MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Conexibacter woesei DSM 14684 chromosome

Total Repeats: 477

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013739	GCGCC	2	10	9698	9707	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_013739	CGGGT	2	10	78536	78545	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013739	CGGCC	2	10	102069	102078	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_013739	CGATG	2	10	123129	123138	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013739	CGGCG	2	10	123164	123173	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_013739	CCGCA	2	10	144783	144792	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_013739	ACCGG	2	10	146467	146476	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_013739	CACGA	2	10	149535	149544	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_013739	GGAGC	2	10	155443	155452	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013739	CGCGC	3	15	155457	155471	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_013739	CGCGC	2	10	155473	155482	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_013739	CGCGC	2	10	155500	155509	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_013739	CGTGG	2	10	165173	165182	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013739	CGCGG	2	10	178749	178758	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_013739	GCACC	2	10	182796	182805	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_013739	CGGGC	2	10	188260	188269	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_013739	CTCGC	2	10	203793	203802	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_013739	GTCGC	2	10	211104	211113	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013739	CGCGC	2	10	211812	211821	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_013739	GCGCC	2	10	283398	283407	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_013739	TGCGC	2	10	327973	327982	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_013739	GGCGC	3	15	348519	348533	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_013739	GGCGA	2	10	369040	369049	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013739	CGTGC	2	10	396997	397006	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_013739	CGCGG	2	10	398029	398038	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_013739	GCCGC	3	15	400124	400138	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_013739	GGAGC	2	10	404635	404644	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013739	GTCGA	2	10	428748	428757	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013739	TGGAC	2	10	429770	429779	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013739	GCGAG	2	10	456023	456032	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013739	GGCGC	2	10	502876	502885	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_013739	GCCCG	2	10	518249	518258	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_013739	TCTCT	2	10	520247	520256	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_013739	CGCGG	2	10	575892	575901	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
35	NC_013739	GACGC	2	10	584341	584350	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_013739	GACCC	2	10	585179	585188	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_013739	CCGCA	2	10	632123	632132	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_013739	CGCGG	2	10	636398	636407	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_013739	CCGTC	2	10	662292	662301	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_013739	AATCC	2	10	705857	705866	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_013739	GACCA	2	10	717341	717350	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013739	GCTGC	2	10	719436	719445	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_013739	CCGCA	2	10	722313	722322	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_013739	GGTGC	2	10	728777	728786	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013739	CGGAT	2	10	729368	729377	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013739	CGTCG	2	10	729557	729566	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
47	NC_013739	AGAGG	2	10	734756	734765	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013739	GCTGT	2	10	736482	736491	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013739	AGAGG	2	10	737537	737546	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013739	TCGAC	2	10	761204	761213	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_013739	CGCTG	2	10	762742	762751	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_013739	GCGCG	2	10	776424	776433	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_013739	CGCGC	2	10	779892	779901	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_013739	GCCGC	2	10	779923	779932	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_013739	TGGGG	2	10	824646	824655	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013739	CCACG	2	10	872298	872307	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_013739	GCCTC	2	10	873067	873076	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_013739	CGGGC	2	10	892383	892392	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
59	NC_013739	GATCG	2	10	935422	935431	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013739	CGCGC	2	10	940361	940370	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
61	NC_013739	CGGCG	2	10	947076	947085	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_013739	GCACC	2	10	953129	953138	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_013739	CGGCT	2	10	977401	977410	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_013739	GGTCG	2	10	984963	984972	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013739	CGTGC	2	10	998042	998051	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_013739	CCGAA	2	10	1012545	1012554	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_013739	GCACG	2	10	1030264	1030273	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_013739	CTCGC	2	10	1031809	1031818	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NC_013739	GCGCG	2	10	1062896	1062905	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_013739	CGCGG	2	10	1066489	1066498	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
71	NC_013739	TTCGC	2	10	1068005	1068014	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_013739	CGATT	2	10	1068022	1068031	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013739	GCGGA	2	10	1080751	1080760	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013739	CGCGG	2	10	1088581	1088590	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
75	NC_013739	GTCCC	2	10	1137925	1137934	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_013739	ACCGA	2	10	1163815	1163824	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_013739	AGAGG	2	10	1163825	1163834	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013739	CCCCG	2	10	1172593	1172602	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
79	NC_013739	GGGCG	2	10	1187973	1187982	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013739	CGAGA	2	10	1201012	1201021	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013739	GCGGG	2	10	1235141	1235150	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013739	GGTCG	2	10	1236416	1236425	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013739	CGCGG	2	10	1241244	1241253	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_013739	GTTGG	2	10	1242099	1242108	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013739	ACCTG	2	10	1244969	1244978	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_013739	GCGGG	2	10	1273157	1273166	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
87	NC_013739	CGCTC	2	10	1273169	1273178	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_013739	TTGAC	2	10	1283247	1283256	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013739	CGCGG	2	10	1287789	1287798	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_013739	GCGCG	2	10	1304346	1304355	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_013739	GTGCG	2	10	1321936	1321945	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013739	AATCA	2	10	1324818	1324827	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013739	GCGGG	2	10	1340983	1340992	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013739	CTGGG	2	10	1341593	1341602	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013739	CCGGT	2	10	1355445	1355454	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_013739	ACCGG	2	10	1355468	1355477	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_013739	CCGGC	2	10	1389553	1389562	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_013739	CGGGG	2	10	1398400	1398409	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
99	NC_013739	CACGA	2	10	1432140	1432149	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_013739	GACGC	2	10	1454975	1454984	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_013739	GCCGG	2	10	1458540	1458549	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_013739	CGTGG	2	10	1460025	1460034	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013739	GGCGA	2	10	1469244	1469253	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_013739	GTCGG	2	10	1495686	1495695	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013739	GCGGG	2	10	1517826	1517835	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013739	CGTGC	2	10	1547819	1547828	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_013739	GTCAC	2	10	1551560	1551569	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_013739	CCCGC	2	10	1551724	1551733	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
109	NC_013739	CCATG	2	10	1551900	1551909	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_013739	GCCGC	2	10	1551910	1551919	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
111	NC_013739	CTGGC	2	10	1552080	1552089	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_013739	CGCGA	2	10	1596011	1596020	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
113	NC_013739	GGCGG	2	10	1605254	1605263	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
114	NC_013739	GATCC	2	10	1607635	1607644	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_013739	CGAAT	2	10	1625466	1625475	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013739	GCCGC	2	10	1664383	1664392	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_013739	CGCGC	2	10	1664401	1664410	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_013739	GCCGC	2	10	1664422	1664431	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
119	NC_013739	CGCGG	2	10	1684049	1684058	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_013739	GCCGC	2	10	1696644	1696653	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_013739	CGGTG	2	10	1726159	1726168	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_013739	CGGCG	2	10	1751344	1751353	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_013739	CGGCG	2	10	1773253	1773262	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_013739	ACTGA	2	10	1775964	1775973	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013739	CGGGC	2	10	1780049	1780058	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
126	NC_013739	CGGGC	2	10	1780130	1780139	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_013739	GCGCG	2	10	1780256	1780265	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_013739	CGGGC	2	10	1780484	1780493	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
129	NC_013739	CCGCG	2	10	1795594	1795603	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130	NC_013739	GCCGC	2	10	1812904	1812913	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_013739	GATCG	2	10	1837745	1837754	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_013739	TTTCA	2	10	1864086	1864095	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013739	GAGGC	2	10	1867803	1867812	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_013739	CGCGG	2	10	1883689	1883698	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_013739	CGCGT	2	10	1910725	1910734	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_013739	GGGTT	2	10	1925890	1925899	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013739	CAGCG	2	10	1931134	1931143	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_013739	TCGCG	2	10	1946615	1946624	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
139	NC_013739	GGGGA	2	10	1952902	1952911	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013739	CGTGC	2	10	1957154	1957163	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
141	NC_013739	CCGAT	2	10	1966177	1966186	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_013739	CGGGG	2	10	1993961	1993970	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
143	NC_013739	CGGCG	2	10	2020425	2020434	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
144	NC_013739	TCCTC	2	10	2040078	2040087	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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279	NC_013739	GCGCG	2	10	4013568	4013577	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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456	NC_013739	AGCCG	2	10	6072417	6072426	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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462	NC_013739	GTGTC	2	10	6145541	6145550	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
463	NC_013739	GCGTC	2	10	6150921	6150930	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
464	NC_013739	CGGCG	2	10	6167422	6167431	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
465	NC_013739	GCCCC	2	10	6175852	6175861	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
466	NC_013739	GCGCC	2	10	6176946	6176955	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
467	NC_013739	CACTA	2	10	6255397	6255406	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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472	NC_013739	CGGCG	2	10	6324128	6324137	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
473	NC_013739	CCCTC	2	10	6324143	6324152	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
474	NC_013739	CTCCG	2	10	6324283	6324292	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
475	NC_013739	GCACG	2	10	6326410	6326419	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
476	NC_013739	CCGGT	2	10	6337108	6337117	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
477	NC_013739	CGAGG	2	10	6353775	6353784	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.