MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN02

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013732	CG	3	6	802	807	0 %	0 %	50 %	50 %	284005757
2	NC_013732	AG	3	6	2047	2052	50 %	0 %	50 %	0 %	284005759
3	NC_013732	GA	3	6	2091	2096	50 %	0 %	50 %	0 %	284005759
4	NC_013732	CT	3	6	4909	4914	0 %	50 %	0 %	50 %	284005764
5	NC_013732	GA	3	6	5684	5689	50 %	0 %	50 %	0 %	284005765
6	NC_013732	TA	3	6	6523	6528	50 %	50 %	0 %	0 %	284005765
7	NC_013732	TC	3	6	6978	6983	0 %	50 %	0 %	50 %	284005766
8	NC_013732	CT	3	6	10056	10061	0 %	50 %	0 %	50 %	284005768
9	NC_013732	TC	3	6	15195	15200	0 %	50 %	0 %	50 %	284005774
10	NC_013732	TA	3	6	16785	16790	50 %	50 %	0 %	0 %	284005777
11	NC_013732	CT	3	6	19392	19397	0 %	50 %	0 %	50 %	284005779
12	NC_013732	GA	3	6	23539	23544	50 %	0 %	50 %	0 %	284005784
13	NC_013732	AC	3	6	26361	26366	50 %	0 %	0 %	50 %	284005788
14	NC_013732	CA	4	8	30463	30470	50 %	0 %	0 %	50 %	284005792
15	NC_013732	CG	3	6	31168	31173	0 %	0 %	50 %	50 %	284005793
16	NC_013732	CG	3	6	32597	32602	0 %	0 %	50 %	50 %	284005795
17	NC_013732	GC	3	6	32670	32675	0 %	0 %	50 %	50 %	284005795
18	NC_013732	TC	3	6	33643	33648	0 %	50 %	0 %	50 %	284005796
19	NC_013732	TC	3	6	36338	36343	0 %	50 %	0 %	50 %	284005800
20	NC_013732	AT	3	6	37003	37008	50 %	50 %	0 %	0 %	284005800
21	NC_013732	GT	3	6	37013	37018	0 %	50 %	50 %	0 %	284005800
22	NC_013732	AT	3	6	38507	38512	50 %	50 %	0 %	0 %	284005802
23	NC_013732	CT	3	6	39929	39934	0 %	50 %	0 %	50 %	284005804
24	NC_013732	GC	3	6	43763	43768	0 %	0 %	50 %	50 %	284005805
25	NC_013732	AT	3	6	46306	46311	50 %	50 %	0 %	0 %	284005807
26	NC_013732	AT	4	8	48951	48958	50 %	50 %	0 %	0 %	284005808
27	NC_013732	AT	4	8	49288	49295	50 %	50 %	0 %	0 %	284005808
28	NC_013732	CA	3	6	49950	49955	50 %	0 %	0 %	50 %	284005809
29	NC_013732	TG	3	6	50558	50563	0 %	50 %	50 %	0 %	284005809
30	NC_013732	GC	3	6	52694	52699	0 %	0 %	50 %	50 %	284005811
31	NC_013732	TC	3	6	59769	59774	0 %	50 %	0 %	50 %	284005816
32	NC_013732	GA	3	6	61055	61060	50 %	0 %	50 %	0 %	284005817
33	NC_013732	AC	3	6	62638	62643	50 %	0 %	0 %	50 %	284005819
34	NC_013732	GT	3	6	63684	63689	0 %	50 %	50 %	0 %	284005820
35	NC_013732	AT	3	6	64044	64049	50 %	50 %	0 %	0 %	284005820
36	NC_013732	CA	3	6	65549	65554	50 %	0 %	0 %	50 %	284005820
37	NC_013732	CG	3	6	65892	65897	0 %	0 %	50 %	50 %	284005820
38	NC_013732	AG	3	6	67136	67141	50 %	0 %	50 %	0 %	284005822
39	NC_013732	TG	3	6	69742	69747	0 %	50 %	50 %	0 %	284005825
40	NC_013732	AT	3	6	74162	74167	50 %	50 %	0 %	0 %	284005828
41	NC_013732	GA	3	6	74377	74382	50 %	0 %	50 %	0 %	284005828
42	NC_013732	GC	3	6	74401	74406	0 %	0 %	50 %	50 %	284005828
43	NC_013732	GC	3	6	76776	76781	0 %	0 %	50 %	50 %	284005828
44	NC_013732	AG	3	6	77954	77959	50 %	0 %	50 %	0 %	284005828
45	NC_013732	CA	3	6	79584	79589	50 %	0 %	0 %	50 %	284005828
46	NC_013732	AC	3	6	87081	87086	50 %	0 %	0 %	50 %	284005835
47	NC_013732	GA	3	6	88192	88197	50 %	0 %	50 %	0 %	284005838
48	NC_013732	CG	3	6	89678	89683	0 %	0 %	50 %	50 %	284005840
49	NC_013732	TA	3	6	90321	90326	50 %	50 %	0 %	0 %	284005842
50	NC_013732	CT	3	6	92564	92569	0 %	50 %	0 %	50 %	284005845
51	NC_013732	AC	3	6	98635	98640	50 %	0 %	0 %	50 %	284005850
52	NC_013732	TG	3	6	100590	100595	0 %	50 %	50 %	0 %	284005853
53	NC_013732	TC	3	6	100957	100962	0 %	50 %	0 %	50 %	284005853
54	NC_013732	GC	3	6	107170	107175	0 %	0 %	50 %	50 %	284005857
55	NC_013732	TC	3	6	109111	109116	0 %	50 %	0 %	50 %	284005860
56	NC_013732	GA	3	6	109850	109855	50 %	0 %	50 %	0 %	284005861
57	NC_013732	CG	3	6	114757	114762	0 %	0 %	50 %	50 %	284005866
58	NC_013732	GT	3	6	116854	116859	0 %	50 %	50 %	0 %	284005869
59	NC_013732	CT	3	6	118330	118335	0 %	50 %	0 %	50 %	284005870
60	NC_013732	GA	3	6	120488	120493	50 %	0 %	50 %	0 %	284005873
61	NC_013732	GC	3	6	121034	121039	0 %	0 %	50 %	50 %	284005874
62	NC_013732	GC	3	6	121086	121091	0 %	0 %	50 %	50 %	284005874
63	NC_013732	GC	3	6	122127	122132	0 %	0 %	50 %	50 %	284005874
64	NC_013732	AT	3	6	123625	123630	50 %	50 %	0 %	0 %	284005876
65	NC_013732	CG	3	6	128733	128738	0 %	0 %	50 %	50 %	284005878
66	NC_013732	GC	3	6	129289	129294	0 %	0 %	50 %	50 %	284005879
67	NC_013732	AC	3	6	130182	130187	50 %	0 %	0 %	50 %	284005880
68	NC_013732	CG	3	6	130842	130847	0 %	0 %	50 %	50 %	284005880
69	NC_013732	AT	3	6	131164	131169	50 %	50 %	0 %	0 %	284005881
70	NC_013732	CG	3	6	132351	132356	0 %	0 %	50 %	50 %	284005883
71	NC_013732	AC	3	6	135828	135833	50 %	0 %	0 %	50 %	284005887
72	NC_013732	TC	3	6	139236	139241	0 %	50 %	0 %	50 %	284005891
73	NC_013732	AT	3	6	139401	139406	50 %	50 %	0 %	0 %	284005891
74	NC_013732	GT	3	6	140877	140882	0 %	50 %	50 %	0 %	284005893
75	NC_013732	AT	3	6	143646	143651	50 %	50 %	0 %	0 %	284005896
76	NC_013732	CG	3	6	143916	143921	0 %	0 %	50 %	50 %	284005896
77	NC_013732	TC	3	6	144958	144963	0 %	50 %	0 %	50 %	284005897
78	NC_013732	AT	3	6	145590	145595	50 %	50 %	0 %	0 %	284005897
79	NC_013732	AG	3	6	145825	145830	50 %	0 %	50 %	0 %	284005897
80	NC_013732	TA	3	6	146659	146664	50 %	50 %	0 %	0 %	284005897
81	NC_013732	TA	3	6	146716	146721	50 %	50 %	0 %	0 %	284005897

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.