MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN03

Total Repeats: 313

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013733	AGA	2	6	209	214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005899
2	NC_013733	CAA	2	6	228	233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005899
3	NC_013733	TAC	2	6	534	539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005899
4	NC_013733	AAT	2	6	631	636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005899
5	NC_013733	TTC	2	6	662	667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005899
6	NC_013733	TAA	2	6	841	846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005900
7	NC_013733	ATC	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005900
8	NC_013733	TTC	2	6	1104	1109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005900
9	NC_013733	AAT	2	6	1224	1229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005900
10	NC_013733	ACT	2	6	1502	1507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005901
11	NC_013733	GGC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005901
12	NC_013733	CTC	2	6	1633	1638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284005901
13	NC_013733	AGC	2	6	1684	1689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005901
14	NC_013733	ATG	2	6	2181	2186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005902
15	NC_013733	GAC	2	6	2939	2944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005903
16	NC_013733	ACC	2	6	2999	3004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005903
17	NC_013733	CGG	2	6	3016	3021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005903
18	NC_013733	GGT	2	6	3059	3064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005903
19	NC_013733	TCG	2	6	3370	3375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005904
20	NC_013733	TGA	2	6	3413	3418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005904
21	NC_013733	TCC	2	6	3442	3447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284005904
22	NC_013733	GAC	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005904
23	NC_013733	GCC	2	6	3817	3822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005904
24	NC_013733	CAG	2	6	3885	3890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005904
25	NC_013733	TCG	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005904
26	NC_013733	CCA	2	6	3956	3961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005904
27	NC_013733	GAT	2	6	4143	4148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005905
28	NC_013733	TAA	2	6	4540	4545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005905
29	NC_013733	TCT	2	6	4552	4557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005905
30	NC_013733	CAG	2	6	4560	4565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005905
31	NC_013733	TGA	2	6	4607	4612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005905
32	NC_013733	TCG	2	6	4865	4870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005905
33	NC_013733	TGA	2	6	5015	5020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005905
34	NC_013733	TCC	2	6	5023	5028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284005905
35	NC_013733	GAA	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005905
36	NC_013733	TGT	2	6	5115	5120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005905
37	NC_013733	CGA	2	6	5156	5161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005905
38	NC_013733	CTG	2	6	5202	5207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005905
39	NC_013733	ATA	2	6	5226	5231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005905
40	NC_013733	GTT	2	6	5345	5350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005905
41	NC_013733	GAA	2	6	5351	5356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005905
42	NC_013733	GAC	2	6	5390	5395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005905
43	NC_013733	TGC	2	6	5536	5541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005905
44	NC_013733	GCT	2	6	6140	6145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005906
45	NC_013733	CAG	2	6	6171	6176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005906
46	NC_013733	ACC	2	6	6228	6233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005906
47	NC_013733	ATC	2	6	6307	6312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005906
48	NC_013733	AGC	2	6	6313	6318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005906
49	NC_013733	CTG	2	6	6321	6326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005906
50	NC_013733	TAT	2	6	6474	6479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005906
51	NC_013733	ATT	2	6	6588	6593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005906
52	NC_013733	GAA	2	6	6696	6701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005906
53	NC_013733	GTC	2	6	6725	6730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005906
54	NC_013733	GCC	2	6	6831	6836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005906
55	NC_013733	GCT	2	6	6881	6886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005906
56	NC_013733	ATC	2	6	6987	6992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005906
57	NC_013733	GCA	2	6	7034	7039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005906
58	NC_013733	CTT	2	6	7074	7079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005906
59	NC_013733	TGG	2	6	7270	7275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005906
60	NC_013733	ACC	2	6	7335	7340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005906
61	NC_013733	GAT	2	6	7455	7460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005906
62	NC_013733	GAG	2	6	7486	7491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005906
63	NC_013733	GCT	2	6	7675	7680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005907
64	NC_013733	TGA	2	6	7827	7832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005907
65	NC_013733	TGA	2	6	7869	7874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005907
66	NC_013733	TTC	2	6	7876	7881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005907
67	NC_013733	GCT	2	6	7889	7894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005907
68	NC_013733	GTT	2	6	7976	7981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005907
69	NC_013733	ATT	2	6	8138	8143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005907
70	NC_013733	CTG	2	6	8156	8161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005907
71	NC_013733	GAA	2	6	8225	8230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005907
72	NC_013733	ACA	3	9	8242	8250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005907
73	NC_013733	TGA	2	6	8451	8456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005907
74	NC_013733	TCA	2	6	8530	8535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005907
75	NC_013733	CAT	2	6	8542	8547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005907
76	NC_013733	ATT	2	6	8637	8642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005908
77	NC_013733	TGA	2	6	8684	8689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005908
78	NC_013733	CTC	2	6	8833	8838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284005908
79	NC_013733	ATT	2	6	8847	8852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005908
80	NC_013733	CAC	2	6	9092	9097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005908
81	NC_013733	TGA	2	6	9118	9123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005908
82	NC_013733	AAC	2	6	9130	9135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005908
83	NC_013733	CAT	2	6	9174	9179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005908
84	NC_013733	CAG	2	6	9285	9290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005908
85	NC_013733	CAT	2	6	9627	9632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005909
86	NC_013733	ATC	2	6	9811	9816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005909
87	NC_013733	GAA	2	6	9903	9908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005909
88	NC_013733	ACG	2	6	10234	10239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005910
89	NC_013733	CAG	2	6	10301	10306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005910
90	NC_013733	CAC	2	6	10334	10339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005910
91	NC_013733	CAG	2	6	10347	10352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005910
92	NC_013733	CTT	2	6	11732	11737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005911
93	NC_013733	CAG	3	9	11748	11756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005911
94	NC_013733	GCC	2	6	11788	11793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005911
95	NC_013733	GGT	2	6	11864	11869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005911
96	NC_013733	ATC	2	6	12088	12093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005911
97	NC_013733	GCA	2	6	12116	12121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005911
98	NC_013733	AGG	2	6	12221	12226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005911
99	NC_013733	GAA	2	6	12270	12275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005911
100	NC_013733	ACC	2	6	12295	12300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005911
101	NC_013733	CGT	2	6	12309	12314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005911
102	NC_013733	GCG	2	6	12633	12638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005911
103	NC_013733	AAG	2	6	12768	12773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005911
104	NC_013733	GGT	2	6	12817	12822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005911
105	NC_013733	GAA	2	6	12827	12832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005911
106	NC_013733	ATG	2	6	12993	12998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005911
107	NC_013733	GGC	2	6	13181	13186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005912
108	NC_013733	ATA	2	6	13367	13372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005912
109	NC_013733	TAA	2	6	14132	14137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005913
110	NC_013733	AAG	2	6	14302	14307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005913
111	NC_013733	TAG	2	6	14381	14386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005913
112	NC_013733	AGA	2	6	14510	14515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005913
113	NC_013733	AGA	2	6	14621	14626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005913
114	NC_013733	AAT	2	6	14712	14717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005913
115	NC_013733	ATC	2	6	14842	14847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005913
116	NC_013733	TTG	2	6	14893	14898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005913
117	NC_013733	TCA	2	6	15012	15017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005913
118	NC_013733	TGG	2	6	15047	15052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005913
119	NC_013733	TTA	2	6	15108	15113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005913
120	NC_013733	ATT	2	6	15154	15159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005913
121	NC_013733	AAT	2	6	15186	15191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005913
122	NC_013733	TAA	2	6	15199	15204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005913
123	NC_013733	TGA	2	6	15221	15226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005913
124	NC_013733	TAA	2	6	15485	15490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005913
125	NC_013733	TTC	2	6	15535	15540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005913
126	NC_013733	TTA	2	6	15634	15639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005913
127	NC_013733	TGA	2	6	15724	15729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005913
128	NC_013733	GCT	2	6	15782	15787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005913
129	NC_013733	TAA	2	6	15824	15829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005913
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.