MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013721	TACTT	2	10	3042	3051	20 %	60 %	0 %	20 %	283782523
2	NC_013721	CATGC	2	10	3073	3082	20 %	20 %	20 %	40 %	283782523
3	NC_013721	TGTTT	2	10	4248	4257	0 %	80 %	20 %	0 %	283782524
4	NC_013721	ATTCA	2	10	4539	4548	40 %	40 %	0 %	20 %	283782524
5	NC_013721	AAACC	2	10	7129	7138	60 %	0 %	0 %	40 %	283782525
6	NC_013721	ACAAG	2	10	8203	8212	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013721	ATCCT	2	10	8262	8271	20 %	40 %	0 %	40 %	283782526
8	NC_013721	GCACA	2	10	12645	12654	40 %	0 %	20 %	40 %	283782528
9	NC_013721	TCCAT	2	10	12727	12736	20 %	40 %	0 %	40 %	283782528
10	NC_013721	AAAAG	2	10	19015	19024	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013721	TGCAA	2	10	19202	19211	40 %	20 %	20 %	20 %	283782535
12	NC_013721	CAAAT	2	10	20552	20561	60 %	20 %	0 %	20 %	283782535
13	NC_013721	TTGAT	2	10	22813	22822	20 %	60 %	20 %	0 %	283782536
14	NC_013721	GAAAG	2	10	24561	24570	60 %	0 %	40 %	0 %	283782537
15	NC_013721	CTCAT	2	10	24915	24924	20 %	40 %	0 %	40 %	283782537
16	NC_013721	AAATT	2	10	25485	25494	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013721	GCCAC	2	10	27394	27403	20 %	0 %	20 %	60 %	283782540
18	NC_013721	GCTAT	2	10	28059	28068	20 %	40 %	20 %	20 %	283782540
19	NC_013721	CTTCT	2	10	28663	28672	0 %	60 %	0 %	40 %	283782540
20	NC_013721	TGTTT	2	10	30004	30013	0 %	80 %	20 %	0 %	283782542
21	NC_013721	CAATA	2	10	31282	31291	60 %	20 %	0 %	20 %	283782543
22	NC_013721	AAATA	2	10	32865	32874	80 %	20 %	0 %	0 %	283782545
23	NC_013721	ATTCC	2	10	33978	33987	20 %	40 %	0 %	40 %	283782546
24	NC_013721	CTTTG	2	10	34808	34817	0 %	60 %	20 %	20 %	283782547
25	NC_013721	AACCA	2	10	35172	35181	60 %	0 %	0 %	40 %	283782547
26	NC_013721	CCAAA	2	10	39409	39418	60 %	0 %	0 %	40 %	283782550
27	NC_013721	ATGCC	2	10	40252	40261	20 %	20 %	20 %	40 %	283782550
28	NC_013721	TATTT	2	10	40366	40375	20 %	80 %	0 %	0 %	283782551
29	NC_013721	AATAT	2	10	40627	40636	60 %	40 %	0 %	0 %	283782551
30	NC_013721	AGCGA	2	10	42432	42441	40 %	0 %	40 %	20 %	283782552
31	NC_013721	CAATT	2	10	43912	43921	40 %	40 %	0 %	20 %	283782554
32	NC_013721	ATTAT	2	10	44283	44292	40 %	60 %	0 %	0 %	283782555
33	NC_013721	AAAAG	2	10	44516	44525	80 %	0 %	20 %	0 %	283782555
34	NC_013721	CTTCA	2	10	45635	45644	20 %	40 %	0 %	40 %	283782557
35	NC_013721	TTACC	2	10	45661	45670	20 %	40 %	0 %	40 %	283782557
36	NC_013721	TTGCA	2	10	46721	46730	20 %	40 %	20 %	20 %	283782557
37	NC_013721	AGTTG	2	10	50568	50577	20 %	40 %	40 %	0 %	283782559
38	NC_013721	GTTAA	2	10	51554	51563	40 %	40 %	20 %	0 %	283782560
39	NC_013721	TATTT	2	10	55120	55129	20 %	80 %	0 %	0 %	283782562
40	NC_013721	CATTA	2	10	56111	56120	40 %	40 %	0 %	20 %	283782564
41	NC_013721	ACAGC	2	10	57372	57381	40 %	0 %	20 %	40 %	283782566
42	NC_013721	CAGAT	2	10	59151	59160	40 %	20 %	20 %	20 %	283782568
43	NC_013721	TGGCG	2	10	59559	59568	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013721	AGTTT	2	10	59687	59696	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013721	GCTTG	2	10	60869	60878	0 %	40 %	40 %	20 %	283782569
46	NC_013721	CAATT	2	10	61555	61564	40 %	40 %	0 %	20 %	283782570
47	NC_013721	AAGTT	2	10	64598	64607	40 %	40 %	20 %	0 %	283782572
48	NC_013721	ACTTA	2	10	65001	65010	40 %	40 %	0 %	20 %	283782572
49	NC_013721	TTTTC	2	10	67715	67724	0 %	80 %	0 %	20 %	283782573
50	NC_013721	AGGCA	2	10	68755	68764	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013721	ACGTA	2	10	70488	70497	40 %	20 %	20 %	20 %	283782574
52	NC_013721	GTTAA	2	10	72956	72965	40 %	40 %	20 %	0 %	283782576
53	NC_013721	ATTTT	2	10	73376	73385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013721	CAAAA	2	10	75824	75833	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013721	TAATG	2	10	76902	76911	40 %	40 %	20 %	0 %	283782579
56	NC_013721	ACTCG	2	10	78917	78926	20 %	20 %	20 %	40 %	283782580
57	NC_013721	GCTTT	2	10	80980	80989	0 %	60 %	20 %	20 %	283782582
58	NC_013721	ATGGA	2	10	82062	82071	40 %	20 %	40 %	0 %	283782583
59	NC_013721	TGGAT	2	10	83039	83048	20 %	40 %	40 %	0 %	283782583
60	NC_013721	CTCTG	2	10	83673	83682	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_013721	GTTTT	2	10	86188	86197	0 %	80 %	20 %	0 %	283782586
62	NC_013721	ATGAG	2	10	89757	89766	40 %	20 %	40 %	0 %	283782588
63	NC_013721	AAATC	2	10	91096	91105	60 %	20 %	0 %	20 %	283782589
64	NC_013721	TTTGG	2	10	91295	91304	0 %	60 %	40 %	0 %	283782589
65	NC_013721	ACAAA	2	10	91568	91577	80 %	0 %	0 %	20 %	283782589
66	NC_013721	GCTTG	2	10	93479	93488	0 %	40 %	40 %	20 %	283782591
67	NC_013721	GCATG	2	10	94387	94396	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013721	CAGAA	2	10	94527	94536	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013721	CAACG	2	10	95775	95784	40 %	0 %	20 %	40 %	283782594
70	NC_013721	TCGCT	2	10	95883	95892	0 %	40 %	20 %	40 %	283782594
71	NC_013721	GCGAT	2	10	96328	96337	20 %	20 %	40 %	20 %	283782594
72	NC_013721	ATTGC	2	10	96467	96476	20 %	40 %	20 %	20 %	283782594
73	NC_013721	GCAAT	2	10	97996	98005	40 %	20 %	20 %	20 %	283782595
74	NC_013721	AATAA	2	10	105506	105515	80 %	20 %	0 %	0 %	283782601
75	NC_013721	AAAGG	2	10	106807	106816	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013721	GCTTG	2	10	111662	111671	0 %	40 %	40 %	20 %	283782605
77	NC_013721	AATGA	2	10	112012	112021	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013721	GCTTG	2	10	114965	114974	0 %	40 %	40 %	20 %	283782609
79	NC_013721	AGCAG	2	10	115942	115951	40 %	0 %	40 %	20 %	283782610
80	NC_013721	AAAGT	2	10	116979	116988	60 %	20 %	20 %	0 %	283782610
81	NC_013721	TTCAA	2	10	120328	120337	40 %	40 %	0 %	20 %	283782614
82	NC_013721	TCACA	2	10	123445	123454	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_013721	TTCGC	2	10	126368	126377	0 %	40 %	20 %	40 %	283782619
84	NC_013721	GGTTG	2	10	133484	133493	0 %	40 %	60 %	0 %	283782624
85	NC_013721	ACGAA	2	10	134908	134917	60 %	0 %	20 %	20 %	283782626
86	NC_013721	CTTGG	2	10	135825	135834	0 %	40 %	40 %	20 %	283782627
87	NC_013721	ATCAT	2	10	137681	137690	40 %	40 %	0 %	20 %	283782628
88	NC_013721	TACGG	2	10	138916	138925	20 %	20 %	40 %	20 %	283782631
89	NC_013721	CATGG	2	10	140870	140879	20 %	20 %	40 %	20 %	283782632
90	NC_013721	ATGCA	2	10	141304	141313	40 %	20 %	20 %	20 %	283782632
91	NC_013721	TGCTT	2	10	145492	145501	0 %	60 %	20 %	20 %	283782639
92	NC_013721	GGAAC	2	10	148932	148941	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013721	TGGTA	2	10	149770	149779	20 %	40 %	40 %	0 %	283782641
94	NC_013721	CTTGG	2	10	151396	151405	0 %	40 %	40 %	20 %	283782642
95	NC_013721	GTTTT	2	10	151823	151832	0 %	80 %	20 %	0 %	283782643
96	NC_013721	CGATA	2	10	154016	154025	40 %	20 %	20 %	20 %	283782644
97	NC_013721	ATTGC	2	10	154920	154929	20 %	40 %	20 %	20 %	283782644
98	NC_013721	GTATT	2	10	155376	155385	20 %	60 %	20 %	0 %	283782645
99	NC_013721	TGCAG	2	10	156758	156767	20 %	20 %	40 %	20 %	283782646
100	NC_013721	GAGTC	2	10	157413	157422	20 %	20 %	40 %	20 %	283782646
101	NC_013721	TTTCG	2	10	163939	163948	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_013721	ATTGA	2	10	164011	164020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013721	TTGGC	2	10	165205	165214	0 %	40 %	40 %	20 %	283782653
104	NC_013721	AAGTA	2	10	165867	165876	60 %	20 %	20 %	0 %	283782654
105	NC_013721	AAAAT	2	10	165899	165908	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013721	AGCGC	2	10	166052	166061	20 %	0 %	40 %	40 %	283782655
107	NC_013721	AAGCT	2	10	168059	168068	40 %	20 %	20 %	20 %	283782656
108	NC_013721	CCATT	2	10	170196	170205	20 %	40 %	0 %	40 %	283782658
109	NC_013721	AAACG	2	10	171307	171316	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_013721	CTTAT	2	10	172013	172022	20 %	60 %	0 %	20 %	283782661
111	NC_013721	AACGC	2	10	172419	172428	40 %	0 %	20 %	40 %	283782661
112	NC_013721	GCAAT	2	10	174116	174125	40 %	20 %	20 %	20 %	283782662
113	NC_013721	GTAAA	2	10	175507	175516	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013721	TGCTA	2	10	176930	176939	20 %	40 %	20 %	20 %	283782664
115	NC_013721	TTATA	2	10	177673	177682	40 %	60 %	0 %	0 %	283782665
116	NC_013721	GGCAT	2	10	179228	179237	20 %	20 %	40 %	20 %	283782667
117	NC_013721	TTATT	2	10	179748	179757	20 %	80 %	0 %	0 %	283782668
118	NC_013721	GAGAT	2	10	180177	180186	40 %	20 %	40 %	0 %	283782668
119	NC_013721	TTGGA	2	10	184730	184739	20 %	40 %	40 %	0 %	283782672
120	NC_013721	TGTTT	2	10	186405	186414	0 %	80 %	20 %	0 %	283782674
121	NC_013721	GAAAT	2	10	187353	187362	60 %	20 %	20 %	0 %	283782674
122	NC_013721	TTCAA	2	10	189155	189164	40 %	40 %	0 %	20 %	283782676
123	NC_013721	GTTGC	2	10	191570	191579	0 %	40 %	40 %	20 %	283782680
124	NC_013721	TTTAA	2	10	194324	194333	40 %	60 %	0 %	0 %	283782685
125	NC_013721	TCAGT	2	10	194820	194829	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013721	AATTA	2	10	195030	195039	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013721	GTGTG	2	10	198134	198143	0 %	40 %	60 %	0 %	283782687
128	NC_013721	TGTTT	2	10	198543	198552	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013721	CGTGT	2	10	199506	199515	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_013721	AACAA	2	10	199736	199745	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013721	TTTGA	2	10	200707	200716	20 %	60 %	20 %	0 %	283782690
132	NC_013721	AATGG	2	10	203604	203613	40 %	20 %	40 %	0 %	283782693
133	NC_013721	TCACG	2	10	205505	205514	20 %	20 %	20 %	40 %	283782695
134	NC_013721	CACAA	2	10	207590	207599	60 %	0 %	0 %	40 %	283782696
135	NC_013721	TAACT	2	10	207859	207868	40 %	40 %	0 %	20 %	283782696
136	NC_013721	AAGCT	2	10	207873	207882	40 %	20 %	20 %	20 %	283782696
137	NC_013721	AACGT	2	10	209787	209796	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013721	TCATA	2	10	212397	212406	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_013721	TGTGG	2	10	212476	212485	0 %	40 %	60 %	0 %	283782701
140	NC_013721	CTTGG	2	10	215877	215886	0 %	40 %	40 %	20 %	283782702
141	NC_013721	CAAAA	2	10	216786	216795	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_013721	TGCCT	2	10	216986	216995	0 %	40 %	20 %	40 %	283782703
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150	NC_013721	CTTTG	2	10	233889	233898	0 %	60 %	20 %	20 %	283782717
151	NC_013721	GTAAT	2	10	234699	234708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013721	ATTGG	2	10	235032	235041	20 %	40 %	40 %	0 %	283782718
153	NC_013721	TACGC	2	10	236321	236330	20 %	20 %	20 %	40 %	283782720
154	NC_013721	ATCGC	2	10	237142	237151	20 %	20 %	20 %	40 %	283782720
155	NC_013721	AATAA	2	10	239178	239187	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013721	GCAGA	2	10	241543	241552	40 %	0 %	40 %	20 %	283782723
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158	NC_013721	GATTT	2	10	242546	242555	20 %	60 %	20 %	0 %	283782723
159	NC_013721	TGTGC	2	10	245137	245146	0 %	40 %	40 %	20 %	283782725
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162	NC_013721	TGGGC	2	10	249111	249120	0 %	20 %	60 %	20 %	283782729
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164	NC_013721	TGCTG	2	10	252879	252888	0 %	40 %	40 %	20 %	283782732
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173	NC_013721	ACGTA	2	10	277471	277480	40 %	20 %	20 %	20 %	283782754
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176	NC_013721	AAGCT	2	10	282280	282289	40 %	20 %	20 %	20 %	283782757
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267	NC_013721	TTGGG	2	10	445472	445481	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_013721	TGCAA	2	10	692580	692589	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_013721	TAGCG	2	10	842024	842033	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

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