MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN02

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013732	CATGAA	2	12	2619	2630	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284005760
2	NC_013732	CTGCTT	2	12	3955	3966	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	284005762
3	NC_013732	TCGAGA	2	12	16662	16673	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284005777
4	NC_013732	TCCGAA	2	12	21308	21319	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284005780
5	NC_013732	CCGGAC	2	12	21486	21497	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	284005780
6	NC_013732	ACTCCA	2	12	22362	22373	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	284005782
7	NC_013732	ATGAAG	2	12	22544	22555	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	284005782
8	NC_013732	GCGGAT	2	12	23678	23689	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284005784
9	NC_013732	CCATCG	2	12	28579	28590	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284005790
10	NC_013732	CCGCCC	2	12	33681	33692	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	284005796
11	NC_013732	GCCAAA	2	12	33740	33751	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	284005796
12	NC_013732	TCTGCG	2	12	40010	40021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005804
13	NC_013732	GAACAT	2	12	44631	44642	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284005805
14	NC_013732	GTAGGC	2	12	58291	58302	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284005815
15	NC_013732	GCAGGT	2	12	59370	59381	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284005816
16	NC_013732	ATTGCC	2	12	64253	64264	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284005820
17	NC_013732	GGCATG	2	12	64442	64453	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284005820
18	NC_013732	CGCTGA	2	12	65175	65186	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284005820
19	NC_013732	GGGCAG	2	12	65351	65362	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	284005820
20	NC_013732	GTAAAT	2	12	69695	69706	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	284005825
21	NC_013732	CCTTTT	2	12	71938	71949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005827
22	NC_013732	CGCCAA	2	12	76545	76556	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	284005828
23	NC_013732	TTCATC	2	12	79088	79099	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	284005828
24	NC_013732	TGTTCA	2	12	79701	79712	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	284005828
25	NC_013732	AGCAGA	2	12	82248	82259	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	284005832
26	NC_013732	GCTTCT	2	12	86280	86291	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	284005834
27	NC_013732	GTCATA	2	12	86368	86379	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284005834
28	NC_013732	GGATGC	2	12	90797	90808	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284005844
29	NC_013732	TCATTC	2	12	90905	90916	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	284005844
30	NC_013732	CAAGAT	2	12	91927	91938	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	284005845
31	NC_013732	GCTCAT	2	12	93592	93603	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284005846
32	NC_013732	GACATC	2	12	93902	93913	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284005846
33	NC_013732	CGGTAC	2	12	97385	97396	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284005849
34	NC_013732	GTGCCG	2	12	97734	97745	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284005850
35	NC_013732	ACAAGA	2	12	97858	97869	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	284005850
36	NC_013732	CCCTGG	2	12	108501	108512	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	284005859
37	NC_013732	TTTTTG	2	12	112989	113000	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	284005864
38	NC_013732	CAGCGT	2	12	113419	113430	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284005865
39	NC_013732	ATGGTG	2	12	113537	113548	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	284005865
40	NC_013732	CAGTTC	2	12	115769	115780	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284005868
41	NC_013732	CGCCAG	2	12	115934	115945	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	284005868
42	NC_013732	CAGTAC	2	12	116888	116899	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284005869
43	NC_013732	TAGTGA	2	12	117143	117154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005869
44	NC_013732	CAGCGT	2	12	120541	120552	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284005873
45	NC_013732	GCTGGT	2	12	128611	128622	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	284005878
46	NC_013732	CAGTCC	2	12	136227	136238	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	284005887
47	NC_013732	CATCGA	2	12	136559	136570	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284005887
48	NC_013732	TTAAAA	2	12	145472	145483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005897
49	NC_013732	AGAAAT	2	12	146758	146769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284005897

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.