MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN03

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013733	AACAG	2	10	300	309	60 %	0 %	20 %	20 %	284005899
2	NC_013733	AAGCC	2	10	502	511	40 %	0 %	20 %	40 %	284005899
3	NC_013733	ATAAG	2	10	1068	1077	60 %	20 %	20 %	0 %	284005900
4	NC_013733	ATCCA	2	10	2304	2313	40 %	20 %	0 %	40 %	284005902
5	NC_013733	CGGGT	2	10	5309	5318	0 %	20 %	60 %	20 %	284005905
6	NC_013733	CTTAG	2	10	8036	8045	20 %	40 %	20 %	20 %	284005907
7	NC_013733	ATAGC	2	10	9833	9842	40 %	20 %	20 %	20 %	284005909
8	NC_013733	AGCAG	2	10	11040	11049	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013733	GTACT	2	10	12752	12761	20 %	40 %	20 %	20 %	284005911
10	NC_013733	ACTCA	2	10	15067	15076	40 %	20 %	0 %	40 %	284005913
11	NC_013733	AGAAC	2	10	15405	15414	60 %	0 %	20 %	20 %	284005913
12	NC_013733	GATAC	2	10	16603	16612	40 %	20 %	20 %	20 %	284005913
13	NC_013733	CAATG	2	10	17613	17622	40 %	20 %	20 %	20 %	284005914
14	NC_013733	TTGTT	2	10	19976	19985	0 %	80 %	20 %	0 %	284005917
15	NC_013733	AAAAT	2	10	21050	21059	80 %	20 %	0 %	0 %	284005919
16	NC_013733	CTACT	2	10	21436	21445	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_013733	CAAAT	2	10	24659	24668	60 %	20 %	0 %	20 %	284005926
18	NC_013733	AAAGT	2	10	25676	25685	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013733	AAGGG	2	10	27075	27084	40 %	0 %	60 %	0 %	284005929
20	NC_013733	TGCCC	2	10	28107	28116	0 %	20 %	20 %	60 %	284005930
21	NC_013733	TATAA	2	10	28649	28658	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013733	TTTTC	2	10	28684	28693	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013733	TGCCA	2	10	29170	29179	20 %	20 %	20 %	40 %	284005931
24	NC_013733	CGATA	2	10	30261	30270	40 %	20 %	20 %	20 %	284005933
25	NC_013733	TTAAT	2	10	31013	31022	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013733	AGGGG	2	10	32120	32129	20 %	0 %	80 %	0 %	284005934
27	NC_013733	CCGAC	2	10	32968	32977	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_013733	TTGCT	2	10	35287	35296	0 %	60 %	20 %	20 %	284005936
29	NC_013733	ACATA	2	10	35474	35483	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013733	GGTCT	2	10	35740	35749	0 %	40 %	40 %	20 %	284005937

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.