MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 chromosome

Total Repeats: 228

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013730	TTTCTG	2	12	19208	19219	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013730	TATTGT	2	12	44972	44983	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013730	TTCATT	2	12	77550	77561	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013730	AGGTAA	2	12	95712	95723	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013730	CCTGAC	2	12	110600	110611	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013730	TACTTG	2	12	148466	148477	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013730	AAGTCT	2	12	182235	182246	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013730	CGGTAT	2	12	182794	182805	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013730	CAGTTG	2	12	191688	191699	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013730	CTTTTG	2	12	207413	207424	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013730	TTGGGG	2	12	290884	290895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013730	GAAAAA	2	12	306101	306112	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013730	ACGTCC	2	12	313741	313752	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013730	GGACGT	2	12	313777	313788	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013730	AACGGA	2	12	387632	387643	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013730	TCTCGT	2	12	484556	484567	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013730	TGTTAA	2	12	532535	532546	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013730	CAACGG	2	12	737809	737820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013730	ATTTTG	2	12	757582	757593	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013730	CCATGC	2	12	786964	786975	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013730	TATGGA	2	12	845395	845406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013730	GTTGAG	2	12	915133	915144	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013730	CTCAAG	2	12	941789	941800	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013730	CCTCTG	2	12	952832	952843	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013730	TAGCTG	2	12	962045	962056	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013730	GATACT	2	12	991695	991706	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013730	AAACAG	2	12	1000325	1000336	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013730	GGTAAA	2	12	1006390	1006401	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013730	GCTTCG	2	12	1029451	1029462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013730	ATGCCA	2	12	1037682	1037693	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013730	CGCCTG	2	12	1043359	1043370	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013730	CTTTTG	2	12	1084931	1084942	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_013730	GCCAAC	2	12	1123481	1123492	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013730	TGTATA	2	12	1133739	1133750	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013730	GCCGGT	2	12	1140607	1140618	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013730	AATATT	2	12	1170201	1170212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013730	AACAAA	2	12	1200972	1200983	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013730	TACTGA	2	12	1325599	1325610	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013730	CTTTTG	2	12	1345091	1345102	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013730	AAGCGA	2	12	1349389	1349400	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013730	AGGTGG	2	12	1351510	1351521	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013730	AGCAAG	2	12	1368252	1368263	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013730	GTCAAA	2	12	1400375	1400386	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013730	GTTGAG	2	12	1408990	1409001	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013730	AATAAC	2	12	1422950	1422961	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013730	TTAAAT	2	12	1423092	1423103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013730	CTATCT	2	12	1447497	1447508	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013730	AGCTGT	2	12	1456984	1456995	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013730	ATTTTA	2	12	1481056	1481067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013730	TTTTTC	2	12	1627512	1627523	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013730	ACTTAT	2	12	1645488	1645499	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013730	AAACCA	2	12	1668579	1668590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013730	GATGTT	2	12	1738629	1738640	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013730	TTTCGC	2	12	1912711	1912722	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013730	CTTTTT	2	12	1928848	1928859	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013730	CGGTAA	2	12	1946797	1946808	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_013730	TGGCAA	2	12	1959105	1959116	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013730	TTTGGT	2	12	2028768	2028779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013730	CTTTTG	2	12	2044209	2044220	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013730	TCCAAT	2	12	2045989	2046000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013730	GGGTTC	2	12	2046228	2046239	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013730	GAAAAA	2	12	2083430	2083441	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013730	TATTTT	2	12	2146709	2146720	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013730	GGCTTA	2	12	2200688	2200699	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013730	ACTTTG	2	12	2306343	2306354	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013730	TGTTGG	2	12	2352194	2352205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013730	TTATCT	2	12	2359926	2359937	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013730	TAATTT	2	12	2376640	2376651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013730	GTTTTT	2	12	2453569	2453580	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013730	TAACCG	2	12	2501127	2501138	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013730	CACAAA	2	12	2510424	2510435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013730	CCGATT	2	12	2556752	2556763	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013730	CCGTTG	2	12	2556879	2556890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013730	GGATAG	2	12	2583957	2583968	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013730	GTACCT	2	12	2591463	2591474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013730	GAGCAG	2	12	2593249	2593260	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013730	CAAAGA	2	12	2596795	2596806	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013730	CTTTCA	2	12	2624188	2624199	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013730	TGCATC	2	12	2629493	2629504	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013730	ATAAAT	2	12	2635019	2635030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013730	ACTTAA	2	12	2637925	2637936	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013730	CAGAAC	2	12	2672978	2672989	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013730	TTGGTC	2	12	2707093	2707104	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013730	GTTCCA	2	12	2769208	2769219	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013730	TAAAAG	2	12	2773347	2773358	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013730	CTTTTG	2	12	2808123	2808134	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_013730	CTGCGG	2	12	2943272	2943283	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013730	ATAGAT	2	12	2967348	2967359	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013730	TCAATG	2	12	2970795	2970806	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013730	TATAGA	2	12	2977424	2977435	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013730	ATGCCA	2	12	3061669	3061680	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013730	TATTAG	2	12	3099417	3099428	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013730	AGGACA	2	12	3128190	3128201	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013730	ATAGAA	2	12	3138199	3138210	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013730	TCGCTT	2	12	3192909	3192920	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013730	CTGATT	2	12	3195737	3195748	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_013730	TCAAAA	2	12	3198519	3198530	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013730	AAGTAC	2	12	3203161	3203172	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_013730	TAAACT	2	12	3221935	3221946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_013730	TGACTT	2	12	3229906	3229917	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_013730	TGTTTG	2	12	3296824	3296835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013730	CAATGG	2	12	3405421	3405432	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_013730	CTATTA	2	12	3458866	3458877	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013730	CAGCTA	2	12	3459008	3459019	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013730	ACCGAC	2	12	3548574	3548585	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013730	AAATAA	2	12	3591026	3591037	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013730	ATCTGT	2	12	3611331	3611342	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013730	TAAAAT	2	12	3694271	3694282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013730	GAAGAG	2	12	3822129	3822140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013730	TTGTGT	2	12	3841215	3841226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013730	ATACTT	2	12	3856919	3856930	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_013730	CTTTTG	2	12	3868577	3868588	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013730	GGTGCC	2	12	3893565	3893576	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013730	TTTGAA	2	12	3928182	3928193	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013730	GCTGGC	2	12	3935488	3935499	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013730	CATATA	2	12	3973567	3973578	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_013730	AAAAAC	2	12	3995615	3995626	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_013730	ACTTGC	2	12	4068823	4068834	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013730	AACGTA	2	12	4101066	4101077	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_013730	AAAGGT	2	12	4175632	4175643	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013730	TACATA	2	12	4203854	4203865	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_013730	CCTTAA	2	12	4251988	4251999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013730	GTTTGG	2	12	4318755	4318766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013730	TTTGCC	2	12	4319857	4319868	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013730	GGACGT	2	12	4320505	4320516	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_013730	GGCTAT	2	12	4342097	4342108	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_013730	ATCGGT	2	12	4376109	4376120	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_013730	AACGCG	2	12	4403542	4403553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013730	AAACCC	2	12	4418425	4418436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013730	TAAAAT	2	12	4438327	4438338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013730	GCTGAA	2	12	4448882	4448893	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_013730	AGATCA	2	12	4449587	4449598	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_013730	GCATTA	2	12	4457530	4457541	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_013730	TACAAT	2	12	4460662	4460673	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_013730	GTCATC	2	12	4472602	4472613	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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137	NC_013730	ACCTGC	2	12	4597806	4597817	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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139	NC_013730	ATAATT	2	12	4663772	4663783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_013730	CTTGAT	2	12	4980112	4980123	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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148	NC_013730	CGACCT	2	12	5046789	5046800	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013730	CATTTT	2	12	5109331	5109342	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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153	NC_013730	CAAAAG	2	12	5222492	5222503	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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226	NC_013730	AAATTT	2	12	7921879	7921890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
227	NC_013730	GGGGAG	2	12	7928315	7928326	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
228	NC_013730	CTATTC	2	12	7928399	7928410	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.