MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN07

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013737	AGG	2	6	805	810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005993
2	NC_013737	CAA	2	6	878	883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005993
3	NC_013737	TGA	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005993
4	NC_013737	GAC	2	6	1139	1144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005993
5	NC_013737	ACA	2	6	1300	1305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005993
6	NC_013737	TAA	2	6	1408	1413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005994
7	NC_013737	GAA	2	6	1457	1462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005994
8	NC_013737	TAA	2	6	1676	1681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005994
9	NC_013737	ATC	2	6	1771	1776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005995
10	NC_013737	AGA	2	6	1976	1981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005996
11	NC_013737	GAC	2	6	1998	2003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005996
12	NC_013737	TGA	2	6	2124	2129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005996
13	NC_013737	TAA	2	6	2421	2426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005998
14	NC_013737	ATC	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005998
15	NC_013737	AAC	2	6	2521	2526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005998
16	NC_013737	AAC	2	6	2651	2656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005998
17	NC_013737	CTT	2	6	2700	2705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005998
18	NC_013737	ATC	2	6	2720	2725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005998
19	NC_013737	ATC	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005998
20	NC_013737	TCG	2	6	2738	2743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005998
21	NC_013737	CTT	2	6	3606	3611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005999
22	NC_013737	TCG	2	6	3648	3653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005999
23	NC_013737	CGG	2	6	3660	3665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005999
24	NC_013737	TGG	2	6	3834	3839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005999
25	NC_013737	CAA	2	6	3848	3853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005999
26	NC_013737	TGA	3	9	3879	3887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005999
27	NC_013737	CAG	2	6	3913	3918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005999
28	NC_013737	GCG	2	6	3935	3940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005999
29	NC_013737	GCT	2	6	3985	3990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005999
30	NC_013737	AAC	2	6	4132	4137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284006000
31	NC_013737	ATG	2	6	4152	4157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006000
32	NC_013737	TGC	2	6	4167	4172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006000
33	NC_013737	TGG	2	6	4189	4194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006000
34	NC_013737	CGT	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006000
35	NC_013737	GTT	2	6	4378	4383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006000
36	NC_013737	GTC	2	6	4386	4391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006000
37	NC_013737	ATC	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006000
38	NC_013737	TCA	2	6	4494	4499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006000
39	NC_013737	AGT	2	6	4552	4557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006000
40	NC_013737	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284006001
41	NC_013737	ACC	2	6	4756	4761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284006001
42	NC_013737	CGG	3	9	4841	4849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284006001
43	NC_013737	CTT	2	6	4956	4961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284006001
44	NC_013737	CCT	2	6	5027	5032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284006001
45	NC_013737	GGC	2	6	5061	5066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284006001
46	NC_013737	GGT	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006001
47	NC_013737	GCT	2	6	5175	5180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006001
48	NC_013737	TGG	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006002
49	NC_013737	CTT	2	6	5416	5421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284006002
50	NC_013737	TGC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006002
51	NC_013737	TCG	2	6	5541	5546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006002
52	NC_013737	GCC	2	6	5643	5648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284006002
53	NC_013737	TCA	2	6	5688	5693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006002
54	NC_013737	GTG	2	6	5826	5831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006002
55	NC_013737	GAT	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006002
56	NC_013737	TTC	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284006002
57	NC_013737	CTG	2	6	5981	5986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006002
58	NC_013737	ACT	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006002
59	NC_013737	TCC	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284006002
60	NC_013737	TTG	2	6	6225	6230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006002
61	NC_013737	TCA	2	6	6364	6369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006002
62	NC_013737	CCA	2	6	6444	6449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284006003
63	NC_013737	GCT	2	6	6519	6524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006003
64	NC_013737	ACT	2	6	6538	6543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006003
65	NC_013737	CTG	2	6	6805	6810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006003

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.