MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN01

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013731	ACGTT	2	10	1555	1564	20 %	40 %	20 %	20 %	284005578
2	NC_013731	ACCCA	2	10	3629	3638	40 %	0 %	0 %	60 %	284005580
3	NC_013731	CTGGC	2	10	4985	4994	0 %	20 %	40 %	40 %	284005580
4	NC_013731	TGATC	2	10	7076	7085	20 %	40 %	20 %	20 %	284005583
5	NC_013731	CACTG	2	10	7228	7237	20 %	20 %	20 %	40 %	284005583
6	NC_013731	CCCCG	2	10	7980	7989	0 %	0 %	20 %	80 %	284005583
7	NC_013731	ACGAA	2	10	10512	10521	60 %	0 %	20 %	20 %	284005585
8	NC_013731	GGGGC	2	10	11110	11119	0 %	0 %	80 %	20 %	284005586
9	NC_013731	CTTCC	2	10	16881	16890	0 %	40 %	0 %	60 %	284005592
10	NC_013731	GGCGT	2	10	18345	18354	0 %	20 %	60 %	20 %	284005594
11	NC_013731	CCAAT	2	10	26546	26555	40 %	20 %	0 %	40 %	284005603
12	NC_013731	GTTTG	2	10	27211	27220	0 %	60 %	40 %	0 %	284005604
13	NC_013731	ATTTG	2	10	30132	30141	20 %	60 %	20 %	0 %	284005607
14	NC_013731	CCAAG	2	10	30717	30726	40 %	0 %	20 %	40 %	284005607
15	NC_013731	GGCTA	2	10	31542	31551	20 %	20 %	40 %	20 %	284005608
16	NC_013731	TTTTA	2	10	33933	33942	20 %	80 %	0 %	0 %	284005610
17	NC_013731	CGACG	2	10	35144	35153	20 %	0 %	40 %	40 %	284005612
18	NC_013731	GCTTT	2	10	37647	37656	0 %	60 %	20 %	20 %	284005614
19	NC_013731	TTGGT	2	10	38645	38654	0 %	60 %	40 %	0 %	284005614
20	NC_013731	GGTTT	2	10	39821	39830	0 %	60 %	40 %	0 %	284005614
21	NC_013731	TCGTT	2	10	40614	40623	0 %	60 %	20 %	20 %	284005615
22	NC_013731	TAAGT	2	10	41830	41839	40 %	40 %	20 %	0 %	284005616
23	NC_013731	TGCAT	2	10	41946	41955	20 %	40 %	20 %	20 %	284005616
24	NC_013731	ATTGA	2	10	42650	42659	40 %	40 %	20 %	0 %	284005617
25	NC_013731	GGCAA	2	10	43126	43135	40 %	0 %	40 %	20 %	284005617
26	NC_013731	ATCTT	2	10	43318	43327	20 %	60 %	0 %	20 %	284005617
27	NC_013731	CCGTT	2	10	43817	43826	0 %	40 %	20 %	40 %	284005618
28	NC_013731	GATCA	2	10	43836	43845	40 %	20 %	20 %	20 %	284005618
29	NC_013731	ATTTT	2	10	44036	44045	20 %	80 %	0 %	0 %	284005618
30	NC_013731	GTCCA	2	10	45400	45409	20 %	20 %	20 %	40 %	284005618
31	NC_013731	AGACC	2	10	46117	46126	40 %	0 %	20 %	40 %	284005618
32	NC_013731	TAGAT	2	10	48468	48477	40 %	40 %	20 %	0 %	284005621
33	NC_013731	CGGCC	2	10	51159	51168	0 %	0 %	40 %	60 %	284005623
34	NC_013731	TGAAG	2	10	54725	54734	40 %	20 %	40 %	0 %	284005630
35	NC_013731	TTTTC	2	10	62719	62728	0 %	80 %	0 %	20 %	284005636
36	NC_013731	GTTTG	2	10	62821	62830	0 %	60 %	40 %	0 %	284005636
37	NC_013731	CCTAC	2	10	63414	63423	20 %	20 %	0 %	60 %	284005636
38	NC_013731	CCGAA	2	10	65904	65913	40 %	0 %	20 %	40 %	284005639
39	NC_013731	CAATC	2	10	66012	66021	40 %	20 %	0 %	40 %	284005639
40	NC_013731	CTGAC	2	10	66192	66201	20 %	20 %	20 %	40 %	284005639
41	NC_013731	AGGGG	2	10	68180	68189	20 %	0 %	80 %	0 %	284005644
42	NC_013731	CAACG	2	10	68329	68338	40 %	0 %	20 %	40 %	284005644
43	NC_013731	GATGG	2	10	70095	70104	20 %	20 %	60 %	0 %	284005644
44	NC_013731	AAAAG	2	10	71670	71679	80 %	0 %	20 %	0 %	284005646
45	NC_013731	TACTG	2	10	71715	71724	20 %	40 %	20 %	20 %	284005646
46	NC_013731	CAGGC	2	10	73318	73327	20 %	0 %	40 %	40 %	284005647
47	NC_013731	CGAAT	2	10	76499	76508	40 %	20 %	20 %	20 %	284005650
48	NC_013731	GGGTG	2	10	78943	78952	0 %	20 %	80 %	0 %	284005653
49	NC_013731	AATAG	2	10	79724	79733	60 %	20 %	20 %	0 %	284005655
50	NC_013731	TTTCT	2	10	80359	80368	0 %	80 %	0 %	20 %	284005657
51	NC_013731	TTCAA	2	10	88083	88092	40 %	40 %	0 %	20 %	284005662
52	NC_013731	GTCCC	2	10	88495	88504	0 %	20 %	20 %	60 %	284005662
53	NC_013731	TGACT	2	10	88774	88783	20 %	40 %	20 %	20 %	284005662
54	NC_013731	TTCAG	2	10	89344	89353	20 %	40 %	20 %	20 %	284005663
55	NC_013731	CTCAA	2	10	89542	89551	40 %	20 %	0 %	40 %	284005663
56	NC_013731	AAACG	2	10	89867	89876	60 %	0 %	20 %	20 %	284005664
57	NC_013731	AATTT	2	10	92133	92142	40 %	60 %	0 %	0 %	284005665
58	NC_013731	CCAAC	2	10	93357	93366	40 %	0 %	0 %	60 %	284005665
59	NC_013731	GCCCC	2	10	94487	94496	0 %	0 %	20 %	80 %	284005666
60	NC_013731	CCGCC	2	10	95915	95924	0 %	0 %	20 %	80 %	284005668
61	NC_013731	ACGGG	2	10	96296	96305	20 %	0 %	60 %	20 %	284005669
62	NC_013731	GCCAG	2	10	96641	96650	20 %	0 %	40 %	40 %	284005669
63	NC_013731	GGTGG	2	10	103092	103101	0 %	20 %	80 %	0 %	284005674
64	NC_013731	TTGCC	2	10	104221	104230	0 %	40 %	20 %	40 %	284005675
65	NC_013731	GAACA	2	10	104501	104510	60 %	0 %	20 %	20 %	284005676
66	NC_013731	CCCAA	2	10	105078	105087	40 %	0 %	0 %	60 %	284005677
67	NC_013731	CGCTT	2	10	110995	111004	0 %	40 %	20 %	40 %	284005681
68	NC_013731	CTTTG	2	10	111866	111875	0 %	60 %	20 %	20 %	284005681
69	NC_013731	CGCTT	2	10	111989	111998	0 %	40 %	20 %	40 %	284005681
70	NC_013731	ATCAC	2	10	112110	112119	40 %	20 %	0 %	40 %	284005681
71	NC_013731	GATAG	2	10	116745	116754	40 %	20 %	40 %	0 %	284005686
72	NC_013731	ACTAA	2	10	116882	116891	60 %	20 %	0 %	20 %	284005686
73	NC_013731	CCAAT	2	10	119292	119301	40 %	20 %	0 %	40 %	284005688
74	NC_013731	GCCGG	2	10	119774	119783	0 %	0 %	60 %	40 %	284005688
75	NC_013731	CAACC	2	10	119854	119863	40 %	0 %	0 %	60 %	284005688
76	NC_013731	CCGTC	2	10	122122	122131	0 %	20 %	20 %	60 %	284005690
77	NC_013731	CGGAC	2	10	135507	135516	20 %	0 %	40 %	40 %	284005701
78	NC_013731	GTCGG	2	10	141294	141303	0 %	20 %	60 %	20 %	284005703
79	NC_013731	AGCTC	2	10	142635	142644	20 %	20 %	20 %	40 %	284005704
80	NC_013731	GGCGG	2	10	149678	149687	0 %	0 %	80 %	20 %	284005714
81	NC_013731	GGGCC	2	10	152373	152382	0 %	0 %	60 %	40 %	284005717
82	NC_013731	AAGGA	2	10	153486	153495	60 %	0 %	40 %	0 %	284005717
83	NC_013731	AAGCG	2	10	153830	153839	40 %	0 %	40 %	20 %	284005717
84	NC_013731	CGCCC	2	10	160521	160530	0 %	0 %	20 %	80 %	284005726
85	NC_013731	TACGG	2	10	160571	160580	20 %	20 %	40 %	20 %	284005726
86	NC_013731	TTACG	2	10	162144	162153	20 %	40 %	20 %	20 %	284005728
87	NC_013731	CGTAG	2	10	164058	164067	20 %	20 %	40 %	20 %	284005732
88	NC_013731	CGGGT	2	10	167114	167123	0 %	20 %	60 %	20 %	284005734
89	NC_013731	ATAGT	2	10	169407	169416	40 %	40 %	20 %	0 %	284005736
90	NC_013731	TGGAT	2	10	170869	170878	20 %	40 %	40 %	0 %	284005738
91	NC_013731	CCCTT	2	10	172748	172757	0 %	40 %	0 %	60 %	284005740
92	NC_013731	CTGAC	2	10	174303	174312	20 %	20 %	20 %	40 %	284005742
93	NC_013731	CCGAT	2	10	174423	174432	20 %	20 %	20 %	40 %	284005742
94	NC_013731	CAAGC	2	10	174890	174899	40 %	0 %	20 %	40 %	284005742
95	NC_013731	AGTCA	2	10	175640	175649	40 %	20 %	20 %	20 %	284005743
96	NC_013731	AGCTA	2	10	177234	177243	40 %	20 %	20 %	20 %	284005746
97	NC_013731	TTTCG	2	10	177667	177676	0 %	60 %	20 %	20 %	284005746
98	NC_013731	CGATT	2	10	177782	177791	20 %	40 %	20 %	20 %	284005747
99	NC_013731	GAACA	2	10	183963	183972	60 %	0 %	20 %	20 %	284005750
100	NC_013731	CCGGG	2	10	186654	186663	0 %	0 %	60 %	40 %	284005752
101	NC_013731	CTGAT	2	10	188296	188305	20 %	40 %	20 %	20 %	284005753

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.