MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas albilineans GPE PC73 chromosome

Total Repeats: 54605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013722	AGC	2	6	319	324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016822
2	NC_013722	ACA	2	6	331	336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	285016822
3	NC_013722	GCC	2	6	486	491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016822
4	NC_013722	GTT	2	6	530	535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	285016822
5	NC_013722	TCG	2	6	583	588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016822
6	NC_013722	GCA	2	6	595	600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016822
7	NC_013722	GCT	3	9	665	673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016822
8	NC_013722	GCA	2	6	679	684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016822
9	NC_013722	TTC	2	6	780	785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	285016822
10	NC_013722	AGA	2	6	811	816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	285016822
11	NC_013722	CAG	2	6	843	848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016822
12	NC_013722	GCT	2	6	857	862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016822
13	NC_013722	CGA	2	6	866	871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016822
14	NC_013722	TTC	2	6	879	884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	285016822
15	NC_013722	TTC	2	6	912	917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	285016822
16	NC_013722	CAG	2	6	948	953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016822
17	NC_013722	ATC	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	285016822
18	NC_013722	CAC	2	6	1226	1231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	285016822
19	NC_013722	CAG	3	9	1272	1280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016822
20	NC_013722	AGA	2	6	1303	1308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	285016822
21	NC_013722	ACT	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	285016822
22	NC_013722	TGC	2	6	1474	1479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016822
23	NC_013722	GTC	2	6	1879	1884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016823
24	NC_013722	CGT	2	6	1897	1902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016823
25	NC_013722	CGG	2	6	1944	1949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016823
26	NC_013722	GCA	2	6	2081	2086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016823
27	NC_013722	ACC	2	6	2197	2202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	285016823
28	NC_013722	CGT	2	6	2208	2213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016823
29	NC_013722	TTA	2	6	2283	2288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	285016823
30	NC_013722	GGC	2	6	2389	2394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016823
31	NC_013722	ATC	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	285016823
32	NC_013722	GCA	2	6	2623	2628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016823
33	NC_013722	AGG	3	9	2726	2734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	285016823
34	NC_013722	GAA	2	6	2740	2745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	285016823
35	NC_013722	GAG	2	6	2827	2832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	285016823
36	NC_013722	GTG	2	6	2836	2841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	285016823
37	NC_013722	AGT	2	6	2887	2892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	285016823
38	NC_013722	CAT	2	6	3229	3234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	285016824
39	NC_013722	CGT	2	6	3238	3243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016824
40	NC_013722	TCA	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	285016824
41	NC_013722	CGG	2	6	3463	3468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016824
42	NC_013722	GTC	2	6	3503	3508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016824
43	NC_013722	GGT	2	6	3558	3563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	285016824
44	NC_013722	GGT	2	6	3598	3603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	285016824
45	NC_013722	TCG	2	6	3623	3628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016824
46	NC_013722	GGC	2	6	3671	3676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016824
47	NC_013722	GCG	2	6	3733	3738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016824
48	NC_013722	CGT	2	6	3790	3795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016824
49	NC_013722	ATT	2	6	3800	3805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	285016824
50	NC_013722	CGA	2	6	3820	3825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016824
51	NC_013722	CTG	2	6	3826	3831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016824
52	NC_013722	GGC	2	6	3893	3898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016824
53	NC_013722	GTT	2	6	3924	3929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	285016824
54	NC_013722	ACC	2	6	3964	3969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	285016824
55	NC_013722	AGC	2	6	4097	4102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016824
56	NC_013722	GCG	2	6	4103	4108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016824
57	NC_013722	GAT	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	285016824
58	NC_013722	CAT	2	6	4156	4161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	285016824
59	NC_013722	CGC	2	6	4226	4231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016824
60	NC_013722	CGA	2	6	4424	4429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016825
61	NC_013722	AAC	2	6	4446	4451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	285016825
62	NC_013722	ACG	2	6	4459	4464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016825
63	NC_013722	CGA	2	6	4589	4594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016825
64	NC_013722	AAG	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	285016825
65	NC_013722	CGG	2	6	4729	4734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016825
66	NC_013722	TGA	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	285016825
67	NC_013722	CGA	2	6	4775	4780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016825
68	NC_013722	TGG	2	6	4799	4804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	285016825
69	NC_013722	GCT	3	9	4850	4858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016825
70	NC_013722	GGC	2	6	4872	4877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016825
71	NC_013722	CAG	2	6	4887	4892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016825
72	NC_013722	GCC	2	6	4908	4913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016825
73	NC_013722	AGC	2	6	4927	4932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016825
74	NC_013722	AAC	2	6	4995	5000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	285016825
75	NC_013722	CGC	2	6	5028	5033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016825
76	NC_013722	CGA	2	6	5081	5086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016825
77	NC_013722	CGA	2	6	5105	5110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016825
78	NC_013722	GGC	2	6	5124	5129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016825
79	NC_013722	TCG	2	6	5140	5145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016825
80	NC_013722	GCG	2	6	5197	5202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016825
81	NC_013722	CAA	2	6	5276	5281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	285016825
82	NC_013722	CAA	2	6	5345	5350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	285016825
83	NC_013722	CGG	2	6	5506	5511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016825
84	NC_013722	TCG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016825
85	NC_013722	CGC	2	6	5643	5648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016825
86	NC_013722	TTG	2	6	5731	5736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	285016825
87	NC_013722	CGA	2	6	5906	5911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016825
88	NC_013722	ACC	2	6	5935	5940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	285016825
89	NC_013722	CAT	4	12	5942	5953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	285016825
90	NC_013722	TGC	2	6	5992	5997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016825
91	NC_013722	CTT	2	6	6002	6007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	285016825
92	NC_013722	GAC	2	6	6108	6113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016825
93	NC_013722	CAG	2	6	6137	6142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016825
94	NC_013722	GCG	2	6	6156	6161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016825
95	NC_013722	GCG	2	6	6175	6180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016825
96	NC_013722	GCC	2	6	6182	6187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016825
97	NC_013722	GTT	2	6	6212	6217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	285016825
98	NC_013722	GCT	2	6	6218	6223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016825
99	NC_013722	CTG	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016825
100	NC_013722	GCC	2	6	6302	6307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016825
101	NC_013722	AGC	2	6	6433	6438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016825
102	NC_013722	GGT	2	6	6491	6496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	285016825
103	NC_013722	GCG	2	6	6517	6522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016825
104	NC_013722	CAA	2	6	6596	6601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	285016825
105	NC_013722	GAA	2	6	6648	6653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	285016825
106	NC_013722	CGC	2	6	6744	6749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016825
107	NC_013722	TTG	2	6	6750	6755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	285016825
108	NC_013722	CGT	2	6	6828	6833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016825
109	NC_013722	GCC	2	6	6992	6997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016826
110	NC_013722	CCG	2	6	7255	7260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016826
111	NC_013722	GCG	2	6	7280	7285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016826
112	NC_013722	CCT	2	6	7312	7317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	285016826
113	NC_013722	GGC	2	6	7322	7327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016826
114	NC_013722	TGG	2	6	7360	7365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	285016826
115	NC_013722	TGT	2	6	7528	7533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	285016826
116	NC_013722	TGC	2	6	7588	7593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016826
117	NC_013722	GCG	2	6	7597	7602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016826
118	NC_013722	CGC	2	6	7745	7750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016826
119	NC_013722	CAA	2	6	7760	7765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	285016826
120	NC_013722	CTC	2	6	7912	7917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	285016827
121	NC_013722	ACC	2	6	7930	7935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	285016827
122	NC_013722	GTG	2	6	7960	7965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	285016827
123	NC_013722	GCA	2	6	7977	7982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016827
124	NC_013722	AGG	2	6	8153	8158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	285016827
125	NC_013722	AGG	2	6	8178	8183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	285016827
126	NC_013722	AAC	2	6	8197	8202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	285016827
127	NC_013722	CAT	2	6	8281	8286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	285016827
128	NC_013722	TGC	2	6	8370	8375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016827
129	NC_013722	ATG	2	6	8530	8535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	285016827
130	NC_013722	CCA	2	6	8554	8559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	285016827
131	NC_013722	AGT	2	6	8653	8658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	285016827
132	NC_013722	TGT	2	6	8869	8874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	285016828
133	NC_013722	CTG	2	6	8877	8882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016828
134	NC_013722	GCT	2	6	8886	8891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016828
135	NC_013722	TGG	2	6	8897	8902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	285016828
136	NC_013722	ACG	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016828
137	NC_013722	CTT	2	6	9028	9033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	285016828
138	NC_013722	GCA	2	6	9043	9048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016828
139	NC_013722	ACA	2	6	9073	9078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	285016828
140	NC_013722	CGC	2	6	9092	9097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016828
141	NC_013722	CGA	2	6	9113	9118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016828
142	NC_013722	GCA	2	6	9227	9232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016828
143	NC_013722	ACA	2	6	9256	9261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	285016828
144	NC_013722	GCA	2	6	9416	9421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016828
145	NC_013722	CGC	2	6	9458	9463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016828
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149	NC_013722	CGA	2	6	9683	9688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016828
150	NC_013722	TCA	2	6	9757	9762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	285016828
151	NC_013722	CTA	3	9	9827	9835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	285016828
152	NC_013722	TGC	2	6	9925	9930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016828
153	NC_013722	AAG	2	6	9993	9998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	285016828
154	NC_013722	GAA	2	6	10002	10007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	285016828
155	NC_013722	GAA	2	6	10010	10015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	285016828
156	NC_013722	ATC	2	6	10017	10022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	285016828
157	NC_013722	AAC	2	6	10192	10197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	285016829
158	NC_013722	CAT	2	6	10253	10258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	285016829
159	NC_013722	TGC	2	6	10303	10308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016829
160	NC_013722	CCG	2	6	10315	10320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016829
161	NC_013722	TGG	2	6	10369	10374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	285016829
162	NC_013722	CGC	2	6	10384	10389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016829
163	NC_013722	CGC	6	18	10396	10413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016829
164	NC_013722	GCC	2	6	10427	10432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016829
165	NC_013722	CCG	2	6	10434	10439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016829
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167	NC_013722	GCC	4	12	10475	10486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016829
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169	NC_013722	GAC	2	6	10524	10529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016829
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172	NC_013722	CCG	2	6	10566	10571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016829
173	NC_013722	TCG	2	6	10599	10604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	285016829
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243	NC_013722	CCA	2	6	15636	15641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	285016836
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249	NC_013722	GCC	2	6	16156	16161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	285016837
250	NC_013722	GAC	2	6	16200	16205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016837
251	NC_013722	CGA	2	6	16217	16222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	285016837
252	NC_013722	CAT	2	6	16283	16288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	285016837
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254	NC_013722	CGG	2	6	16563	16568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	285016837
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