MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN02

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013732	GTAA	2	8	367	374	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013732	GATT	2	8	7196	7203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013732	TTGT	2	8	9151	9158	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013732	CTAT	2	8	11046	11053	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013732	AGGC	2	8	12278	12285	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013732	CAAA	2	8	14610	14617	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013732	AACA	2	8	19287	19294	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013732	AAAT	2	8	26582	26589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013732	GACA	2	8	26686	26693	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013732	TGGC	2	8	26818	26825	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013732	TTCG	2	8	27234	27241	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013732	ATCA	2	8	34778	34785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013732	GCAA	2	8	35701	35708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013732	CAAT	2	8	35783	35790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013732	CGAA	2	8	37253	37260	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013732	GCCA	2	8	37417	37424	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013732	CGTT	2	8	37496	37503	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_013732	AATA	2	8	37707	37714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013732	ACCA	2	8	39478	39485	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013732	TTAA	2	8	40166	40173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013732	ATGG	2	8	40309	40316	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013732	TACC	2	8	40348	40355	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013732	AACC	2	8	41541	41548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013732	AGGA	2	8	41743	41750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013732	AAGA	2	8	42258	42265	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013732	TAAA	2	8	50904	50911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013732	CCGA	2	8	55611	55618	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013732	GCCC	2	8	55711	55718	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_013732	GGTA	2	8	56050	56057	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013732	TGAA	2	8	59211	59218	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013732	CGAA	2	8	59886	59893	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013732	CGGA	2	8	62195	62202	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013732	GAAC	2	8	67276	67283	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013732	TAAA	2	8	72702	72709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013732	GATG	2	8	72848	72855	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013732	TTTC	2	8	84518	84525	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013732	CCAG	2	8	84811	84818	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013732	AGAA	2	8	84862	84869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013732	GTTT	2	8	85211	85218	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013732	TTAT	2	8	85962	85969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013732	GAAA	2	8	87420	87427	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013732	TGTC	2	8	88598	88605	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013732	AATT	2	8	88606	88613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013732	ATTT	2	8	100999	101006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013732	AAAT	2	8	104271	104278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013732	AAAT	2	8	104370	104377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013732	ATTT	2	8	104538	104545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013732	TTCC	2	8	109982	109989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013732	AAAT	2	8	110291	110298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013732	AAAT	2	8	110519	110526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013732	TCTG	2	8	116023	116030	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013732	TGCC	2	8	116107	116114	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013732	CCCA	2	8	117277	117284	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_013732	GTAA	2	8	117658	117665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013732	TTGA	2	8	120735	120742	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013732	GCGG	2	8	123315	123322	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013732	AACC	2	8	125617	125624	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013732	TGAT	2	8	125688	125695	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013732	GCCA	2	8	142757	142764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013732	AAGT	2	8	142967	142974	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013732	GTTC	2	8	143030	143037	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013732	ATTA	2	8	143420	143427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013732	AAAT	2	8	143433	143440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013732	TTAT	2	8	143489	143496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013732	AATG	2	8	143575	143582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013732	CAGT	2	8	146840	146847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.