MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 chromosome

Total Repeats: 2833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013722	GCAAT	2	10	721	730	40 %	20 %	20 %	20 %	285016822
2	NC_013722	GCCTG	2	10	1018	1027	0 %	20 %	40 %	40 %	285016822
3	NC_013722	ACCAC	2	10	1462	1471	40 %	0 %	0 %	60 %	285016822
4	NC_013722	ATTGA	2	10	3253	3262	40 %	40 %	20 %	0 %	285016824
5	NC_013722	GCAGC	2	10	9963	9972	20 %	0 %	40 %	40 %	285016828
6	NC_013722	CCGGT	2	10	11548	11557	0 %	20 %	40 %	40 %	285016830
7	NC_013722	CGTCG	2	10	13415	13424	0 %	20 %	40 %	40 %	285016834
8	NC_013722	TTGGC	2	10	13512	13521	0 %	40 %	40 %	20 %	285016834
9	NC_013722	ATCGC	2	10	14251	14260	20 %	20 %	20 %	40 %	285016835
10	NC_013722	CGCAG	2	10	15219	15228	20 %	0 %	40 %	40 %	285016836
11	NC_013722	CACTG	2	10	15644	15653	20 %	20 %	20 %	40 %	285016836
12	NC_013722	TGGCC	2	10	22030	22039	0 %	20 %	40 %	40 %	285016842
13	NC_013722	TGGCA	2	10	22580	22589	20 %	20 %	40 %	20 %	285016842
14	NC_013722	ATGGC	2	10	24292	24301	20 %	20 %	40 %	20 %	285016843
15	NC_013722	TGGGA	2	10	25076	25085	20 %	20 %	60 %	0 %	285016844
16	NC_013722	CACTG	2	10	26235	26244	20 %	20 %	20 %	40 %	285016845
17	NC_013722	GTCGT	2	10	28374	28383	0 %	40 %	40 %	20 %	285016846
18	NC_013722	TGGCG	2	10	30494	30503	0 %	20 %	60 %	20 %	285016846
19	NC_013722	GCGCC	2	10	31035	31044	0 %	0 %	40 %	60 %	285016847
20	NC_013722	CTGCG	2	10	32152	32161	0 %	20 %	40 %	40 %	285016847
21	NC_013722	CGCGG	2	10	32373	32382	0 %	0 %	60 %	40 %	285016847
22	NC_013722	TCGGC	2	10	32703	32712	0 %	20 %	40 %	40 %	285016847
23	NC_013722	GTCGG	2	10	34040	34049	0 %	20 %	60 %	20 %	285016847
24	NC_013722	GCCGC	2	10	34493	34502	0 %	0 %	40 %	60 %	285016847
25	NC_013722	GGCCT	2	10	36263	36272	0 %	20 %	40 %	40 %	285016850
26	NC_013722	CGATG	2	10	37059	37068	20 %	20 %	40 %	20 %	285016851
27	NC_013722	CCGCG	2	10	37462	37471	0 %	0 %	40 %	60 %	285016852
28	NC_013722	CGGAT	2	10	38516	38525	20 %	20 %	40 %	20 %	285016853
29	NC_013722	CGTTG	2	10	40857	40866	0 %	40 %	40 %	20 %	285016855
30	NC_013722	CCATG	2	10	43766	43775	20 %	20 %	20 %	40 %	285016857
31	NC_013722	GCGAT	2	10	44035	44044	20 %	20 %	40 %	20 %	285016857
32	NC_013722	CAGAA	2	10	44682	44691	60 %	0 %	20 %	20 %	285016858
33	NC_013722	ACCGC	2	10	45210	45219	20 %	0 %	20 %	60 %	285016858
34	NC_013722	CGGTC	2	10	47933	47942	0 %	20 %	40 %	40 %	285016859
35	NC_013722	CCTGG	2	10	48011	48020	0 %	20 %	40 %	40 %	285016859
36	NC_013722	GCAAC	2	10	49384	49393	40 %	0 %	20 %	40 %	285016860
37	NC_013722	CCATT	2	10	50079	50088	20 %	40 %	0 %	40 %	285016860
38	NC_013722	GGCGT	2	10	50609	50618	0 %	20 %	60 %	20 %	285016861
39	NC_013722	GCGCC	2	10	55047	55056	0 %	0 %	40 %	60 %	285016864
40	NC_013722	CGGGT	2	10	55603	55612	0 %	20 %	60 %	20 %	285016864
41	NC_013722	GCATG	2	10	57112	57121	20 %	20 %	40 %	20 %	285016865
42	NC_013722	TGCTG	2	10	57347	57356	0 %	40 %	40 %	20 %	285016866
43	NC_013722	CAGTT	2	10	58840	58849	20 %	40 %	20 %	20 %	285016866
44	NC_013722	TGGCG	2	10	58866	58875	0 %	20 %	60 %	20 %	285016866
45	NC_013722	GCGCC	2	10	59209	59218	0 %	0 %	40 %	60 %	285016866
46	NC_013722	GAACG	2	10	60234	60243	40 %	0 %	40 %	20 %	285016866
47	NC_013722	CGATG	2	10	61933	61942	20 %	20 %	40 %	20 %	285016867
48	NC_013722	GTGCG	2	10	63781	63790	0 %	20 %	60 %	20 %	285016869
49	NC_013722	TGCGG	2	10	66334	66343	0 %	20 %	60 %	20 %	285016871
50	NC_013722	AGCCA	2	10	68036	68045	40 %	0 %	20 %	40 %	285016872
51	NC_013722	CGACG	2	10	70475	70484	20 %	0 %	40 %	40 %	285016875
52	NC_013722	CGATG	2	10	72350	72359	20 %	20 %	40 %	20 %	285016878
53	NC_013722	CGCAT	2	10	74050	74059	20 %	20 %	20 %	40 %	285016879
54	NC_013722	CGGCG	2	10	74417	74426	0 %	0 %	60 %	40 %	285016879
55	NC_013722	GCCAG	2	10	74474	74483	20 %	0 %	40 %	40 %	285016879
56	NC_013722	TGGCG	2	10	75030	75039	0 %	20 %	60 %	20 %	285016879
57	NC_013722	GCGCC	2	10	78267	78276	0 %	0 %	40 %	60 %	285016881
58	NC_013722	CGCGG	2	10	79616	79625	0 %	0 %	60 %	40 %	285016882
59	NC_013722	GCCGC	2	10	79667	79676	0 %	0 %	40 %	60 %	285016882
60	NC_013722	GCGCC	2	10	79880	79889	0 %	0 %	40 %	60 %	285016882
61	NC_013722	CCCGA	2	10	79992	80001	20 %	0 %	20 %	60 %	285016882
62	NC_013722	CGCGG	2	10	80560	80569	0 %	0 %	60 %	40 %	285016882
63	NC_013722	CGCGT	2	10	82162	82171	0 %	20 %	40 %	40 %	285016883
64	NC_013722	CGCGG	2	10	83472	83481	0 %	0 %	60 %	40 %	285016883
65	NC_013722	GCGCG	2	10	84418	84427	0 %	0 %	60 %	40 %	285016884
66	NC_013722	CTGCG	2	10	84834	84843	0 %	20 %	40 %	40 %	285016885
67	NC_013722	CGTGG	2	10	85280	85289	0 %	20 %	60 %	20 %	285016885
68	NC_013722	GAATG	2	10	86060	86069	40 %	20 %	40 %	0 %	285016885
69	NC_013722	CCGGC	2	10	87834	87843	0 %	0 %	40 %	60 %	285016887
70	NC_013722	CTGCG	2	10	88183	88192	0 %	20 %	40 %	40 %	285016887
71	NC_013722	GCCGC	2	10	89993	90002	0 %	0 %	40 %	60 %	285016889
72	NC_013722	GCCAA	2	10	95064	95073	40 %	0 %	20 %	40 %	285016895
73	NC_013722	CAGCG	2	10	95529	95538	20 %	0 %	40 %	40 %	285016896
74	NC_013722	GCGCC	2	10	95908	95917	0 %	0 %	40 %	60 %	285016896
75	NC_013722	CGCGC	2	10	96370	96379	0 %	0 %	40 %	60 %	285016897
76	NC_013722	CCAGT	2	10	98476	98485	20 %	20 %	20 %	40 %	285016898
77	NC_013722	CGGGT	2	10	98603	98612	0 %	20 %	60 %	20 %	285016898
78	NC_013722	AGCCG	2	10	99184	99193	20 %	0 %	40 %	40 %	285016899
79	NC_013722	CTGGG	2	10	99396	99405	0 %	20 %	60 %	20 %	285016899
80	NC_013722	CGCTG	2	10	104039	104048	0 %	20 %	40 %	40 %	285016903
81	NC_013722	GCGCT	2	10	105146	105155	0 %	20 %	40 %	40 %	285016903
82	NC_013722	CGGCC	2	10	106238	106247	0 %	0 %	40 %	60 %	285016904
83	NC_013722	CGCGC	2	10	106521	106530	0 %	0 %	40 %	60 %	285016904
84	NC_013722	GCGCA	2	10	107925	107934	20 %	0 %	40 %	40 %	285016905
85	NC_013722	AGGCC	2	10	108400	108409	20 %	0 %	40 %	40 %	285016905
86	NC_013722	TGCGC	2	10	109696	109705	0 %	20 %	40 %	40 %	285016905
87	NC_013722	GCCAG	2	10	109783	109792	20 %	0 %	40 %	40 %	285016905
88	NC_013722	ACCGC	2	10	111424	111433	20 %	0 %	20 %	60 %	285016906
89	NC_013722	GCACC	2	10	112033	112042	20 %	0 %	20 %	60 %	285016906
90	NC_013722	CTGGC	2	10	114578	114587	0 %	20 %	40 %	40 %	285016907
91	NC_013722	CGTTC	2	10	115497	115506	0 %	40 %	20 %	40 %	285016907
92	NC_013722	GCTGG	2	10	119093	119102	0 %	20 %	60 %	20 %	285016909
93	NC_013722	CGCGC	2	10	119413	119422	0 %	0 %	40 %	60 %	285016909
94	NC_013722	GTTGC	2	10	121606	121615	0 %	40 %	40 %	20 %	285016911
95	NC_013722	CCGCG	2	10	123084	123093	0 %	0 %	40 %	60 %	285016912
96	NC_013722	CCAGG	2	10	123781	123790	20 %	0 %	40 %	40 %	285016913
97	NC_013722	GGACG	2	10	124881	124890	20 %	0 %	60 %	20 %	285016913
98	NC_013722	GCTGG	2	10	125647	125656	0 %	20 %	60 %	20 %	285016914
99	NC_013722	CGGAG	2	10	127826	127835	20 %	0 %	60 %	20 %	285016916
100	NC_013722	CTGCC	2	10	129653	129662	0 %	20 %	20 %	60 %	285016917
101	NC_013722	CCAGG	2	10	131032	131041	20 %	0 %	40 %	40 %	285016918
102	NC_013722	AGCGC	2	10	132438	132447	20 %	0 %	40 %	40 %	285016919
103	NC_013722	CACGC	2	10	133290	133299	20 %	0 %	20 %	60 %	285016920
104	NC_013722	CGGCC	2	10	134039	134048	0 %	0 %	40 %	60 %	285016922
105	NC_013722	CCCTG	2	10	134380	134389	0 %	20 %	20 %	60 %	285016922
106	NC_013722	CTGGC	2	10	134450	134459	0 %	20 %	40 %	40 %	285016922
107	NC_013722	GCGCC	2	10	135055	135064	0 %	0 %	40 %	60 %	285016923
108	NC_013722	CGCCA	2	10	135809	135818	20 %	0 %	20 %	60 %	285016923
109	NC_013722	CTTCC	2	10	136233	136242	0 %	40 %	0 %	60 %	285016924
110	NC_013722	GCGCG	2	10	139916	139925	0 %	0 %	60 %	40 %	285016928
111	NC_013722	CGGCG	2	10	142021	142030	0 %	0 %	60 %	40 %	285016932
112	NC_013722	CGCTG	2	10	142179	142188	0 %	20 %	40 %	40 %	285016932
113	NC_013722	GGCGC	2	10	142879	142888	0 %	0 %	60 %	40 %	285016932
114	NC_013722	TGCAT	2	10	143539	143548	20 %	40 %	20 %	20 %	285016933
115	NC_013722	GCACG	2	10	144190	144199	20 %	0 %	40 %	40 %	285016933
116	NC_013722	CATCG	2	10	145115	145124	20 %	20 %	20 %	40 %	285016934
117	NC_013722	GCATG	2	10	145156	145165	20 %	20 %	40 %	20 %	285016934
118	NC_013722	TCGCT	2	10	145633	145642	0 %	40 %	20 %	40 %	285016934
119	NC_013722	GGCGC	2	10	145764	145773	0 %	0 %	60 %	40 %	285016934
120	NC_013722	CGGTG	2	10	147417	147426	0 %	20 %	60 %	20 %	285016935
121	NC_013722	TTCCA	2	10	148741	148750	20 %	40 %	0 %	40 %	285016935
122	NC_013722	GGCCG	2	10	151916	151925	0 %	0 %	60 %	40 %	285016939
123	NC_013722	GTGGC	2	10	153047	153056	0 %	20 %	60 %	20 %	285016940
124	NC_013722	CCAGC	2	10	154002	154011	20 %	0 %	20 %	60 %	285016940
125	NC_013722	TCCGA	2	10	154201	154210	20 %	20 %	20 %	40 %	285016940
126	NC_013722	GCGCC	2	10	154446	154455	0 %	0 %	40 %	60 %	285016940
127	NC_013722	CAGGG	2	10	155837	155846	20 %	0 %	60 %	20 %	285016941
128	NC_013722	CATCG	2	10	157147	157156	20 %	20 %	20 %	40 %	285016942
129	NC_013722	GCTGG	2	10	161941	161950	0 %	20 %	60 %	20 %	285016945
130	NC_013722	CGGCG	2	10	161974	161983	0 %	0 %	60 %	40 %	285016945
131	NC_013722	GCCGC	2	10	163867	163876	0 %	0 %	40 %	60 %	285016946
132	NC_013722	GGTCG	2	10	165421	165430	0 %	20 %	60 %	20 %	285016948
133	NC_013722	GCCGC	2	10	165452	165461	0 %	0 %	40 %	60 %	285016948
134	NC_013722	CTGGC	2	10	165981	165990	0 %	20 %	40 %	40 %	285016948
135	NC_013722	ATTGC	2	10	169085	169094	20 %	40 %	20 %	20 %	285016954
136	NC_013722	CGCTG	2	10	170018	170027	0 %	20 %	40 %	40 %	285016955
137	NC_013722	GCGAC	2	10	170044	170053	20 %	0 %	40 %	40 %	285016955
138	NC_013722	GCGCA	2	10	172547	172556	20 %	0 %	40 %	40 %	285016957
139	NC_013722	TCGCG	2	10	173056	173065	0 %	20 %	40 %	40 %	285016958
140	NC_013722	GGCCG	2	10	173280	173289	0 %	0 %	60 %	40 %	285016958
141	NC_013722	TCGCA	2	10	176639	176648	20 %	20 %	20 %	40 %	285016960
142	NC_013722	CCGAC	2	10	179539	179548	20 %	0 %	20 %	60 %	285016963
143	NC_013722	GGCGC	2	10	179754	179763	0 %	0 %	60 %	40 %	285016963
144	NC_013722	GCGCG	2	10	180032	180041	0 %	0 %	60 %	40 %	285016963
145	NC_013722	TGCAC	2	10	182009	182018	20 %	20 %	20 %	40 %	285016965
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147	NC_013722	CCAAT	2	10	184185	184194	40 %	20 %	0 %	40 %	285016966
148	NC_013722	TGCGC	2	10	186698	186707	0 %	20 %	40 %	40 %	285016967
149	NC_013722	CGATG	2	10	187124	187133	20 %	20 %	40 %	20 %	285016967
150	NC_013722	AGCCG	2	10	187538	187547	20 %	0 %	40 %	40 %	285016967
151	NC_013722	CGTGG	2	10	188438	188447	0 %	20 %	60 %	20 %	285016968
152	NC_013722	GGCCG	2	10	189715	189724	0 %	0 %	60 %	40 %	285016968
153	NC_013722	CGGTG	2	10	190576	190585	0 %	20 %	60 %	20 %	285016968
154	NC_013722	CCGGG	2	10	191332	191341	0 %	0 %	60 %	40 %	285016969
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156	NC_013722	CCACG	2	10	198428	198437	20 %	0 %	20 %	60 %	285016973
157	NC_013722	TGGAT	2	10	198439	198448	20 %	40 %	40 %	0 %	285016973
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159	NC_013722	CGGCC	2	10	201213	201222	0 %	0 %	40 %	60 %	285016978
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163	NC_013722	GGATC	2	10	205086	205095	20 %	20 %	40 %	20 %	285016982
164	NC_013722	TGGGC	2	10	206643	206652	0 %	20 %	60 %	20 %	285016982
165	NC_013722	GAAGA	2	10	207007	207016	60 %	0 %	40 %	0 %	285016982
166	NC_013722	TGCGG	2	10	208832	208841	0 %	20 %	60 %	20 %	285016984
167	NC_013722	GTCAG	2	10	208995	209004	20 %	20 %	40 %	20 %	285016984
168	NC_013722	GCCCA	2	10	210156	210165	20 %	0 %	20 %	60 %	285016986
169	NC_013722	TGCGC	2	10	211933	211942	0 %	20 %	40 %	40 %	285016987
170	NC_013722	ATGTC	2	10	213436	213445	20 %	40 %	20 %	20 %	285016989
171	NC_013722	CCGCA	2	10	214169	214178	20 %	0 %	20 %	60 %	285016989
172	NC_013722	GCACT	2	10	215748	215757	20 %	20 %	20 %	40 %	285016990
173	NC_013722	CGCGC	2	10	217586	217595	0 %	0 %	40 %	60 %	285016990
174	NC_013722	TTGCT	2	10	220037	220046	0 %	60 %	20 %	20 %	285016993
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176	NC_013722	CATGC	2	10	223402	223411	20 %	20 %	20 %	40 %	285016999
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178	NC_013722	GCCAT	2	10	223799	223808	20 %	20 %	20 %	40 %	285017000
179	NC_013722	CGTTG	2	10	231214	231223	0 %	40 %	40 %	20 %	285017014
180	NC_013722	ACGCA	2	10	232386	232395	40 %	0 %	20 %	40 %	285017016
181	NC_013722	CAAGG	2	10	232443	232452	40 %	0 %	40 %	20 %	285017016
182	NC_013722	GGCAC	2	10	232869	232878	20 %	0 %	40 %	40 %	285017018
183	NC_013722	GCGAT	2	10	233539	233548	20 %	20 %	40 %	20 %	285017019
184	NC_013722	GATCG	2	10	236132	236141	20 %	20 %	40 %	20 %	285017020
185	NC_013722	ACCGC	2	10	237939	237948	20 %	0 %	20 %	60 %	285017023
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195	NC_013722	GCCGC	2	10	245832	245841	0 %	0 %	40 %	60 %	285017031
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202	NC_013722	CTGCA	2	10	249608	249617	20 %	20 %	20 %	40 %	285017037
203	NC_013722	CATGC	2	10	250636	250645	20 %	20 %	20 %	40 %	285017040
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238	NC_013722	CGAGC	2	10	298655	298664	20 %	0 %	40 %	40 %	285017089
239	NC_013722	GCCCA	2	10	300580	300589	20 %	0 %	20 %	60 %	285017091
240	NC_013722	AGGCC	2	10	301877	301886	20 %	0 %	40 %	40 %	285017091
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242	NC_013722	CGGCC	2	10	302750	302759	0 %	0 %	40 %	60 %	285017092
243	NC_013722	GGCGC	2	10	303091	303100	0 %	0 %	60 %	40 %	285017092
244	NC_013722	CGGCG	2	10	303426	303435	0 %	0 %	60 %	40 %	285017092
245	NC_013722	CGCGC	2	10	303448	303457	0 %	0 %	40 %	60 %	285017092
246	NC_013722	CATCG	2	10	303577	303586	20 %	20 %	20 %	40 %	285017093
247	NC_013722	CGGGC	2	10	304392	304401	0 %	0 %	60 %	40 %	285017094
248	NC_013722	TCGGG	2	10	305054	305063	0 %	20 %	60 %	20 %	285017094
249	NC_013722	CAGGC	2	10	305196	305205	20 %	0 %	40 %	40 %	285017094
250	NC_013722	GACGA	2	10	309004	309013	40 %	0 %	40 %	20 %	285017099
251	NC_013722	GCGTG	2	10	312062	312071	0 %	20 %	60 %	20 %	285017102
252	NC_013722	GCCCG	2	10	312083	312092	0 %	0 %	40 %	60 %	285017102
253	NC_013722	CCAGG	2	10	312251	312260	20 %	0 %	40 %	40 %	285017102
254	NC_013722	GCGAT	2	10	320850	320859	20 %	20 %	40 %	20 %	285017114
255	NC_013722	TGCAG	2	10	324845	324854	20 %	20 %	40 %	20 %	285017116
256	NC_013722	CGCAG	2	10	324924	324933	20 %	0 %	40 %	40 %	285017116
257	NC_013722	CAAGC	2	10	325156	325165	40 %	0 %	20 %	40 %	285017116
258	NC_013722	TTGTC	2	10	325703	325712	0 %	60 %	20 %	20 %	285017116
259	NC_013722	GCCGC	2	10	326739	326748	0 %	0 %	40 %	60 %	285017117
260	NC_013722	GCCAG	2	10	328685	328694	20 %	0 %	40 %	40 %	285017120
261	NC_013722	GCGAC	2	10	329458	329467	20 %	0 %	40 %	40 %	285017121
262	NC_013722	GCGAT	2	10	329936	329945	20 %	20 %	40 %	20 %	285017121
263	NC_013722	GCGCC	2	10	330743	330752	0 %	0 %	40 %	60 %	285017122
264	NC_013722	CGAGC	2	10	333486	333495	20 %	0 %	40 %	40 %	285017123
265	NC_013722	TCGCC	2	10	333608	333617	0 %	20 %	20 %	60 %	285017123
266	NC_013722	GCCGG	2	10	333789	333798	0 %	0 %	60 %	40 %	285017123
267	NC_013722	GGCGC	2	10	334849	334858	0 %	0 %	60 %	40 %	285017124
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271	NC_013722	TGCAG	2	10	340174	340183	20 %	20 %	40 %	20 %	285017128
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273	NC_013722	GGTGT	2	10	340410	340419	0 %	40 %	60 %	0 %	285017128
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285	NC_013722	CCTTG	2	10	358272	358281	0 %	40 %	20 %	40 %	285017143
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297	NC_013722	CAGCG	2	10	384152	384161	20 %	0 %	40 %	40 %	285017162
298	NC_013722	TGGAG	2	10	386645	386654	20 %	20 %	60 %	0 %	285017164
299	NC_013722	TACGG	2	10	388029	388038	20 %	20 %	40 %	20 %	285017165
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382	NC_013722	GCGCA	2	10	475462	475471	20 %	0 %	40 %	40 %	285017233
383	NC_013722	GTGGC	2	10	476142	476151	0 %	20 %	60 %	20 %	285017233
384	NC_013722	GTGTT	2	10	479175	479184	0 %	60 %	40 %	0 %	285017236
385	NC_013722	CGCAG	2	10	479599	479608	20 %	0 %	40 %	40 %	285017237
386	NC_013722	CGCAG	2	10	480464	480473	20 %	0 %	40 %	40 %	285017238
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388	NC_013722	GCGCC	2	10	483168	483177	0 %	0 %	40 %	60 %	285017240
389	NC_013722	CCCCA	2	10	483599	483608	20 %	0 %	0 %	80 %	285017240
390	NC_013722	GCCGT	3	15	486143	486157	0 %	20 %	40 %	40 %	285017243
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499	NC_013722	CATCG	2	10	633422	633431	20 %	20 %	20 %	40 %	285017382
500	NC_013722	TGCCG	2	10	633957	633966	0 %	20 %	40 %	40 %	285017382

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