MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN01

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013731	TG	3	6	2319	2324	0 %	50 %	50 %	0 %	284005578
2	NC_013731	CG	3	6	5301	5306	0 %	0 %	50 %	50 %	284005580
3	NC_013731	AC	3	6	6263	6268	50 %	0 %	0 %	50 %	284005582
4	NC_013731	CA	3	6	6933	6938	50 %	0 %	0 %	50 %	284005583
5	NC_013731	AG	3	6	10141	10146	50 %	0 %	50 %	0 %	284005584
6	NC_013731	TA	3	6	10348	10353	50 %	50 %	0 %	0 %	284005585
7	NC_013731	GT	3	6	13134	13139	0 %	50 %	50 %	0 %	284005588
8	NC_013731	CT	3	6	16493	16498	0 %	50 %	0 %	50 %	284005591
9	NC_013731	AT	3	6	20233	20238	50 %	50 %	0 %	0 %	284005595
10	NC_013731	TA	3	6	21945	21950	50 %	50 %	0 %	0 %	284005597
11	NC_013731	AG	3	6	22125	22130	50 %	0 %	50 %	0 %	284005597
12	NC_013731	TG	3	6	22703	22708	0 %	50 %	50 %	0 %	284005598
13	NC_013731	AT	3	6	25092	25097	50 %	50 %	0 %	0 %	284005601
14	NC_013731	TG	3	6	25934	25939	0 %	50 %	50 %	0 %	284005603
15	NC_013731	TA	3	6	26605	26610	50 %	50 %	0 %	0 %	284005603
16	NC_013731	TG	3	6	28455	28460	0 %	50 %	50 %	0 %	284005605
17	NC_013731	TA	3	6	28647	28652	50 %	50 %	0 %	0 %	284005605
18	NC_013731	CT	3	6	31048	31053	0 %	50 %	0 %	50 %	284005607
19	NC_013731	AC	3	6	31931	31936	50 %	0 %	0 %	50 %	284005609
20	NC_013731	TA	3	6	32870	32875	50 %	50 %	0 %	0 %	284005610
21	NC_013731	AT	3	6	33414	33419	50 %	50 %	0 %	0 %	284005610
22	NC_013731	AT	3	6	35245	35250	50 %	50 %	0 %	0 %	284005612
23	NC_013731	CT	3	6	35266	35271	0 %	50 %	0 %	50 %	284005612
24	NC_013731	TG	3	6	36783	36788	0 %	50 %	50 %	0 %	284005613
25	NC_013731	CT	3	6	37439	37444	0 %	50 %	0 %	50 %	284005614
26	NC_013731	CG	3	6	38240	38245	0 %	0 %	50 %	50 %	284005614
27	NC_013731	TA	3	6	40541	40546	50 %	50 %	0 %	0 %	284005615
28	NC_013731	TA	3	6	41097	41102	50 %	50 %	0 %	0 %	284005615
29	NC_013731	TA	3	6	41118	41123	50 %	50 %	0 %	0 %	284005615
30	NC_013731	AT	4	8	41518	41525	50 %	50 %	0 %	0 %	284005615
31	NC_013731	CT	3	6	41881	41886	0 %	50 %	0 %	50 %	284005616
32	NC_013731	AT	3	6	42282	42287	50 %	50 %	0 %	0 %	284005616
33	NC_013731	TA	3	6	43084	43089	50 %	50 %	0 %	0 %	284005617
34	NC_013731	CA	3	6	43505	43510	50 %	0 %	0 %	50 %	284005618
35	NC_013731	CT	3	6	43642	43647	0 %	50 %	0 %	50 %	284005618
36	NC_013731	GT	3	6	46654	46659	0 %	50 %	50 %	0 %	284005619
37	NC_013731	AC	3	6	46819	46824	50 %	0 %	0 %	50 %	284005619
38	NC_013731	TC	3	6	47711	47716	0 %	50 %	0 %	50 %	284005621
39	NC_013731	TC	3	6	48028	48033	0 %	50 %	0 %	50 %	284005621
40	NC_013731	TA	3	6	48324	48329	50 %	50 %	0 %	0 %	284005621
41	NC_013731	TA	3	6	48633	48638	50 %	50 %	0 %	0 %	284005621
42	NC_013731	TA	3	6	48677	48682	50 %	50 %	0 %	0 %	284005621
43	NC_013731	AT	3	6	48921	48926	50 %	50 %	0 %	0 %	284005621
44	NC_013731	CT	3	6	49224	49229	0 %	50 %	0 %	50 %	284005621
45	NC_013731	CT	3	6	49384	49389	0 %	50 %	0 %	50 %	284005621
46	NC_013731	TC	3	6	50402	50407	0 %	50 %	0 %	50 %	284005622
47	NC_013731	GT	3	6	50571	50576	0 %	50 %	50 %	0 %	284005623
48	NC_013731	AG	3	6	52311	52316	50 %	0 %	50 %	0 %	284005626
49	NC_013731	AT	3	6	52324	52329	50 %	50 %	0 %	0 %	284005626
50	NC_013731	AT	3	6	52628	52633	50 %	50 %	0 %	0 %	284005627
51	NC_013731	TA	3	6	53393	53398	50 %	50 %	0 %	0 %	284005628
52	NC_013731	GT	3	6	55065	55070	0 %	50 %	50 %	0 %	284005630
53	NC_013731	CG	3	6	55888	55893	0 %	0 %	50 %	50 %	284005631
54	NC_013731	TG	3	6	56726	56731	0 %	50 %	50 %	0 %	284005631
55	NC_013731	AG	3	6	56775	56780	50 %	0 %	50 %	0 %	284005631
56	NC_013731	TG	3	6	57014	57019	0 %	50 %	50 %	0 %	284005631
57	NC_013731	TG	3	6	57949	57954	0 %	50 %	50 %	0 %	284005632
58	NC_013731	AT	4	8	59059	59066	50 %	50 %	0 %	0 %	284005632
59	NC_013731	TG	4	8	59193	59200	0 %	50 %	50 %	0 %	284005633
60	NC_013731	GA	3	6	59727	59732	50 %	0 %	50 %	0 %	284005633
61	NC_013731	CT	3	6	63119	63124	0 %	50 %	0 %	50 %	284005636
62	NC_013731	TC	3	6	63646	63651	0 %	50 %	0 %	50 %	284005636
63	NC_013731	AT	3	6	66166	66171	50 %	50 %	0 %	0 %	284005639
64	NC_013731	AT	3	6	66237	66242	50 %	50 %	0 %	0 %	284005639
65	NC_013731	GA	3	6	67276	67281	50 %	0 %	50 %	0 %	284005641
66	NC_013731	TA	3	6	68013	68018	50 %	50 %	0 %	0 %	284005643
67	NC_013731	AT	3	6	68639	68644	50 %	50 %	0 %	0 %	284005644
68	NC_013731	CA	3	6	71019	71024	50 %	0 %	0 %	50 %	284005645
69	NC_013731	GC	3	6	72034	72039	0 %	0 %	50 %	50 %	284005646
70	NC_013731	CA	3	6	73283	73288	50 %	0 %	0 %	50 %	284005647
71	NC_013731	AC	3	6	75119	75124	50 %	0 %	0 %	50 %	284005649
72	NC_013731	CT	3	6	75556	75561	0 %	50 %	0 %	50 %	284005649
73	NC_013731	GC	3	6	75694	75699	0 %	0 %	50 %	50 %	284005650
74	NC_013731	TG	3	6	78983	78988	0 %	50 %	50 %	0 %	284005653
75	NC_013731	CT	3	6	80891	80896	0 %	50 %	0 %	50 %	284005657
76	NC_013731	TC	3	6	81938	81943	0 %	50 %	0 %	50 %	284005657
77	NC_013731	CT	3	6	83012	83017	0 %	50 %	0 %	50 %	284005657
78	NC_013731	GT	3	6	83880	83885	0 %	50 %	50 %	0 %	284005657
79	NC_013731	AT	3	6	84621	84626	50 %	50 %	0 %	0 %	284005657
80	NC_013731	CT	3	6	85106	85111	0 %	50 %	0 %	50 %	284005657
81	NC_013731	TA	4	8	87965	87972	50 %	50 %	0 %	0 %	284005662
82	NC_013731	GT	3	6	88277	88282	0 %	50 %	50 %	0 %	284005662
83	NC_013731	CG	3	6	90038	90043	0 %	0 %	50 %	50 %	284005664
84	NC_013731	GA	3	6	93303	93308	50 %	0 %	50 %	0 %	284005665
85	NC_013731	TA	3	6	93536	93541	50 %	50 %	0 %	0 %	284005666
86	NC_013731	GT	3	6	93695	93700	0 %	50 %	50 %	0 %	284005666
87	NC_013731	AG	3	6	94452	94457	50 %	0 %	50 %	0 %	284005666
88	NC_013731	AG	4	8	97215	97222	50 %	0 %	50 %	0 %	284005669
89	NC_013731	CA	3	6	104107	104112	50 %	0 %	0 %	50 %	284005675
90	NC_013731	AG	3	6	105325	105330	50 %	0 %	50 %	0 %	284005678
91	NC_013731	GT	3	6	106286	106291	0 %	50 %	50 %	0 %	284005679
92	NC_013731	CG	3	6	110353	110358	0 %	0 %	50 %	50 %	284005680
93	NC_013731	CA	3	6	110796	110801	50 %	0 %	0 %	50 %	284005681
94	NC_013731	GC	3	6	111703	111708	0 %	0 %	50 %	50 %	284005681
95	NC_013731	CG	3	6	117000	117005	0 %	0 %	50 %	50 %	284005686
96	NC_013731	GC	3	6	117552	117557	0 %	0 %	50 %	50 %	284005686
97	NC_013731	GA	3	6	122303	122308	50 %	0 %	50 %	0 %	284005690
98	NC_013731	CG	3	6	123535	123540	0 %	0 %	50 %	50 %	284005690
99	NC_013731	CT	3	6	123639	123644	0 %	50 %	0 %	50 %	284005690
100	NC_013731	CG	3	6	124544	124549	0 %	0 %	50 %	50 %	284005690
101	NC_013731	AT	3	6	134045	134050	50 %	50 %	0 %	0 %	284005700
102	NC_013731	GC	3	6	136870	136875	0 %	0 %	50 %	50 %	284005702
103	NC_013731	TC	3	6	137294	137299	0 %	50 %	0 %	50 %	284005702
104	NC_013731	GC	3	6	139126	139131	0 %	0 %	50 %	50 %	284005702
105	NC_013731	GC	3	6	141320	141325	0 %	0 %	50 %	50 %	284005703
106	NC_013731	GT	3	6	148115	148120	0 %	50 %	50 %	0 %	284005712
107	NC_013731	GC	3	6	149190	149195	0 %	0 %	50 %	50 %	284005713
108	NC_013731	GT	3	6	150115	150120	0 %	50 %	50 %	0 %	284005714
109	NC_013731	AG	3	6	150446	150451	50 %	0 %	50 %	0 %	284005715
110	NC_013731	CA	3	6	151250	151255	50 %	0 %	0 %	50 %	284005716
111	NC_013731	CT	3	6	155909	155914	0 %	50 %	0 %	50 %	284005721
112	NC_013731	TG	3	6	157195	157200	0 %	50 %	50 %	0 %	284005723
113	NC_013731	GA	3	6	157680	157685	50 %	0 %	50 %	0 %	284005724
114	NC_013731	TA	3	6	157783	157788	50 %	50 %	0 %	0 %	284005724
115	NC_013731	AC	3	6	160092	160097	50 %	0 %	0 %	50 %	284005726
116	NC_013731	TC	3	6	164521	164526	0 %	50 %	0 %	50 %	284005732
117	NC_013731	AC	3	6	167534	167539	50 %	0 %	0 %	50 %	284005735
118	NC_013731	AG	3	6	168105	168110	50 %	0 %	50 %	0 %	284005735
119	NC_013731	TA	3	6	169370	169375	50 %	50 %	0 %	0 %	284005736
120	NC_013731	TA	3	6	171531	171536	50 %	50 %	0 %	0 %	284005738
121	NC_013731	GT	3	6	175254	175259	0 %	50 %	50 %	0 %	284005743
122	NC_013731	GT	3	6	186999	187004	0 %	50 %	50 %	0 %	284005752
123	NC_013731	CT	3	6	187665	187670	0 %	50 %	0 %	50 %	284005753
124	NC_013731	TG	3	6	188142	188147	0 %	50 %	50 %	0 %	284005753
125	NC_013731	AT	4	8	188592	188599	50 %	50 %	0 %	0 %	284005753
126	NC_013731	AT	3	6	189228	189233	50 %	50 %	0 %	0 %	284005754

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.