34342	34347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013740	CGG	2	6	34350	34355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013740	GGC	2	6	34363	34368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013740	ACG	3	9	34497	34505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013740	GAA	2	6	34534	34539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013740	CGG	2	6	34547	34552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013740	CGG	2	6	34554	34559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013740	CTG	2	6	34589	34594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013740	CTG	2	6	34609	34614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013740	TGG	2	6	36918	36923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013740	CCT	2	6	40027	40032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_013740	AGA	2	6	40116	40121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013740	GAA	2	6	40164	40169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013740	AAC	2	6	45988	45993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013740	GTT	2	6	46016	46021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013740	TAC	2	6	48309	48314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013740	CTT	2	6	48400	48405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013740	CTT	2	6	48424	48429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013740	CTT	2	6	48466	48471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013740	AGG	3	9	48501	48509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013740	GGA	2	6	49262	49267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013740	TAG	2	6	49576	49581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013740	GGA	2	6	49652	49657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013740	CAC	2	6	53106	53111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_013740	CTG	2	6	53181	53186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013740	GGT	2	6	53199	53204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013740	AGG	2	6	53222	53227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013740	CAG	2	6	54582	54587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013740	AGG	2	6	54613	54618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013740	AGG	2	6	54751	54756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013740	AAG	2	6	56062	56067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013740	GAA	2	6	57390	57395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013740	TTC	2	6	57408	57413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013740	CAA	2	6	57473	57478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013740	GTT	2	6	57513	57518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013740	TAT	2	6	57540	57545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013740	TTG	2	6	57593	57598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013740	TGA	2	6	57627	57632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013740	GGC	2	6	57749	57754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013740	TTC	2	6	57787	57792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013740	ACA	2	6	57853	57858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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412	NC_013740	AGG	2	6	191849	191854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_013740	AGG	2	6	191880	191885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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