MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN01

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013731	GCAAG	2	10	2662	2671	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013731	TTTTA	2	10	20798	20807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013731	ATCAG	2	10	23911	23920	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013731	GCTTG	2	10	32619	32628	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013731	TACTT	2	10	34158	34167	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013731	AGGTA	2	10	47338	47347	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013731	TGAAG	2	10	70591	70600	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013731	CCTGC	2	10	74238	74247	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_013731	TATTC	2	10	76841	76850	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013731	TGAAA	2	10	87710	87719	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013731	GGCTA	2	10	87765	87774	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013731	TGTTT	2	10	110535	110544	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013731	CTTCT	2	10	115266	115275	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013731	CCGGG	2	10	116480	116489	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_013731	ATTAA	2	10	128379	128388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013731	ACGAG	2	10	159036	159045	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013731	GCCAT	2	10	160950	160959	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013731	AACTA	2	10	161672	161681	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013731	TATTC	2	10	180957	180966	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013731	GGCGG	2	10	181432	181441	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013731	TGGAG	2	10	182175	182184	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.