MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN03

Total Repeats: 418

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013733	TAA	2	6	47	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013733	AGA	2	6	209	214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005899
3	NC_013733	CAA	2	6	228	233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005899
4	NC_013733	TAC	2	6	534	539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005899
5	NC_013733	AAT	2	6	631	636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005899
6	NC_013733	TTC	2	6	662	667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005899
7	NC_013733	ATT	2	6	766	771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013733	TAA	2	6	841	846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005900
9	NC_013733	ATC	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005900
10	NC_013733	TTC	2	6	1104	1109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005900
11	NC_013733	AAT	2	6	1224	1229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005900
12	NC_013733	TGT	2	6	1277	1282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013733	ACT	2	6	1502	1507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005901
14	NC_013733	GGC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005901
15	NC_013733	CTC	2	6	1633	1638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284005901
16	NC_013733	AGC	2	6	1684	1689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005901
17	NC_013733	TGT	2	6	1792	1797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013733	TAC	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013733	CAG	2	6	1866	1871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013733	ATA	2	6	2047	2052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013733	ATG	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005902
22	NC_013733	TTG	2	6	2336	2341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013733	TAC	2	6	2347	2352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013733	TGT	2	6	2357	2362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013733	CTG	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013733	ATA	2	6	2506	2511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013733	GCC	2	6	2534	2539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_013733	CAA	2	6	2684	2689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013733	TCG	2	6	2714	2719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013733	GAC	2	6	2939	2944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005903
31	NC_013733	ACC	2	6	2999	3004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005903
32	NC_013733	CGG	2	6	3016	3021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005903
33	NC_013733	GGT	2	6	3059	3064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005903
34	NC_013733	TTG	2	6	3152	3157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013733	TCG	2	6	3370	3375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005904
36	NC_013733	TGA	2	6	3413	3418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005904
37	NC_013733	TCC	2	6	3442	3447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284005904
38	NC_013733	GAC	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005904
39	NC_013733	GCC	2	6	3817	3822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005904
40	NC_013733	CAG	2	6	3885	3890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005904
41	NC_013733	TCG	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005904
42	NC_013733	CCA	2	6	3956	3961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005904
43	NC_013733	GAT	2	6	4143	4148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005905
44	NC_013733	TAA	2	6	4540	4545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005905
45	NC_013733	TCT	2	6	4552	4557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005905
46	NC_013733	CAG	2	6	4560	4565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005905
47	NC_013733	TGA	2	6	4607	4612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005905
48	NC_013733	TCG	2	6	4865	4870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005905
49	NC_013733	TGA	2	6	5015	5020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005905
50	NC_013733	TCC	2	6	5023	5028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284005905
51	NC_013733	GAA	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005905
52	NC_013733	TGT	2	6	5115	5120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005905
53	NC_013733	CGA	2	6	5156	5161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005905
54	NC_013733	CTG	2	6	5202	5207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005905
55	NC_013733	ATA	2	6	5226	5231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005905
56	NC_013733	GTT	2	6	5345	5350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005905
57	NC_013733	GAA	2	6	5351	5356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005905
58	NC_013733	GAC	2	6	5390	5395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005905
59	NC_013733	TGC	2	6	5536	5541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005905
60	NC_013733	GGC	2	6	5635	5640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013733	GAT	2	6	5791	5796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013733	GCT	2	6	6140	6145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005906
63	NC_013733	CAG	2	6	6171	6176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005906
64	NC_013733	ACC	2	6	6228	6233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005906
65	NC_013733	ATC	2	6	6307	6312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005906
66	NC_013733	AGC	2	6	6313	6318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005906
67	NC_013733	CTG	2	6	6321	6326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005906
68	NC_013733	TAT	2	6	6474	6479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005906
69	NC_013733	ATT	2	6	6588	6593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005906
70	NC_013733	GAA	2	6	6696	6701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005906
71	NC_013733	GTC	2	6	6725	6730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005906
72	NC_013733	GCC	2	6	6831	6836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005906
73	NC_013733	GCT	2	6	6881	6886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005906
74	NC_013733	ATC	2	6	6987	6992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005906
75	NC_013733	GCA	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005906
76	NC_013733	CTT	2	6	7074	7079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005906
77	NC_013733	TGG	2	6	7270	7275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005906
78	NC_013733	ACC	2	6	7335	7340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005906
79	NC_013733	GAT	2	6	7455	7460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005906
80	NC_013733	GAG	2	6	7486	7491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005906
81	NC_013733	GCT	2	6	7675	7680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005907
82	NC_013733	TGA	2	6	7827	7832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005907
83	NC_013733	TGA	2	6	7869	7874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005907
84	NC_013733	TTC	2	6	7876	7881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005907
85	NC_013733	GCT	2	6	7889	7894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005907
86	NC_013733	GTT	2	6	7976	7981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005907
87	NC_013733	ATT	2	6	8138	8143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005907
88	NC_013733	CTG	2	6	8156	8161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005907
89	NC_013733	GAA	2	6	8225	8230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005907
90	NC_013733	ACA	3	9	8242	8250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005907
91	NC_013733	TGA	2	6	8451	8456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005907
92	NC_013733	TCA	2	6	8530	8535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005907
93	NC_013733	CAT	2	6	8542	8547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005907
94	NC_013733	ATT	2	6	8637	8642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005908
95	NC_013733	TGA	2	6	8684	8689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005908
96	NC_013733	CTC	2	6	8833	8838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284005908
97	NC_013733	ATT	2	6	8847	8852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005908
98	NC_013733	CAC	2	6	9092	9097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005908
99	NC_013733	TGA	2	6	9118	9123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005908
100	NC_013733	AAC	2	6	9130	9135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005908
101	NC_013733	CAT	2	6	9174	9179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005908
102	NC_013733	CAG	2	6	9285	9290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005908
103	NC_013733	ATA	2	6	9520	9525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013733	CAT	2	6	9627	9632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005909
105	NC_013733	ATC	2	6	9811	9816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005909
106	NC_013733	GAA	2	6	9903	9908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005909
107	NC_013733	TTC	2	6	10027	10032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013733	TGG	2	6	10054	10059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013733	ACG	2	6	10234	10239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005910
110	NC_013733	CAG	2	6	10301	10306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005910
111	NC_013733	CAC	2	6	10334	10339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005910
112	NC_013733	CAG	2	6	10347	10352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005910
113	NC_013733	CGA	2	6	10517	10522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013733	CAA	2	6	10559	10564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013733	GTT	2	6	10570	10575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013733	CGT	2	6	10745	10750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013733	TCA	2	6	10816	10821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013733	GAG	2	6	10842	10847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013733	TGC	2	6	11019	11024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013733	ACC	2	6	11093	11098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_013733	GAT	2	6	11104	11109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013733	GAT	2	6	11245	11250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013733	CAT	2	6	11267	11272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013733	ACC	2	6	11278	11283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_013733	GAT	2	6	11343	11348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013733	GTA	2	6	11415	11420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013733	CTT	2	6	11732	11737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005911
128	NC_013733	CAG	3	9	11748	11756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005911
129	NC_013733	GCC	2	6	11788	11793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005911
130	NC_013733	GGT	2	6	11864	11869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005911
131	NC_013733	ATC	2	6	12088	12093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005911
132	NC_013733	GCA	2	6	12116	12121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005911
133	NC_013733	AGG	2	6	12221	12226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005911
134	NC_013733	GAA	2	6	12270	12275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005911
135	NC_013733	ACC	2	6	12295	12300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005911
136	NC_013733	CGT	2	6	12309	12314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005911
137	NC_013733	GCG	2	6	12633	12638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005911
138	NC_013733	AAG	2	6	12768	12773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005911
139	NC_013733	GGT	2	6	12817	12822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005911
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145	NC_013733	GTT	2	6	13657	13662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013733	TTG	2	6	13669	13674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013733	CCA	2	6	13679	13684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_013733	CAT	2	6	13691	13696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_013733	GCA	2	6	13787	13792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_013733	CAT	2	6	13896	13901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013733	TAA	2	6	14132	14137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005913
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154	NC_013733	TAG	2	6	14381	14386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005913
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189	NC_013733	ACA	2	6	16923	16928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_013733	AGG	2	6	22404	22409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005921
259	NC_013733	CAA	2	6	22470	22475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005921
260	NC_013733	AGG	2	6	22479	22484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005921
261	NC_013733	CAA	2	6	22546	22551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005921
262	NC_013733	TGC	2	6	22726	22731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005922
263	NC_013733	GCT	2	6	22861	22866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005922
264	NC_013733	ACA	2	6	22898	22903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005922
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266	NC_013733	TCT	2	6	22953	22958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_013733	CTT	2	6	23059	23064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005923
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270	NC_013733	CTG	2	6	23224	23229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005923
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272	NC_013733	CTT	2	6	23325	23330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_013733	TTA	2	6	23512	23517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_013733	GGA	2	6	23569	23574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
276	NC_013733	CTG	2	6	23705	23710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005924
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287	NC_013733	CAT	2	6	24224	24229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005925
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289	NC_013733	TCA	2	6	24256	24261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005925
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299	NC_013733	TGG	2	6	25185	25190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
300	NC_013733	ATT	2	6	25432	25437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_013733	CTA	2	6	25599	25604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_013733	TCT	2	6	25641	25646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_013733	CTT	2	6	25670	25675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_013733	AAT	2	6	25694	25699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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362	NC_013733	TAT	2	6	31310	31315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
363	NC_013733	CTC	2	6	31347	31352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
364	NC_013733	TAA	2	6	31443	31448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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372	NC_013733	CAG	2	6	31921	31926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005934
373	NC_013733	ACC	2	6	32059	32064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005934
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380	NC_013733	TAC	2	6	33006	33011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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382	NC_013733	TAC	2	6	33173	33178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_013733	GTA	2	6	33495	33500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
384	NC_013733	ACA	2	6	33570	33575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
385	NC_013733	CTC	2	6	33591	33596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
386	NC_013733	TCC	2	6	33617	33622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284005935
387	NC_013733	TTC	2	6	33682	33687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005935
388	NC_013733	ATG	2	6	33860	33865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005935
389	NC_013733	CTG	2	6	33977	33982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005935
390	NC_013733	TGA	2	6	34050	34055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005935
391	NC_013733	TTG	2	6	34454	34459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005935
392	NC_013733	TGG	2	6	34515	34520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005935
393	NC_013733	ACA	2	6	34633	34638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_013733	ATA	2	6	34663	34668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_013733	GCT	2	6	34734	34739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005936
396	NC_013733	TTC	2	6	34761	34766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005936
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408	NC_013733	TGT	2	6	35526	35531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_013733	AAC	2	6	35688	35693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005937
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.