MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN02

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013732	ATACC	2	10	754	763	40 %	20 %	0 %	40 %	284005757
2	NC_013732	GTCAA	2	10	1281	1290	40 %	20 %	20 %	20 %	284005758
3	NC_013732	GGCTT	2	10	2305	2314	0 %	40 %	40 %	20 %	284005759
4	NC_013732	CAAAA	2	10	3676	3685	80 %	0 %	0 %	20 %	284005761
5	NC_013732	GTCGT	2	10	4073	4082	0 %	40 %	40 %	20 %	284005762
6	NC_013732	TTTCG	2	10	4667	4676	0 %	60 %	20 %	20 %	284005763
7	NC_013732	GGTCA	2	10	4823	4832	20 %	20 %	40 %	20 %	284005763
8	NC_013732	CCCCG	2	10	6282	6291	0 %	0 %	20 %	80 %	284005765
9	NC_013732	GAATG	2	10	7862	7871	40 %	20 %	40 %	0 %	284005767
10	NC_013732	CTCGG	2	10	10245	10254	0 %	20 %	40 %	40 %	284005768
11	NC_013732	ACCTT	2	10	13834	13843	20 %	40 %	0 %	40 %	284005773
12	NC_013732	CGATC	2	10	16042	16051	20 %	20 %	20 %	40 %	284005775
13	NC_013732	GAAAA	2	10	16284	16293	80 %	0 %	20 %	0 %	284005776
14	NC_013732	GGGCC	2	10	20117	20126	0 %	0 %	60 %	40 %	284005779
15	NC_013732	GGCCC	2	10	28542	28551	0 %	0 %	40 %	60 %	284005790
16	NC_013732	GCACG	2	10	28848	28857	20 %	0 %	40 %	40 %	284005790
17	NC_013732	ACCTG	2	10	28979	28988	20 %	20 %	20 %	40 %	284005790
18	NC_013732	CGGCC	2	10	30667	30676	0 %	0 %	40 %	60 %	284005793
19	NC_013732	ACCCC	2	10	33298	33307	20 %	0 %	0 %	80 %	284005795
20	NC_013732	CTGGA	2	10	34690	34699	20 %	20 %	40 %	20 %	284005797
21	NC_013732	TTAGT	2	10	35422	35431	20 %	60 %	20 %	0 %	284005798
22	NC_013732	CAACG	2	10	38927	38936	40 %	0 %	20 %	40 %	284005802
23	NC_013732	CACAA	2	10	39211	39220	60 %	0 %	0 %	40 %	284005803
24	NC_013732	TTCGG	2	10	39845	39854	0 %	40 %	40 %	20 %	284005804
25	NC_013732	GGCCC	2	10	44388	44397	0 %	0 %	40 %	60 %	284005805
26	NC_013732	GGTCG	2	10	45287	45296	0 %	20 %	60 %	20 %	284005806
27	NC_013732	TACGG	2	10	45973	45982	20 %	20 %	40 %	20 %	284005806
28	NC_013732	CACCG	2	10	47595	47604	20 %	0 %	20 %	60 %	284005807
29	NC_013732	ATGGC	2	10	49659	49668	20 %	20 %	40 %	20 %	284005809
30	NC_013732	GCCGG	2	10	53298	53307	0 %	0 %	60 %	40 %	284005811
31	NC_013732	TTGTT	2	10	53417	53426	0 %	80 %	20 %	0 %	284005812
32	NC_013732	CATGA	2	10	58834	58843	40 %	20 %	20 %	20 %	284005815
33	NC_013732	GTCGA	2	10	60034	60043	20 %	20 %	40 %	20 %	284005817
34	NC_013732	CGGCA	2	10	60406	60415	20 %	0 %	40 %	40 %	284005817
35	NC_013732	CTGGC	2	10	61288	61297	0 %	20 %	40 %	40 %	284005817
36	NC_013732	TGGTC	2	10	61548	61557	0 %	40 %	40 %	20 %	284005817
37	NC_013732	GAAGC	2	10	63038	63047	40 %	0 %	40 %	20 %	284005819
38	NC_013732	AGCCA	2	10	63373	63382	40 %	0 %	20 %	40 %	284005820
39	NC_013732	GCATC	2	10	66651	66660	20 %	20 %	20 %	40 %	284005822
40	NC_013732	GGCAT	2	10	67575	67584	20 %	20 %	40 %	20 %	284005823
41	NC_013732	CGGTT	2	10	68324	68333	0 %	40 %	40 %	20 %	284005824
42	NC_013732	TCGTC	2	10	70194	70203	0 %	40 %	20 %	40 %	284005825
43	NC_013732	GCACA	2	10	71517	71526	40 %	0 %	20 %	40 %	284005826
44	NC_013732	CCATC	2	10	72101	72110	20 %	20 %	0 %	60 %	284005827
45	NC_013732	GTTGG	2	10	72174	72183	0 %	40 %	60 %	0 %	284005827
46	NC_013732	TTTGC	2	10	72224	72233	0 %	60 %	20 %	20 %	284005827
47	NC_013732	CGAAA	2	10	74852	74861	60 %	0 %	20 %	20 %	284005828
48	NC_013732	GGTTG	2	10	75174	75183	0 %	40 %	60 %	0 %	284005828
49	NC_013732	CCGTA	2	10	77866	77875	20 %	20 %	20 %	40 %	284005828
50	NC_013732	GGGTT	2	10	78466	78475	0 %	40 %	60 %	0 %	284005828
51	NC_013732	ACCTA	2	10	82086	82095	40 %	20 %	0 %	40 %	284005832
52	NC_013732	GGGAA	2	10	88814	88823	40 %	0 %	60 %	0 %	284005839
53	NC_013732	CAACC	2	10	89185	89194	40 %	0 %	0 %	60 %	284005839
54	NC_013732	CAAAA	2	10	89873	89882	80 %	0 %	0 %	20 %	284005841
55	NC_013732	TGGTG	2	10	90581	90590	0 %	40 %	60 %	0 %	284005843
56	NC_013732	ATACG	2	10	95409	95418	40 %	20 %	20 %	20 %	284005848
57	NC_013732	CAAAT	2	10	98013	98022	60 %	20 %	0 %	20 %	284005850
58	NC_013732	ACGGC	2	10	98395	98404	20 %	0 %	40 %	40 %	284005850
59	NC_013732	AACGG	2	10	98975	98984	40 %	0 %	40 %	20 %	284005851
60	NC_013732	AGCGA	2	10	99255	99264	40 %	0 %	40 %	20 %	284005851
61	NC_013732	CCTGC	2	10	100218	100227	0 %	20 %	20 %	60 %	284005853
62	NC_013732	GGCTG	2	10	103619	103628	0 %	20 %	60 %	20 %	284005854
63	NC_013732	GGATT	2	10	104099	104108	20 %	40 %	40 %	0 %	284005854
64	NC_013732	AAAAG	2	10	105063	105072	80 %	0 %	20 %	0 %	284005855
65	NC_013732	TCCCT	2	10	105747	105756	0 %	40 %	0 %	60 %	284005856
66	NC_013732	CGACC	2	10	106833	106842	20 %	0 %	20 %	60 %	284005857
67	NC_013732	TTGGG	2	10	109423	109432	0 %	40 %	60 %	0 %	284005860
68	NC_013732	TAGGA	2	10	109842	109851	40 %	20 %	40 %	0 %	284005861
69	NC_013732	AGCCC	2	10	114030	114039	20 %	0 %	20 %	60 %	284005865
70	NC_013732	CAGCG	2	10	115907	115916	20 %	0 %	40 %	40 %	284005868
71	NC_013732	AGGAA	2	10	118214	118223	60 %	0 %	40 %	0 %	284005870
72	NC_013732	CCCCG	2	10	118353	118362	0 %	0 %	20 %	80 %	284005870
73	NC_013732	TAACG	2	10	120138	120147	40 %	20 %	20 %	20 %	284005873
74	NC_013732	CGGAA	2	10	127499	127508	40 %	0 %	40 %	20 %	284005878
75	NC_013732	GGTCG	2	10	128865	128874	0 %	20 %	60 %	20 %	284005878
76	NC_013732	CGATG	2	10	132091	132100	20 %	20 %	40 %	20 %	284005882
77	NC_013732	CCGCC	2	10	134675	134684	0 %	0 %	20 %	80 %	284005885
78	NC_013732	GTAGA	2	10	136493	136502	40 %	20 %	40 %	0 %	284005887
79	NC_013732	GTCCA	2	10	137171	137180	20 %	20 %	20 %	40 %	284005888
80	NC_013732	ACCCG	2	10	139168	139177	20 %	0 %	20 %	60 %	284005891
81	NC_013732	CCCGG	2	10	139657	139666	0 %	0 %	40 %	60 %	284005891
82	NC_013732	TGGCC	2	10	140247	140256	0 %	20 %	40 %	40 %	284005891
83	NC_013732	GTTAC	2	10	145414	145423	20 %	40 %	20 %	20 %	284005897
84	NC_013732	GATGG	2	10	146674	146683	20 %	20 %	60 %	0 %	284005897

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.