MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN03

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013733	GTTA	2	8	19	26	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013733	TATT	2	8	85	92	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013733	ATAA	2	8	292	299	75 %	25 %	0 %	0 %	284005899
4	NC_013733	AAAC	2	8	821	828	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013733	TCTG	2	8	1191	1198	0 %	50 %	25 %	25 %	284005900
6	NC_013733	TAGG	2	8	1580	1587	25 %	25 %	50 %	0 %	284005901
7	NC_013733	TGCT	2	8	2036	2043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013733	CGAA	2	8	2156	2163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013733	GGAT	2	8	2233	2240	25 %	25 %	50 %	0 %	284005902
10	NC_013733	TTGG	2	8	2764	2771	0 %	50 %	50 %	0 %	284005903
11	NC_013733	ATGT	2	8	3170	3177	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013733	ACCC	2	8	3217	3224	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_013733	TTGC	2	8	3282	3289	0 %	50 %	25 %	25 %	284005904
14	NC_013733	ACCC	2	8	3612	3619	25 %	0 %	0 %	75 %	284005904
15	NC_013733	TCGA	2	8	3711	3718	25 %	25 %	25 %	25 %	284005904
16	NC_013733	CTTT	2	8	4226	4233	0 %	75 %	0 %	25 %	284005905
17	NC_013733	GACG	2	8	4343	4350	25 %	0 %	50 %	25 %	284005905
18	NC_013733	CAGC	2	8	4892	4899	25 %	0 %	25 %	50 %	284005905
19	NC_013733	GGGA	2	8	5434	5441	25 %	0 %	75 %	0 %	284005905
20	NC_013733	GCGG	2	8	5650	5657	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013733	TGGG	2	8	5680	5687	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013733	CTTT	2	8	6411	6418	0 %	75 %	0 %	25 %	284005906
23	NC_013733	CTGG	2	8	6438	6445	0 %	25 %	50 %	25 %	284005906
24	NC_013733	CGTT	2	8	6969	6976	0 %	50 %	25 %	25 %	284005906
25	NC_013733	CCAA	2	8	7602	7609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013733	GAAA	2	8	8014	8021	75 %	0 %	25 %	0 %	284005907
27	NC_013733	CCGC	2	8	8652	8659	0 %	0 %	25 %	75 %	284005908
28	NC_013733	GGAT	2	8	8806	8813	25 %	25 %	50 %	0 %	284005908
29	NC_013733	TTGT	2	8	9003	9010	0 %	75 %	25 %	0 %	284005908
30	NC_013733	TGTA	2	8	9055	9062	25 %	50 %	25 %	0 %	284005908
31	NC_013733	ACCC	2	8	9359	9366	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_013733	TACC	2	8	9486	9493	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013733	AAGT	2	8	10017	10024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013733	AACT	2	8	10179	10186	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013733	TTAA	2	8	10523	10530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013733	GCAT	2	8	10692	10699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013733	ACCG	2	8	10804	10811	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013733	GCCC	2	8	10967	10974	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_013733	AGGC	2	8	11065	11072	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013733	AGTG	2	8	12428	12435	25 %	25 %	50 %	0 %	284005911
41	NC_013733	GATG	2	8	12970	12977	25 %	25 %	50 %	0 %	284005911
42	NC_013733	ATTG	2	8	14005	14012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013733	ATTT	2	8	14212	14219	25 %	75 %	0 %	0 %	284005913
44	NC_013733	AATT	2	8	14443	14450	50 %	50 %	0 %	0 %	284005913
45	NC_013733	CTAA	2	8	14679	14686	50 %	25 %	0 %	25 %	284005913
46	NC_013733	GGAC	2	8	15127	15134	25 %	0 %	50 %	25 %	284005913
47	NC_013733	TTTG	2	8	16160	16167	0 %	75 %	25 %	0 %	284005913
48	NC_013733	ATTA	2	8	16677	16684	50 %	50 %	0 %	0 %	284005913
49	NC_013733	GACC	2	8	17191	17198	25 %	0 %	25 %	50 %	284005914
50	NC_013733	CTTT	2	8	17890	17897	0 %	75 %	0 %	25 %	284005914
51	NC_013733	TGTA	2	8	18124	18131	25 %	50 %	25 %	0 %	284005914
52	NC_013733	TTGT	2	8	18183	18190	0 %	75 %	25 %	0 %	284005914
53	NC_013733	AATA	2	8	18841	18848	75 %	25 %	0 %	0 %	284005915
54	NC_013733	ATTA	2	8	18964	18971	50 %	50 %	0 %	0 %	284005915
55	NC_013733	GTTG	2	8	19565	19572	0 %	50 %	50 %	0 %	284005916
56	NC_013733	TTGT	2	8	19929	19936	0 %	75 %	25 %	0 %	284005917
57	NC_013733	GTTT	2	8	20237	20244	0 %	75 %	25 %	0 %	284005917
58	NC_013733	CTTC	2	8	20326	20333	0 %	50 %	0 %	50 %	284005917
59	NC_013733	GGCT	2	8	20492	20499	0 %	25 %	50 %	25 %	284005918
60	NC_013733	CTGG	2	8	20656	20663	0 %	25 %	50 %	25 %	284005918
61	NC_013733	CTGA	2	8	20701	20708	25 %	25 %	25 %	25 %	284005918
62	NC_013733	GCTT	2	8	20723	20730	0 %	50 %	25 %	25 %	284005918
63	NC_013733	GGGT	2	8	20808	20815	0 %	25 %	75 %	0 %	284005918
64	NC_013733	GTTT	2	8	21384	21391	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013733	CAGC	2	8	22165	22172	25 %	0 %	25 %	50 %	284005920
66	NC_013733	GGTC	2	8	22973	22980	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013733	TAGG	2	8	23538	23545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013733	TGCC	2	8	23983	23990	0 %	25 %	25 %	50 %	284005925
69	NC_013733	CAAA	2	8	24196	24203	75 %	0 %	0 %	25 %	284005925
70	NC_013733	TGAG	2	8	24296	24303	25 %	25 %	50 %	0 %	284005925
71	NC_013733	CTTC	2	8	24579	24586	0 %	50 %	0 %	50 %	284005926
72	NC_013733	AATC	2	8	24598	24605	50 %	25 %	0 %	25 %	284005926
73	NC_013733	GTTA	2	8	25288	25295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013733	TTAC	2	8	25875	25882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013733	AATC	2	8	26661	26668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013733	ATCA	2	8	26688	26695	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_013733	AGGC	2	8	27131	27138	25 %	0 %	50 %	25 %	284005929
78	NC_013733	TCCA	2	8	27272	27279	25 %	25 %	0 %	50 %	284005929
79	NC_013733	TTGG	2	8	28204	28211	0 %	50 %	50 %	0 %	284005930
80	NC_013733	GTTA	2	8	28977	28984	25 %	50 %	25 %	0 %	284005931
81	NC_013733	TGGC	2	8	29555	29562	0 %	25 %	50 %	25 %	284005931
82	NC_013733	CGTG	2	8	29663	29670	0 %	25 %	50 %	25 %	284005931
83	NC_013733	GCCA	2	8	30757	30764	25 %	0 %	25 %	50 %	284005933
84	NC_013733	GTAT	2	8	31036	31043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013733	GAAT	2	8	31207	31214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013733	GCCA	2	8	31504	31511	25 %	0 %	25 %	50 %	284005934
87	NC_013733	CACC	2	8	31956	31963	25 %	0 %	0 %	75 %	284005934
88	NC_013733	CTCA	2	8	32190	32197	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013733	CTTT	2	8	33207	33214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013733	CAAG	2	8	33377	33384	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013733	GAAG	2	8	33789	33796	50 %	0 %	50 %	0 %	284005935
92	NC_013733	TAGC	2	8	33902	33909	25 %	25 %	25 %	25 %	284005935
93	NC_013733	TCGC	2	8	35013	35020	0 %	25 %	25 %	50 %	284005936
94	NC_013733	TCGG	2	8	35301	35308	0 %	25 %	50 %	25 %	284005936

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.